Bên cạnh những kết quả đạt được ở trên, công ty còn có những mặt hạn chế sau:
Về thông tin sử dụng trong phân tích: Chưa có số liệu của ngành, vùng để so
sánh, vì vậy thông tin trong phân tích còn hạn hẹp. Đồng thời số liệu so sánh chỉ lấy của ba năm tài chính là năm 2013 – 2015 mà không so sánh với những đơn vị trong cùng ngành hay những đơn vị cùng loại hình kinh doanh trong cùng khu vực
Vế phương pháp sử dụng trong phân tích: Công ty chưa áp dụng được phương pháp phân tích theo mô hình Dupont nên chưa chỉ rõ được yếu tố ảnh hưởng chính đến năng lực tài chính. Khi phân tích một số chỉ tiêu tài chính mới chỉ đưa ra con số mà chưa đưa ra nguyên nhân, mức độ ảnh hưởng của từng nhân tố đến kết quả đó, từ đó công ty chưa nắm được ý nghĩa chi tiết những chỉ tiêu đó.
Về nội dung phân tích: Nội dung phân tích chỉ dừng lại ở các nhóm chỉ tiêu
phản ánh cơ cấu tài sản, nguồn vốn, hiệu quả kinh doanh, công ty chưa tổ chức phân tích dòng tiền trong báo cáo lưu chuyển tiền tệ. Như vậy nội dung phân tích đơn giản, chưa toàn diện
Về công tác tổ chức phân tích: Công ty chưa có bộ phận phân tích riêng, mà
bộ phận kế toán ngoài nhiệm vụ chính là hạch toán kế toán thì đảm nhiệm cả việc phân tích tài chính cho công ty nên công tác phân tích không được chuyên sâu. Công ty phân tích tình hình tài chính khi hoàn thiện báo cáo tài chính đã được công ty kiểm toán kiểm toán và phát hành Báo cáo tài chính. Vì vậy thông tin phản ánh không kịp thời để điều chỉnh các chỉ tiêu phân tích cho hiệu quả.