Từ lâu, vi tảo biển được nghiên cứu rộng rãi do có thành phần dinh dưỡng cao. Vi tảo cũng sử dụng ánh sáng mặt trời để thực hiện quá trình quang hợp tạo ra chất hữu cơ nhưng nó hoạt động hiệu quả hơn thực vật. Năm 1703 là năm khởi đầu cho việc nghiên cứu tảo silic trên thế giới. Các nghiên cứu dần được triển khai sâu rộng
tiếp theo vào thế kỷ XIX. Năm 1999, vi tảo Entomoneis vertebralis được định danh,
phân lập ở môi trường có nồng độ muối cao và các đặc điểm hình thái, sinh thái học của loài này cũng đã được nghiên cứu bởi Ester Clavero và cộng sự [29]. Năm 2013,
Danny C. Reinke và cộng sự đã phân lập, định danh Entomoneis reimeri bằng
phương pháp quan sát hình thái dưới kính hiển vi điện tử quét do các loài tảo silic
đặc thù bởi các rãnh và hoa vân trên vỏ. Tảo silic Entomoneis reimeri sp. nov., được
phân biệt với các loài Entomoneis khác bởi số lượng vân, thiếu các điểm nối và các
cấu trúc vi mô của mặt vân [30]. Năm 2016, Lijuan He và cộng sự đã phân lập và
nhận dạng tảo silic Entomoneis sp. MMOGRB 0374S. Loài này được phân biệt với
các loài Entomoneis khác bởi kích thước nhỏ hơn, các vân dày đặc hơn và có 94%
trình tự nucleotide tương đồng. Sinh khối đạt đến 182 mg/ L ở pha cân bằng và 229 mg/ L sau 3 ngày nuôi cấy giới hạn nitơ. Lipid được chiết xuất bằng bốn phương pháp và phương pháp dichloromethane/ metanol là hiệu quả nhất, mang lại 36% sinh khối khô ở pha cân bằng và 40% sau 3 ngày nuôi cấy không có nitơ. Hàm lượng
arachidonic acid chiếm từ 16% đến 19% tổng lượng axit béo [4]. Năm 2018,
Adriati dựa vào đặc điểm hình thái (tế bào rất nhỏ, chiều dài vỏ 16 - 21 μm, chiều rộng vỏ 5 - 20 μm, vân hình bầu dục rộng,…) và di truyền phân tử (sử dụng một gen trong nhân SSU và hai gen trong lục lạp rbcL, psbC) [24].
Ở Việt Nam, vi tảo chủ yếu được nghiên cứu về sự phân bố và phân loại. Vào năm 1926, Maurice Rose là người đầu tiên nghiên cứu về sinh vật phù du ở vùng biển Việt Nam. Ông công bố danh mục gồm 13 chi, 20 loài tảo ở vịnh Nha Trang.
Từ năm 1959-1985 đã có gần 100 chuyến khảo sát trên các tàu nghiên cứu ở Việt Nam, Trung Quốc và Liên Xô tại vịnh Bắc Bộ, vùng biển Trung bộ, Đông và Tây bộ. Những chương trình hợp tác này cũng đã xác định trên 200 loài tảo silic. Năm 1993, Trương Ngọc An đã phân loại tảo silic phù du ở biển Việt Nam với 481 loài thuộc 4 ngành và đã mô tả 225 loài tảo silic trong 2 bộ, 7 bộ phụ, 18 họ, 60 chi. Mỗi loài đều được mô tả các đặc điểm rõ ràng, dễ hiểu và có các hình vẽ hoặc ảnh chụp do chính tác giả thực hiện từ các mẫu quan sát, khiến cho những người mới bước vào phân loại tảo có thể nhanh chóng phân biệt, nhận biết được thành phần tảo silic, sự khác biệt giữa các chi điển hình rất thuận lợi trong nghiên cứu sinh vật phù du [1].
