Giống như điều trị viêm phổi cộâng đồng, điều trị khởi đầu của viêm phổi trong bệnh viện cũng là điều trị phỏng chừng. Việc điều trị phỏng chừng này dưạ trên cơ sở
* Quyết định điều trị căn cứ vào tiêu chuẩn lâm sàng. Chẩn đoán lâm sàng căn cứ vào sự hiện diện của 1 thâm nhiễm mới xuất hiện hoặc diễn tiến tăng dần trên phim X - quang cộng với 2 trong các triệu chứng: sốt, bạch cầu tăng, đàm mủ.
Có tác giả đề nghị dùng thang điểm sử dụng 6 tiêu chuẩn: sốt, số lượng bạch cầu, dịch tiết khí phế quản, tính chất đàm, X - quang phổi và oxy máu. Mặc dù các tiêu chuẩn về lâm sàng không đặc hiệu để chẩn đoán viêm phổi cộng đồng nhưng chúng đủ nhạy để quyết định điều trị. Nếu chỉ căn cứ vào các tiêu chuẩn vi trùng học, các biểu hiện sớm của viêm phổi cộng đồng có thể bị bỏ qua và điều trị chậm trễ.
* Người ta có thể dựa trên 1 số nguyên tắc chung để ước đoán chủng vi trùng gây bệnh và chọn lựa kháng sinh, căn cứ trên mức độ trầm trọng của bệnh, có hay không có các yếu tố nguy cơ và thời gian từ lúc nhập viện đến lúc khởi bệnh.
* Việc chọn lưạ kháng sinh còn phải tùy thuọc vào tần suất vi trùng thường gặp ở địa phương, bệnh viện hay khoa, tùy thuọc vào khả năng kháng thuốc của các chủng vi trùng cũng như vào tình trạng bệnh nhân có hay không có các bệnh lý phổi khác đi kèm như bệnh phổi tắc nghẽn mãn tính, giãn phế quản, xơ nang phổi …
* Đối với các trường hợp suy giảm miễn dịch như nhiễm HIV, ghép cơ quan, giảm bạch cầu hạt, bệnh máu ác tính, sử dụng corticoid liều cao…, việc điều trị cần lưu ý đến bản chất sự mất sức đề kháng cơ thể, thời gian đã bị suy giảm miễn dịch, các điều trị để nâng sức đề kháng cơ thể và các bệnh lý đi kèm.