Điều 12 “chỉ được thực hiện 01 lần đối với mỗi nhiệm vụ. Thời gian gia hạn không quá 12 tháng đối với các nhiệm vụ có thời gian thực hiện trên 24 tháng và không quá 06 tháng đối với nhiệm vụ có thời gian thực hiện không quá 24 tháng”. Quy định như trên có một số bất cập như sau:
Không giống như các dự án nghiên cứu, sản xuất thử nghiệm, dự án thuộc Chương trình kể từ khi xây dựng, phê duyệt và đưa vào triển khai thực hiện phụ thuộc vào rất nhiều các đơn vị liên quan như đơn vị quản lý, đơn vị chủ trì, đơn vị chuyển giao, các hộ dân tham gia dự án; vướng mắc trong công tác giải phóng mặt bằng, huy động nguồn nhân lực, biến động của thị trường. Ngoài ra, đối với những dự án có tính chất mùa vụ thì việc chậm thực hiện một khâu nào đó dù chỉ một vài tháng cũng có thể kéo theo chậm tiến độ của cả dự án từ 6 tháng đến 1 năm
Thành phần kiểm tra: việc quy định bắt buộc về thành phần, số lượng thành viên tham gia đoàn kiểm tra đối với các dự án do Trung ương quản lý là không cần thiết và gây khó khăn cho công tác tổ chức kiểm tra dự án do các Vụ chức năng có số lượng người ít nhưng phải quản lý nhiều mảng công việc khác nhau nên khó bố trí tham gia theo kế hoạch. Bên cạnh đó công nghệ áp dụng cho các dự án là công nghệ đã được nghiên cứu, ứng dụng và các nội dung chi tiết của dự án đã được phê duyệt cụ thể trong thuyết minh nên không đòi hỏi các thành viên đoàn kiểm tra phải có trình độ cao mới có thể kiểm tra, giám sát được
Ngoài ra thì do cơ chế bắt buộc về thành phần và số lượng thành viên đoàn kiểm tra nói trên nên trong một số trường hợp cần thiết không thể ủy quyền cho Sở KHCN tổ chức kiểm tra để làm căn cứ cấp tiếp kinh phí cho dự án ảnh hưởng đến tiến độ của dự án
Đề nghị các đơn vị chức năng đồng thuận, phối hợp với Văn phòng NTMN trình Lãnh đạo Bộ đề nghị Thủ tướng Chính phủ cho phép xử lý tài sản theo hướng giao không bồi hoàn cho Tổ chức chủ trì dự án theo đúng tinh thần QĐ 1747/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ.
Đề nghị các địa phương xây dựng cơ chế để duy trì, nhân rộng kết quả của dự án
Đề nghị các đơn vị chức năng góp ý, tư vấn các biện pháp thu hồi kinh phí phải hoàn trả của các dự án.
Đề nghị các địa phương đẩy nhanh tiến độ phê duyệt và bố trí đủ kinh phí theo quy định để đảm bảo tiến độ triển khai các dự án Ủy quyền ĐP
Điều chỉnh một số quy định của Thông tư 04: 04: