Trong báo cáo kiểm toán kết quả kinh doanh 6 tháng 2012, PWC đã đưa ra vấn đề lưu ý như sau: Mặc dù PWC không đưa ra kết luận ngoại trừ nhưng PWC lưu ý đến thuyết minh 2.11 và thuyết minh 15 (iii) của báo cáo là trong kỳ Ngân hàng đã ký một số thoả thuận với 7 cá nhân để mua và bán lại cổ phiếu của Công ty cổ phần Chứng khoán Beta, CTCP Chứng khoán Phương Nam và Ngân hàng cổ phần Bưu điện Liên Việt với tổng số tiền 757,26 tỷ đồng. Các thoả thuận này có các kỳ hạn 6 tháng hoặc 12 tháng kể từ ngày ký thoả thuận. Đây là một hoạt động kinh doanh mới có giá trị trọng
yếu của Ngân hàng và ngân hàng đã xây dựng chính sách kế toán của mình và áp dụng cho các hoạt động kinh doanh này.
Sau soát xét, hạng mục lãi lỗ từ hoạt động mua, bán chứng khoán đầu tư đã thay đổi từ mức 77,97 tỷ đồng lãi thuần sang lỗ 40,1 tỷ đồng sau soát xét. Đây là điểm chủ yếu khiến lãi sau soát xét 6 tháng đầu năm 2012 của ngân hàng mẹ giảm 122,77 tỷ đồng so với trước soát xét.
Đây là lưu ý lần đầu tiên xuất hiện tại báo cáo kiểm toán của Sacombank, và việc chuyển lãi thành lỗ sau soát xét là do trong thỏa thuận dù giá bán lại của ngân hàng tương lai sẽ cao hơn giá mua để đảm bảo lợi nhuận cho ngân hàng, tuy nhiên khi kiểm toán giá thị trường của các chứng khoán này sụt giảm phải trích lập dự phòng dẫn đến mức lỗ trên, phía ngân hàng thì lập luận do các khoản phải thu này vẫn trong hạn và giá trị cổ phiếu sụt giảm chưa đến 75% nên chưa trích lập dự phòng.
Hiện tại chưa có quy định kế toán về các giao dịch mua và bán lại cổ phiếu có kỳ hạn, Ngân hàng đã tự xây dựng chính sách kế toán của mình và áp dụng cho nghiệp vụ này do đó tiềm ẩn nhiều rủi ro khi xảy ra tranh chấp.