Sản xuất nông nghiệp hữu cơ ở Việt Nam tuy mới dừng lại ở dạng mô hình nhưng có trên hầu khắp các tỉnh thành trên cả nước và sản phẩm khá đa dạng phong phú trải rộng từ trồng trọt, chăn nuôi, nuôi trông thủy sản… Điều quan trọng trong thời gian tới phải phát triển thế mạnh của từng vùng và tìm ra sản phẩm trọng điểm. Xây dựng hệ thống phân phối nông nghiệp hữu cơ chuyên biệt cũng là cách để thúc đẩy một nền nông nghiệp hữu cơ theo hướng hàng hóa, đặc biệt cần có sự tham gia của các doanh nghiệp chế biến sâu, đảm bảo nhu cầu của ngày càng lớn của thị trường trong nước, cũng như xuất khẩu. Ngoài ra để đảm bảo chất lượng sản phẩm nông nghiệp hữu cơ cũng cần có hệ thống chứng nhận, giám sát nông nghiệp hữu cơ chặt chẽ - điều Việt Nam đang thiếu.
Sản xuất thủy sản hữu cơ ở Việt Nam đang là một bước phát triển tiềm năng đối với sản xuất nông nghiệp hữu cơ nói chung và đặc biệt đối với ngành thủy sản nói riêng. Tuy nhiên, với những yêu cầu và đòi hỏi khắt khe cũng như các tiêu chuẩn, quy định chứng nhận thủy sản hữu cơ thì việc phát triển thủy sản hữu cơ gặp rất nhiều khó khăn và cần được quan tâm chú trọng hơn. Các tiêu chuẩn, quy định về thủy sản hữu cơ của Việt Nam còn hạn chế, chưa theo kịp với sự phát triển của xã hội. Vì vậy nhà nước và ngành thủy sản cần chú trọng phát triển thủy sản hữu cơ, nâng cao năng suất thủy sản cũng như quảng bá rộng rãi đến nông dân về quy trình nuôi trồng thủy sản hữu cơ cũng như cách chứng nhận sản phẩm của họ là sản phẩm hữu cơ.