1. Trước khi chào cờ:
- Trước khi chào cờ khoảng 15 phút, Trưởng Trực ra lệnh cho Đội Trực rước cờ và buộc sẵn ở kỳ đài (xem thêm về phần rước cờ và treo cờ).
- Cờ đã được buộc sẵn vào dây (phải kiểm soát trước cẩn thận, không rối hay xoắn chéo nhau).
- Đến giờ chào cờ, Trưởng Trực tập họp Đoàn Sinh hình chữ U trước cột cờ.
- Những Đoàn Sinh kéo cờ được chỉ định trước, Trưởng Trực mời những em kéo cờ tiến lên phía cột cờ, cách khoảng 3 bước dừng lại, quay vào trong chào nhau và cùng quay lên chào cờ rồi tiến lên, đứng đối diện nhau, mỗi người cầm 1 đầu dây.
- Được kéo cờ là một vinh dự, nên chọn những em kéo cờ đã tuyên hứa hay là đội viên của đội đang giữ cờ danh dự hoặc đội trực ngày đó. Các em này y phục phải chỉnh tề ngay ngắn.
- Trưởng Trực cho Đoàn Sinh chỉnh đốn đồng phục, sau khi kiểm soát lần chót về y phục và hàng ngũ của Đoàn thì ra thủ hiệu cho Đoàn Sinh đứng thế nghỉ đoạn bước ra chào và mời Cha Tuyên Úy, Thầy/Sơ Trợ Úy, Đoàn Trưởng, hay Sa Mạc Trưởng và Quan Khách bằng cách: Đứng chào cách khoảng 3 bước xong nói “Đoàn đã tập họp xong, kính mời ... vào dự lễ chào cờ” (Nếu có các Trưởng cao cấp khác thì chính Xứ Đoàn Trưởng lúc đó sẽ mời tất cả cùng vào).
2. Diễn tiến chào cờ:
- Trưởng Trực về vị trí của mình, phối hợp cùng một lúc thủ lệnh và khẩu lệnh, hô THIẾU NHI (Huynh Trưởng...) tất cả đáp lại “HY SINH” (Phụng Sự…) và đứng vào thế nghiêm (không hô một khẩu hiệu nào khác).
- Trưởng Trực hô “chuẩn bị Chào ... Chào”! Cho tất cả Đoàn Sinh chào Quan Khách. Chờ chào lại xong Trưởng Trực hô THÔI, tất cả bỏ tay xuống.
- Sau đó, Trưởng Trực nói tiếp “xin mời Cha Tuyên Úy, quý Trợ Úy, quý Trưởng và … hướng về phía cột cờ để làm lễ chào cờ”.
- Trưởng Trực hô tiếp “CHÀO CỜ ... CHÀO”. Tất cả hướng về phía cờ, chào cho tới khi cờ được thượng lên tới đỉnh cột cờ. Trưởng hô “THÔI” mọi người hạ tay xuống. Liền đó Trưởng Trực bắt giọng lời cuối bài
Thiếu Nhi Tân Hành Ca (tuổi trẻ Việt Nam đem Chúa cho giới trẻ Việt Nam). Tất cả cùng hát “Thiếu Nhi Việt Nam đứng lên trong giai đoạn mới...”.
- Trong khi đó những người kéo cờ vẫn đứng thế nghiêm tay cầm dây cờ.
- Hát xong, Trưởng Trực nói: “Lễ chào cờ chấm dứt, xin mời…hướng về phía Đoàn Sinh”.
- Lúc này, người kéo cờ buộc dây vào cột cờ. Đoạn lui về phía sau 2 bước đứng nghiêm cùng chào nhau rồi đi vòng bên ngoài trở về vị trí của mình.
3. Sau khi chào cờ:
- Câu chuyện dưới cờ: Thông thường do Cha Tuyên Úy, Thầy/Sơ Trợ Úy, Sa Mạc Trưởng, Đoàn Trưởng hoặc quan khách đặc biệt.
- Trưởng Trực nói tiếp “Sau đây là câu chuyện dưới cờ của Cha Tuyên Úy…, chúng con kính mời Cha ...”. Nếu có người cao cấp hơn mình, người nói câu chuyện dưới cờ bước lên 3 bước, quay lại chào người cao cấp đó (cả hàng Trưởng và Quan Khách phải chào lại), rồi quay lại đứng đối diện Đoàn Sinh.
- Trưởng Trực hô “chuẩn bị Chào…Chào” cho Đoàn Sinh chào người nói câu chuyện dưới cờ (chỉ có Đoàn Sinh chào mà thôi, hàng Trưởng & Quan Khách không phải chào).
- Nếu người nói câu chuyện là người cao cấp nhất, người đó chỉ bước lên 3 bước, và Trưởng Trực hô “chuẩn bị Chào … Chào” cho Đoàn Sinh chào ngay (chỉ có Đoàn Sinh chào mà thôi, hàng Trưởng và Quan Khách không phải chào).
- Khi bắt đầu câu chuyện dưới cờ, Trưởng Trực ra thủ lệnh cho Đoàn Sinh đứng thế nghỉ.
- Câu chuyện dưới cờ nên xoáy mạnh vào chủ đề sinh hoạt của ngày hôm đó, cần ngắn gọn không rườm rà và không quá 5 phút. Khi vừa dứt câu chuyện dưới cờ, các Đoàn Sinh sẽ vỗ tay.
- Trưởng Trực ra thủ lệnh về thế nghiêm, sau đó hô “chuẩn bị Chào…Chào”. Cho Đoàn Sinh chào người nói câu chuyện dưới cờ (hàng Trưởng và Quan Khách không phải chào). Người nói câu chuyện dưới cờ chào lại. - Nếu có người cao cấp hơn mình, người nói câu chuyện dưới cờ quay lại và chào trước khi về chỗ (hàng Trưởng và Quan Khách phải chào lại). Nếu không có người cao cấp hơn mình, người nói câu chuyện dưới cờ chỉ quay lại và bước về chỗ.
- Ngay sau đó, Trưởng Trực bước ra cho một băng reo hay bài hát hợp với ý lực của câu chuyện dưới cờ (cũng cần ngắn gọn và được chuẩn bị kỹ lưỡng).
- Nếu có khen thưởng, nên bắt đầu ngay. 4. Bế mạc nghi lễ:
- Trưởng Trực nói vài lời ngắn gọn cám ơn, chẳng hạn “ buổi lễ chào cờ đến đây là chấm dứt, xin cám ơn Cha, quý Trợ Úy và quý Trưởng…” rồi cho Đoàn Sinh về thế nghỉ, hô khẩu hiệu Thiếu Nhi - tất cả đáp Hy Sinh! đồng thời đứng về thế nghiêm (hoặc có thể dùng một khẩu hiệu khác như tên Sa Mạc, Đại Hội, Ngành…tùy trường hợp).
- Trưởng Trực hô “chuẩn bị Chào…Chào” cho tất cả Đoàn Sinh chào tiễn hàng Trưởng và Quan Khách. - Sau đó, Trưởng Trực nhắc nhở các em những điều cần thiết rồi cho giải tán.