Vào năm 1996, Đặng Thị Sy đã định danh được 377 taxon (gồm 307 loài, 54 thứ và 16 taxa mới dừng ở bậc chi) thuộc 65 chi, 19 họ, 3 phân bộ, 6 bộ, 2 lớp Tảo silic. Lớp Tảo silic trung tâm có 4 bộ, 12 họ, 33 chi, 173 loài, 24 thứ và 10 taxa mới dừng ở tên chi. Lớp Tảo silic lông chim có 2 bộ, 3 phân bộ, 7 họ, 32 chi, 134 loài, 30 thứ và 6 taxa mới dừng ở tên chi [31]. Tiếp theo năm 2003, Nguyễn Văn Tuyên đã nghiên cứu về độ đa dạng của tảo trong thủy vực nội địa Việt Nam và phát hiện được 411 loài tảo silic [32]. Năm 2007, Lương Quang Đốc đã nghiên cứu tảo silic sống trên nền đáy mềm và một số đặc điểm sinh thái của chúng ở vùng đầm phá ven biển tỉnh Thừa Thiên Huế [2]. Đến năm 2009, Nguyễn Thị Gia Hằng và cộng sự đã ghi nhận được 348 taxa khuê tảo bám trong đó có 100 taxa thuộc bộ Trung tâm (Centrales) và 238 taxa thuộc bộ Lông chim (Pennales) trong hệ sinh thái rừng ngập mặn tại Khu dự trữ sinh quyển Cần Giờ, Thành phố Hồ Chí Minh. Kết quả phân tích cho thấy có sự khác biệt quan trọng trong độ giàu và thành phần loài giữa hai loại đài vật (mặt bùn và mặt rễ cây ngập mặn) và giữa các môi trường rừng ngập mặn khác nhau [33]. Tiếp đến năm 2012, Mai Viết Văn đã nghiên cứu về sinh vật phù du vùng
ven biển tỉnh Sóc Trăng và Bạc Liêu. Kết quả xác định được 232 loài thực vật phù du thuộc 72 giống của 5 ngành tảo phân bố ở vùng nghiên cứu. Trong đó, ngành tảo silic có số loài nhiều nhất với 176 loài (chiếm 75,86% tổng số loài) chiếm ưu thế ở cả hai mùa. Vào năm 2014, Nguyễn Thị Gia Hằng đã nghiên cứu về đa dạng tảo silic ở rừng ngập mặn Cần Giờ và vùng ven biển Đồng bằng sông Cửu Long [34].
Ngày nay, có rất nhiều nghiên cứu liên quan đến sự sinh trưởng và đặc điểm sinh lý của tảo tạo cơ sở để ứng dụng trong nuôi trồng thủy sản. Năm 2010, Nguyễn
Thị Hoài Hà đã phân lập và định danh sơ bộ được 3 loài Chaetoceros muelleri;
Navicula tuscula và Navicula radiosa dựa vào đặc điểm hình thái và nghiên cứu về đặc điểm sinh học của các loài này ở rừng ngập mặn Xuân Thủy, Nam Định. Kết quả cho thấy rằng cả ba chủng này đa dạng về thành phần các loại acid béo nên có thể ứng dụng trong nuôi trồng thủy sản, làm tăng chất lượng con giống [35]. Vào năm
2012, Nguyễn Thị Hương và cộng sự đã thu thập và nuôi sinh khối tảo silic Navicula
cari và Nitzschia closterium làm thức ăn thủy sản [36]. Ảnh hưởng của mật độ ban đầu và pH đến sự sinh trưởng, mật độ cực đại và thời gian đạt pha cân bằng của tảo
Thalassiosira pseudonana (Hasle & Heimdal) được nghiên cứu bởi Trần Thị Lê Trang và Lục Minh Diệp trong năm 2017. Nghiên cứu cho thấy rằng tảo được nuôi ở
mật độ 15x104 tb/ mL và pH từ 7,5 - 8,0 cho sinh khối cao nên được sử dụng trong
thực tiễn sản xuất [37].
So với các chi tảo silic khác như Amphora, Navicula, Chaetoceros,
Skeletonema… thì chi tảo Entomoneis được nghiên cứu ít hơn. Các nghiên cứu gần như chỉ phân lập và định danh loài dựa vào hình thái mà chưa nghiên cứu nhiều về các đặc điểm sinh lý.
Từ những nghiên cứu trên cho thấy, cơ sở dữ liệu về tảo silic ở nước ta còn khá ít nhưng hiện nay nhờ sự phát triển của khoa học kĩ thuật nên đã dễ dàng phân lập, định danh cũng như thống kê thành phần loài. Càng ngày càng có nhiều công trình đi sâu vào nghiên cứu đặc điểm sinh lý và sinh hóa của tảo silic để phục vụ thực tiễn. Tuy nhiên, có rất ít công trình nghiên cứu về tác động của biến đổi khí hậu lên sinh trưởng và sinh lý của nó.