Yêu cầu về l−ợng n−ớc sử dụng theo thời gian giữa các ngành kinh tế không giống nhau, tuy nhiên nguồn n−ớc phải đ−ợc lợi dụng tổng hợp do đó th−ờng xẩy ra mâu thuẫn về yêu cầu n−ớc giữa các ngành kinh tế. Những mâu thuẫn này th−ờng chia thành hai loại là mâu thuẫn giữa yêu cầu sinh lợi và yêu cầu trừ hại và mâu thuẫn giữa yêu cầu sinh lợi với nhau. Ví dụ trên một đoạn sông để bảo đảm tiêu úng một cách thuận lợi cho diện tích ở hai phía bờ sông thì mực n−ớc sông phải luôn thấp, nh−ng để thoả mãn yêu cầu lấy n−ớc t−ới thì mực n−ớc sông lại phải t−ơng đối cao, hoặc đối với một biện pháp công trình, ví dụ nh−
hồ chứa làm nhiệm vụ phòng lũ và t−ới để bảo đảm khả năng phòng lũ cho hạ l−u mực n−ớc hồ luôn phải thấp hay nói một cách khác là phải tích n−ớc muộn, nh−ng để bảo đảm an toàn cho t−ới mực n−ớc hồ luôn luôn phải đầy có nghĩa phải tích n−ớc sớm. Đó chính là những mâu thuẫn giữa yêu cầu trừ hại và yêu cầu sinh lợi. Trong tr−ờng hợp các biện pháp lợi dụng tổng hợp nguồn cho những yêu cầu sinh lợi cũng th−ờng xảy ra mâu thuẫn giữa các ngành. Ví dụ nh− khi sử dụng cho vận tải thuỷ thì đoạn kênh dẫn n−ớc luôn phải có mực n−ớc cao và ổn định, nh−ng để đáp ứng yêu cầu t−ới thì mực n−ớc kênh phải thay đổi theo yêu cầu dẫn l−u l−ợng t−ới.
Trong quá trình quy hoạch thuỷ lợi chúng ta phải giải quyết các mâu thuẫn này, dung hoà các yêu cầu về n−ớc giữa các ngành kinh tế, tìm ra các giải pháp hợp lý nhất để khai thác những lợi ích do nguồn n−ớc đem lại và hạn chế tối đa những tác hại do n−ớc gây ra.