Phân tử βhCG tự do là một loại hCG đặc biệt do các tế bào không phải là tế bào lá nuôi (non-trophoblastic cell) chế tiết. Sự chế tiết βhCG tự do được cho là từ các tế bào có tính tân sản cao, có xu hướng ác tính hoặc từ các tế bào ác tính.47,70 Một số nghiên cứu cho thấy βhCG tự do tăng cao trong chửa trứng, u nguyên bào nuôi và nhiều loại ung thư khác.48,71
Phân tử βhCG tự do khác với chuỗi βhCG tách từ phân tử hCG thông thường bởi các cấu trúc đường. Phân tử βhCG tự do có cấu tạo giống với chuỗi
24
beta của phân tử hCG-H với đặc điểm là các cấu trúc đường bên lớn hơn chuỗi beta hCG thông thường, đặc biệt là ở vị trí liên kết Asn-13.47 Tuy nhiên cả ba loại βhCG thông thường, βhCG tự do, βhCG-H đều có số lượng và trình tự sắp xếp các acid amin là giống nhau nên chuỗi βhCG tự do được coi là một biến thể hyperglycosylated của chuỗi βhCG. Trong cấu trúc phân tử của βhCG tự do thì chuỗi đường N chủ yếu là liên kết đường ba (triantennary N-linked oligosaccharides) và chuỗi đường N chủ yếu là các liên kết đường sáu (hexasaccharide type O-linked oligosaccharides).
Về vai trò sinh học, βhCG tự do có tính chất sinh học tương tự hCG-H là thúc đẩy các tế bào tăng trưởng và phát triển. Các tác động sinh học của βhCG tự do cũng như hCG-H có được là do chúng gắn với các thụ thể TGFβ receptor, làm cho TGFβ mất tác dụng sinh học và kết quả cuối cùng là làm kìm hãm quá trình thoái hóa tế bào, vòng đời tế bào tăng lên.