Trải qua những giai đoạn thăng trầm của lịch sử, quá trình hình thành và phát triển của ngành, Tòa án nhân dân thị xã Phú Thọ gắn liền với lịch sử xây dựng và hoàn thiện của Tòa án nhân dân tỉnh Phú Thọ nói riêng và hệ thống Tòa án nước nhà nói chung. Toà án nhân dân thị xã Phú Thọ được thành lập từ năm 1946, mặc dù còn gặp nhiều khó khăn về tổ chức, về cơ sở vật chất đảm bảo công tác. Song dưới sự chỉ đạo của Toà án nhân dân tỉnh; Thường trực Thị uỷ; Thường trực Hội đồng nhân dân thị xã, cùng với truyền thống quý báu của Toà án nhân dân Việt Nam. Toà án nhân dân thị xã Phú Thọ với tinh thần trách nhiệm đoàn kết triển khai thực hiện thắng lợi nhiệm vụ quan trọng mà Đảng, Nhà nước, nhân dân tin tưởng giao phó "Là người cầm cán cân công lý".
Tại tỉnh Phú Thọ hiện nay, cơ cấu tổ chức của TAND hai cấp hiện tại có 14 đơn vị gồm: TAND tỉnh và 13 TAND các huyện, thị xã, thành phố, trong đó có TAND thị xã Phú Thọ với tổng số 12 biên chế. Trong đó có 04 Thẩm phán, 03 Thư ký, 01 Thẩm tra viên, 01 Chuyên viên, 01 kế toán và 02 cán bộ hợp đồng 68. Đội ngũ lãnh đạo, quản lý có lập trường chính trị vững vàng, được đào tạo cơ bản về chuyên môn, nghiệp vụ, có tinh thần trách nhiệm cao trong công tác. Trong công tác tổ chức cán bộ, TAND thị xã không ngừng củng cố bộ máy bố trí cán bộ quản lý, đào tạo chính trị, chuyên môn nghiệp vụ, nhằm xây dựng người cán bộ làm công tác pháp luật phải vừa hồng
vừa chuyên. Đến nay, 91.7% cán bộ, công chức làm nghiệp vụ có trình độ Cử nhân luật (trong đó 02 đồng chí có trình độ Thạc sỹ Luật, 03 đồng chí có trình độ cao cấp lý luận chính trị, 06 đồng chí có trình độ trung cấp chính trị).
Cùng với diễn biến ngày càng phức tạp của nhiều loại tội phạm và các vụ tranh chấp dân sự, Tòa án nhân dân (TAND) thị xã Phú Thọ mang trên mình trách nhiệm nặng nề. Là đơn vị thụ lý số lượng án bình quân của từng Thẩm phán giải quyết đứng thứ 03 trong số 13 huyện, thị xã, thành phố thuộc tỉnh, TAND thị xã Phú Thọ có số án phải giải quyết tăng trung bình từ 40 - 50 vụ/năm. Nhưng với tinh thần trách nhiệm, bản lĩnh trí tuệ và sự tận tụy của tập thể, TAND thị xã luôn hoàn thành tốt nhiệm vụ được giao, kịp thời đưa ra xét xử các vụ án lớn, không để xảy ra trường hợp oan sai, bỏ lọt tội phạm, góp phần vào sự bình yên của địa phương trong thời gian qua.
Hoạt động xét xử sơ thẩm các vụ án hình sự tại TAND thị xã Phú Thọ nói riêng và TAND cấp huyện nói chung có một số đặc điểm riêng như sau:
Bị cáo bị truy tố và xét xử về các tội phạm có hình phạt ở mức độ nghiêm khắc nhất nên đặt ra yêu cầu cần phải bảo vệ quyền cho bị cáo tốt nhất, hạn chế oan, sai.
Ở một số vụ án hình sự bị cáo được hưởng một số quyền nhất định mà theo quy định của pháp luật Tòa án phải đáp ứng như bị cáo là người chưa thành niên phải có người đại diện tại phiên tòa.
Tùy theo tình hình tội phạm, yêu cầu đấu tranh phòng chống tội phạm của địa phương trong những thời điểm nhất định mà vụ án sơ thẩm hình sự phải được giải quyết tại TAND cấp huyện. Tuy nhiên khi đưa vụ án hình sự ra xét xử sơ thẩm ở TAND cấp huyện, ở một số địa phương, bị cáo, người làm chứng, người đại diện quyền lợi ích hợp pháp cho bị cáo, người giám hộ sống ở vùng sâu, vùng xa gặp khó khăn khi di chuyển, hay khó khăn trong việc nhận các quyết định tố tụng… Do vậy, TAND cấp huyện và các cơ quan hữu quan phải chuẩn bị những điều kiện tốt nhất để bảo đảm quyền của bị cáo.
Được sự quan tâm của Tòa án nhân dân tỉnh và chính quyền địa phương, trụ sở của TAND thị xã đã được đầu tư nâng cấp từ năm 2011 và được trang bị đầy đủ thiết bị kỹ thuật, hệ thống máy vi tính cơ bản phục vụ tốt nhu cầu của nhiệm vụ trong tình hình mới. Những thành tích của TAND thị xã Phú Thọ đã được ghi nhận thông qua: Bằng khen của các cấp, các ngành, Cờ thi đua của UBND thị xã Phú Thọ, UBND tỉnh Phú Thọ, danh hiệu Tập thể lao động xuất sắc trong nhiều năm liền,..Trong thời gian tới, TAND thị xã sẽ tiếp tục đóng góp cho sự nghiệp xây dựng nền tư pháp trong sạch, nghiêm minh, bảo vệ công lý, bảo vệ quyền con người và lợi ích của Nhà nước.
Phát huy truyền thống của quê hương đất Tổ và của hệ thống Tòa án nhân dân, trong thời gian tới TAND thị xã Phú Thọ tiếp tục phấn đấu xây dựng ngành ngày càng vững mạnh, thực hiện có hiệu quả nhiệm vụ chính trị trọng tâm mà Đảng và Nhà nước đã giao cho.