Chi nhánh NHNo & PTNT Thành phố Đà Nang được thành lập năm 1988 với tên gọ i lúc bây giờ là Ngân hàng Nông nghiệp tỉnh Quảng Nam - Đà Nang. Năm 1991, tại quyết định số 66/NH-QĐ, ngày 21/4/1991 của Thống đốc Ngân hàng Nhà Nước thành lập thêm Sở giao dịch III - Ngân hàng Nông nghiệp Việt Nam đóng tại Đà Nang làm nhiệm vụ quản lý và đi ề u
hoà vốn cho 11 tỉnh khu vực mi ề n Trung và Tây Nguyên. Lúc này trên đ ịa bàn có hai chi nhánh trực thuộc Ngân hàng Nông Nghiệp Việt Nam:
+ Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp tỉnh Quảng Nam - Đà Nang với nhiệm vụ kinh doanh ti n tệ trên đ a bàn tỉnh.
+ S giao d ch III - Ngân hàng Nông nghiệp iệt Nam tại Đà Nang làm nhiệm vụ kiểm tra việc chấp hành các chủ trương chính sách của NHNN và NHNo VN thuộc phạm vi 11 tỉnh Mi n trung và Tây Nguyên.
Tại quyết định số 267/QĐ-HĐBT, ngày 01/10/1992 của Chủ tịch Hội đồng quản trị NHNo VN đa sát nhập Chi nhánh NHNo Tỉnh Quảng Nam Đà Nang với S Giao D ch III-NHNo VN tại Đà Nang; như vậy S giao d ch III- NHNo VN tại Đà Nang có nhiệm vụ quản lý, điều hoà vốn cho khu vực Miền Trung và Tây nguyên, trực tiếp kinh doanh NH trên đ a bàn tỉnh Quảng Nam - Đà Nang.
Năm 1997, tỉnh Quảng Nam - Đà Nang được chia tách thành hai đơn vị hành chính trực thuộc Trung Ương đó là TP Đà Nang và Tỉnh Quảng Nam,
phạm vi hoạt động của Sở Giao Di ch III-NHNo VN tại Đà Nang theo đó cũng thu hẹp lại trong phạm vi TP Đà Nang.
Năm 1998, NHNo & PTNT VN thành lập thêm chi nhánh NHNo & PTNT VN TP Đà Nang, như vậy trên đ ịa bàn thành phố Đà Nang cùng lúc có hai đơn vi thành viên trực thuộc NHNo & PTNT Việt Nam là Sở Giao dịch III - NHNo VN tại Đà Nang và Chi nhánh NHNo & PTNT TP Đà Nang.
Năm 2000, tại quyết định số 424/HĐBT-TCHC, ngày 26/10/2000 của Chủ tịch Hội đồng quản trị NHNo & PTNT Việt Nam, về việc hợp nhất Sở giao d ch III - NHNo VN tại Đà Nang và Chi nhánh NHNo & PTNT TP Đà Nang thành Chi nhánh NHNo & PTNT TP Đà Nang và m chi nhánh NHNo & PTNT Quận Hải Châu trực thuộc Chi nhánh NHNo & PTNT TP Đà Nang.
Hiện nay, tại Chi nhánh NHNo&PTNT trên đị a bàn Thành phố Đà Nang có 33 Chi nhánh và Phòng giao dị ch trực thuộc.