2.2.1. Thiết kế nghiên cứu
Mục tiêu 1- Xác định đột biến gen BRCA1, BRCA2 trong UTBT
Tiến hành bằng phương pháp nghiên cứu mô tả cắt ngang. Nhóm mẫu này được thu thập theo phương pháp lấy mẫu thuận tiện. 20 bệnh nhân được chọn thỏa điều kiện được chẩn đoán xác định UTBT bằng kết quả xét nghiệm mô bệnh học và có một hoặc cả hai tiêu chí của Hội chứng ung thư vú – ung thư buồng trứng di truyền sau là tiền sử mắc UT vú và/hoặc có ít nhất một người thân trong gia đình mắc UTBT hoặc/và UT vú. Mời được 17 người thân của những bệnh nhân được xác định có mang ĐB BRCA1 hoặc BRCA2 tham gia nghiên cứu để xác định các ĐB như ở bệnh nhân bằng giải trình tự Sanger. Lập sơ đồ di truyền phả hệ.
Mục tiêu 2 - Xác định các SNP RAD51 và XRCC3 liên quan đến nguy cơ UTBT
Tiến hành bằng phương pháp nghiên cứu bệnh-chứng. Dựa theo kết quả nghiên cứu của Quaye (2009)85 và công thức tính cỡ mẫu cho nghiên cứu bệnh chứng có ước tính tỉ số nguy cơ (OR):
Với sai sót loại 1 α=0,05 và sai sót loại 2 β=0,02 thì hằng số C=7,85 và OR=0,65, p=0,351, ta được N= 743. Cho nên mỗi nhóm nghiên cứu nên chọn tối thiểu là 372 người. Chúng tôi quyết định chọn 380 người cho mỗi nhóm
2.2.2. Các biến số nghiên cứu
Bảng 2.1 Các biến số nghiên cứu
STT Biến số nghiên cứu Loại biến
Thông tin chung, lâm sàng đối tượng nghiên cứu
01 Tuổi Biến định lượng
02 Tuổi tại thời điểm chẩn đoán bệnh UTBT Biến định lượng
03 Tình trạng kinh nguyệt Biến nhị giá (còn kinh, mãn kinh)
04 Tuổi có kinh Biến định lượng
05 Tiền sử mắc ung thư vú Biến nhị giá (có, không) 06 Tiền sử có người thân mắc UTBT Biến nhị giá (có, không) 07 Tiền sử có người thân mắc ung thư vú Biến nhị giá (có, không) 08 Nhóm phân loại UTBT theo mô bệnh học Biến định danh
09 Giai đoạn bệnh tại thời điểm chẩn đoán Biến định danh Mục tiêu 01: Xác định đột biến BRCA1 và BRCA2
10 Tên đột biến (theo thay đổi nucleotide và Biến định danh theo thay đổi acid amin)
11 Vị trí đột biến Biến định danh
12 Loại đột biến Biến định danh
13 Ý nghĩa đột biến Biến định danh
Mục tiêu 02: Xác định các đa hình đơn nucleotid gen RAD51 và XRCC3 14 Đa hình đơn nucleotide RAD51-rs1801320 Biến định danh 15 Đa hình đơn nucleotide RAD51-rs1801321 Biến định danh 16 Đa hình đơn nucleotide XRCC3-rs816539 Biến định danh 17 Đa hình đơn nucleotide XRCC3-rs1799794 Biến định danh 18 Đa hình đơn nucleotide XRCC3-rs1799796 Biến định danh