Bên cạnh những mặt thuận lợi, việc hình thành và phát triển quỹ đầu t chứng khoán ở Việt Nam cũng gặp không ít khó khăn. Cụ thể là:
- Cơ sở pháp lý cho việc hình thành và phát triển quỹ đầu t cha hoàn chỉnh. Ngành chứng khoán tại Việt Nam hình thành chậm hơn nhiều so với các ngành khác. Vì vậy, khái niệm về chứng khoán và thị trờng chứng khoán dờng nh cha đ- ợc đề cập nhiều trong các bộ luật trớc đây, từ luật dân sự đến luật thơng mại, luật các tổ chức tín dụng... Riêng Công ty quản lý quỹ và quỹ đầu t lại là các đối tợng hoàn toàn mới lạ, cha từng đợc đề cập trong bất kỳ văn bản pháp lý nào trớc đây, ngoài nghị định 48/1998/CP-NĐ về chứng khoán và thị trờng chứng khoán. Vì văn bản điều chỉnh hoạt động của các đối tợng tham gia vào thị trờng chứng khoán nói chung, hoạt động của Công ty quản lý quỹ và quỹ đầu t nói riêng chỉ ở cấp độ nghị định. Do đó, các đối tợng này đồng thời phải chịu sự điều chỉnh của các luật liên quan trong khi các luật này lại cha đa ra các quy định cụ thể và đầy đủ. Điều đó dẫn đến nhiều mâu thuẫn, chồng chéo, không đồng bộ trong hệ thống các văn bản điều chỉnh về các đối tợng tham gia thị trờng. Việc xây dựng bộ luật riêng về chứng khoán và thị trờng chứng khoán sẽ đảm bảo hiệu lực pháp lý cao hơn góp phần ổn định môi trờng pháp lý cho hoạt động của thị trờng cũng nh các định chế
tài chính trung gian nh các định chế tài chính trung gian nh quỹ đầu t Công ty quản lý quỹ.
- Thị trờng chứng khoán hiện tại quy mô còn nhỏ, hàng hoá chứng khoán còn ít: Khối lợng giao dịch trên thị trờng chứng khoán qua các phiên giao dịch còn nhỏ, hàng hoá cha thật phong phú.
Sau 3 năm hoạt động, tổng giá trị chứng khoán niêm yết trên thị trờng chứng khoán Việt Nam hiện nay là gần 6.600 tỷ đồng, bao gồm trên 1000 tỷ đồng cổ phiếu của 21 Công ty niêm yết chiếm khoảng 1,2% GDP. Các loại trái phiếu Chính phủ và trái phiếu ngân hàng đợc niêm yết trên Trung tâm giao dịch chứng khoán thành phố Hồ Chí Minh, trong đó trái phiếu Chính phủ là công cụ quan trọng để huy động vốn cho ngân sách Nhà nớc và cho đầu t phát triển. Tuy nhiên, nhìn lại thực tế hoạt động của thị trờng trái phiếu trong hơn 3 năm vừa qua, các chuyên gia tài chính khong khỏi ái ngại khi mặt hàng trái phiếu chiếm đại đa số trên thị trờng chứng khoán (trên 5.500 tỷ đồng so với hơn 1.000 tỷ đồng cổ phiếu niêm yết), nhng trái phiếu cổ phiếu luôn giao dịch kém sôi động, thị trờng còn trong tình trạng mất cân đối giữa cung và cầu. Với tình trạng nh vậy, nếu quỹ đầu t ra đời thì hoạt động sẽ gặp nhiều khó khăn, bởi lẽ một trong những mục đích chủ yếu của quỹ đầu t là thực hiện đa dạng hoá đầu t, nếu nh các loại chứng khoán còn ít thì khó có thể thực hiện việc lựa chọn chứng khoán để thành lập danh mục đầu t có hiệu quả.
- Thiếu đội ngũ các nhà quản lý đầu t chuyên nghiệp: Đây là một khó khăn rất lớn trong việc hình thành và phát triển quỹ đầu t chứng khoán: Sự thành công hay thất bại của một quỹ đầu t phụ thuộc rất lớn vào trình độ điều hành của các nhà quản lý đầu t chuyên nghiệp. Hiện nay, ở Việt Nam hầu nh cha có đội ngũ các nhà quản lý đầu t chuyên nghiệp đợc đào tạo một cách cơ bản.
- Khó khăn cuối cùng đó là sự hiểu biết của công chúng về quỹ đầu t còn rất nhiều hạn chế: Cho đến nay, sự hiểu biết về thị trờng chứng khoán nói chung đối với công chúng còn nhiều hạn chế và hơn nữa, đối với quỹ đầu t càng hạn chế hơn.
Một khi công chúng cha hiểu rõ cơ chế hoạt động và lợi ích của quỹ thì việc lôi cuốn, thu hút họ tham gia vào quỹ là vấn đề hết sức khó khăn.
Ngoài các yếu tố trên, yếu tố tâm lý ngời đầu t, các tổ chức định mức tín nhiệm cũng là yếu tố quan trọng ảnh hởng tới tình trạng của quỹ đầu t nói chung