Xử lý thống kờ số liệu và tớnh tần suất cỏc locus gen

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen ở 15 locus gen bằng hệ identifiler từ quần thể người dân tộc nùng ứng dụng trong giám định ADN​ (Trang 30 - 32)

2.2.2.1. Cơ sở lý thuyờ́t

Đờ̉ sụ́ liờ ̣u nghiờn cứu vờ̀ các locus gen sử du ̣ng được cho những ứng du ̣ng cụ thể, điờ̀u cõ̀n thiờ́t đõ̀u tiờn là cần đỏnh giỏ xem mẫu n ghiờn cứu với locus gen được phõn tích có đảm bảo rằng cṍu trúc di truyờ̀n của mõ̃u (tõ̀n sụ́ tương đụ́i của các alen và tõ̀n sụ́ các kiờ̉u gen ) là ổn định hay khụng qua cỏc thế hệ , nghĩa là mẫu cú tuõn theo định luật Hardy - Weinberg hay khụng ?[2, 7, 36]

Do đó cõ̀n kiờ̉m tra sự phù hợp giữa mõ̃u với quõ̀n thờ̉ cõn bằng lý thuyờ́t thụng qua đánh giá chờnh lờ ̣ch giữa tõ̀n sụ́ quan sát thực tờ́ với phõn bụ́ lý thuyờ́t của các kiờ̉u gen của mụ̃i locus gen được ng hiờn cứu có sai khác nhau hay khụng? [4, 36]

2.2.2.2. Phương phá p xử lý thụ́ng kờ

Kiờ̉m đi ̣nh sự phù hợp phõn bụ́ tõ̀n sụ́ kiờ̉u gen giữa mõ̃u khảo sỏt và quõ̀n thờ̉ lý thuyờ́t dựa vào tiờu chuõ̉n Khi bỡnh phương 2

[13, 36].

Đỏnh giỏ sự phự hợp giữa số liệu thực nghiệm và giả thuyờ́t lý thuyết theo phương phỏp kiểm định 2

ta dựng chỉ số sau để tớnh 2

thực tế (2 TT):

(2.1) Trong đú : * k là số lớp của dóy số liệu thực nghiệm.

* nij là số kiểu gen AiAj quan sỏt được trong một locus gen. * Eij là số kiểu gen AiAj tớnh toỏn theo lý thuyết.

Eij = npi 2

nếu i=j, Eij = 2npipj nếu i ≠ j Tra giỏ trị 2

lý thuyết (2

k(k-1)/2 (2.2) Quy tắc kiểm định 2

là trong một locus gen số lượng kiểu gen quan sỏt dưới 5, thỡ phải kết hợp cỏc alen bờn cạnh để tăng số lượng quan sỏt cao hơn 5 để tớnh toỏn.

2.2.2.3. Cỏc bước tớnh toỏn thống kờ và kiểm định

- 120 kiểu gen cða 120 cá thể người Nùng được thống kê tần số kiểu gen, tần số alen.

- Tớnh tần suất cỏc alen của mỗi locus theo số liệu thu được trong nghiờn cứu. - Xỏc định số kiểu gen thực tờ́ của mõ̃u khảo sỏt (số lượng kiểu gen AiAj cho từng locus ).

- Xỏc định số ki ểu gen lý thuyết Eij (số lượng kiểu gen AiAj cho từng locus được giả thiết tuõn theo định luật Hardy - Weinberg).

- Tớnh chỉ số kiểm định 2

theo cụng thức.

- Xỏc định khi bình phương tiờu chuõ̉n (α) theo mứ c xác suṍt p =0.05 (tra bảng).

- So sánh giá t rị khi bỡnh phương tớnh được với khi bỡnh phương tiờu chuõ̉n: Nờ́u khi bình phương tính được nhỏ hơn 2

tiờu chuõ̉n thì phõn bụ́ thực tờ́ phù hợp với phõn phụ́i lý thuyờ́t , nghĩa là mẫu phự hợp với quần thể lý thuyờ́t [7, 8, 11, 13].

- Cỏc số liệu thống kờ và tớnh toỏn trờn phần mềm Microsoft Office Excel 2003.

Trong chương II luận văn trỡnh bày cỏc bước thu thập và bảo quản mẫu đỳng với qui trỡnh tiờn tiến tại cỏc phũng thớ nghiệm giỏm định ADN của cỏc nước trờn thế giới. Cựng với đú là qui trỡnh giỏm định ADN của Viện Khoa học hỡnh sự đó được chuẩn húa theo quy định tại Điều 42, khoản 2, mục b Luật Giỏm định tư phỏp 2012.

Sử dụng phương phỏp thống kờ phổ biến trong nghiờn cứu Sinh học, do quần thể nghiờn cứu lớn nờn chọn phương phỏp kiểm định 2

là phự hợp.

Chƣơng 3

KẾT QUẢ NGHIấN CỨU VÀ BÀN LUẬN

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen ở 15 locus gen bằng hệ identifiler từ quần thể người dân tộc nùng ứng dụng trong giám định ADN​ (Trang 30 - 32)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(70 trang)