Để giải quyết đồng thời các yếu tố động lực sóng, dịng chảy, và mực nước, mơ hình CMS-flow có thể kết nối với mơ hình tính sóng CMS-wave. Việc kết kết nối được thực hiện thông qua mô đun điều khiển trong hệ thống SMS. Nhờ khả năng kết nối này mà hai mơ hình có thể trao đổi các dữ liệu cho nhau. Trong khi kết nối, hai mơ hình được đặt trên hai hệ trục toạ độ khác nhau hoặc trùng nhau trong miền tính phụ thuộc vào sự định hướng của đường bờ với hệ trục toạ độ. Hệ thống SMS tự động tính tốn các phép quay cần thiết của các hệ trục toạ độ khi trao đổi các trường kết quả tính giữa hai mơ hình. Thơng qua mơ đun điều khiển, có sáu cách lựa chọn tương tác cho việc kết nối giữa hai mô hình như sau:
+ Trao đổi một chiều: Các građien ứng suất bức xạ và các tham số sóng từ mơ hình CMS-wave cung cấp cho mơ hình CMS-flow.
+ Trao đổi một chiều: Dịng chảy từ mơ hình CMS-flow cung cấp cho mơ
hình CMS-wave..
+ Trao đổi một chiều: Độ sâu tổng cộng và dịng chảy từ mơ hình CMS-flow cung cấp cho mơ hình CMS-wave.
+ Trao đổi hai chiều: Các građien ứng suất bức xạ và tham số sóng từ mơ
hình CMS-wave cung cấp cho mơ hình CMS-flow và dịng chảy, mực nước từ mơ hình CMS-flow cung cấp cho mơ hình CMS-wave.
+ Trao đổi hai chiều: Các građien ứng suất bức xạ và các tham số sóng từ mơ hình CMS-wave cung cấp cho mơ hình CMS-flow và độ sâu tổng cộng từ mơ hình CMS-flow cung cấp cho mơ hình CMS-wave.
+ Trao đổi hai chiều: Các građien ứng suất bức xạ và các tham số sóng từ
mơ hình CMS-wave cung cấp cho mơ hình CMS-flow và độ sâu tổng cộng và dịng chảy từ mơ hình CMS-flow cung cấp cho mơ hình CMS-wave. Đây là dạng trao đổi hai chiều đầy đủ nhất và chúng tôi đã sử dụng dạng này để tính tốn.