Cơ hoạt động cũng tạo ra một số điện áp có thể được đo bởi điện cực dưới da và nó có thể gây nên những tín hiệu nhiễu làm nhiễu tín hiệu EOG. Mắt chuyển động
ngang bao gồm những chuyển động cơ bản của nhãn cầu, do đó điện thế võng giác mạc đo được gần như là chính xác. Kích hoạt của cơ theo phương ngang thì ảnh hưởng ít ở da. Tuy nhiên, sự chuyển động của mắt theo phương dọc sẽ chịu ảnh hưởng của sự chuyển động của mý mắt rất nhiều. Do đó đo điện thế ở da sẽ không
sử dụng phương pháp đo sự chuyển động của mắt theo phương dọc. Tuy thế nghiên cứu sự chuyển động theo chiều dọc của mắt cũng rất quan trọng để đưa ra những
thông tin về chớp mắt và sự chuyển động của mý mắt. Hiện tượng chớp mắt sẽ gây
nhiễu các tín hiệu chuyển động của mắt theo chiều ngang cũng như theo chiều dọc, do đó ghi nhận những tín hiệu này với điện cực được định hướng theo chiều dọc cho
phép nhận dạng và loại bỏ những chuyển động chớp mắt hay chuyển động theo
một cách cẩn thận thì ghi nhận theo phương ngang có thể tránh được những tác động của ghi nhận theo phương dọc, nhưng sự ảnh hưởng qua lại là khó tránh khỏi và đồng thời những thông tin ghi nhận theo phương dọc có thể góp phần làm rõ hơn
thông tin.
Tín hiệu EOG thu nhận được rất hữu dụng trong việc nghiên cứu chuyển động
của mắt. Một ứng dụng đặc biệt của EOG là trong việc đo lường chứng giật cầu mắt,
là biểu hiện của những chuyển động nhỏ của mắt. Tín hiệu thu được gọi là điện rung
nhãn cầu ký. Nó phụ thuộc cả vào hệ thống thị giác và hệ thống tiền đình và cung cấp thông tin lâm sàng hữu ích liên quan đến mỗi hệ thống trên. Một số thông tin
chi tiết liên quan đến EOG, vì nó liên quan đến chuyển động của mắt, bao gồm cả
chứng giật nhãn cầu mắt, được nói tới trong các phần sau.