Tuy có được nhiều thuận lợi và cũng đã có rất nhiều sự cố gắng, nhưng trong công ty vẫn còn tồn tại nhiều vấn đề hạn chế:
+ Quảng cáo là ngành đòi hỏi nhân lực phải có tính sáng tạo, kỹ thuật cao nhưng trình độ chuyên nghiệp và vấn đề nhân sự đang là vấn đề lớn của quảng cáo của Việt Nam nói chung và của công ty Quang Trung nói riêng. Việc phát triển và quản lý nhân sự của công ty nói chung là chưa đạt yêu cầu. Những người có kinh nghiệm thì luôn nhìn ra hướng khác như mức lương bổng, tìm kiếm một cơ hội tốt hơn… Những bạn trẻ có nhiệt huyết, năng động thì kinh nghiệm lại chưa có nhiều…cho nên việc phát triển nhân sự là rất cần thiết.
+ Tổ chức triển khai kế hoạch cho mỗi chiến dịch quảng cáo còn rời rạc, chưa thống nhất. Các hình thức quảng cáo còn đơn giản, chưa phong phú đa dạng. Thiết kế quảng cáo cũng đơn giản, chất liệu của những tấm biển quảng cáo không thật sự tốt, tính thuyết phục chưa cao. Chính vì vậy mà dịch vụ của công ty chưa được phong phú, chưa tạo được Ên tượng tốt với nhiều khách hàng khó tính.
+ Hiện nay nhiều công ty quảng cáo của nước ngoài đổ vào Việt Nam với những công nghệ tiên tiến, trình độ cao, cạnh tranh gay gắt đang là bất lợi lớn đối với những doanh nghiệp kinh doanh dịch vụ quảng cáo ở Việt Nam nói chung và với công ty Quang Trung nói riêng.
+ Trong việc tìm kiếm và tiếp cận khách hàng, công ty cũng chưa chủ động, cơ chế thu hút khách hàng còn chưa tốt. Công ty cũng lập website riêng nhưng còn sơ sài, chưa truyền tài được nhiều thông tin tới khách hàng.