Một là: Hoàn thiện hệ thống pháp luật để đảm bảo hành lang pháp lý và môi trường kinh doanh bình đẳng, thuận tiện cho các doanh nghiệp nói chung, còn riêng đối với các doanh nghiệp thuộc nghành GTVT, Nhà nước cần:
Thứ nhất: Sớm hoàn thiện các dự án luật và cuối cùng là ban hành
các văn bản pháp luật về đường bộ, đường sắt, đường sông... để sản xuất kinh doanh trong các lĩnh vực này sớm đi vào khuôn khổ, không buông lỏng như hiện nay. Nhà nước tiếp tục nghiên cứu, sửa đổi cơ chế quản lý hạ tầng giao thông: Đường sắt, đường bộ, đường thuỷ... Bên cạnh đó ban hành cơ chế quản lý cho các doanh nghiệp ngoài quốc doanh hoạt động trong lĩnh vực GTVT.
Thứ hai: Hoàn thiện cơ chế tài chính nhằm tạo điều kiện thuận lợi để
các Tổng công ty lớn hình thành các công ty tài chính độc lập nhằm thực hiện chức năng điều hoà vốn trong nội bộ Tổng công ty, thành lập công ty cổ phần bảo hiểm GTVT. Cần có cơ chế tài chính đặc thù với một số doanh nghiệp và hoạt động đặc thù của nghành GTVT như sản phẩm có tính đơn chiếc, thi công kéo dài và vốn lớn hoặc doanh nghiệp thường đầu tư lớn vào tài sản cố định nên cần sự ưu đãi về vốn vay, cần thực hiện khấu hao nhanh để thu hồi vốn. Hoàn thiện và cải cách cơ chế về đầu tư XDCB để doanh nghiệp trong nước có đủ khả năng tham gia đấu thầu và thắng thầu các dự án lớn trong và ngoài nước, xúc tiến dự án thành lập hiệp hội các nhà thầu trong nghành GTVT để hỗ trợ, bảo hộ đấu thầu các đơn vị trong nghành.
Hai là: Đổi mới cơ chế quản lý nội bộ trong Tổng công ty theo hướng hình thành cơ chế “công ty mẹ - con”, thiết lập chặt chẽ hơn nữa mối liên hệ giữa Tổng công ty với các công ty thành viên, mối liên hệ giữa các công ty thành viên với nhau thông qua điều hành của Tổng công ty về tài chính trên cơ sở liên kết về vốn. Tổng công ty điều hành các công ty thành viên của mình trong HĐQT của công ty thành viên. Tổng công ty và công ty thành viên cùng hưởng lợi hay chịu thua lỗ, xoá bỏ cơ chế nộp kinh phí đài thọ cấp trên như hiện nay. Củng cố lại HĐQT, ban kiểm soát tại Tổng công ty, đảm bảo HĐQT thực sự là người đại diện chủ sở hữu vốn nhà nước tại các doanh nghiệp.
Ba là: Sau khi Chính phủ bãi bỏ giấy phép kinh doanh trong lĩnh vực vận tải, mọi thành phần kinh tế bung ra cung cấp dịch vụ vận tải gây không ít lộn xộn, cạnh tranh không lành mạnh. Do vậy, Chính phủ nên sớm ban hành các quy định để chấn chỉnh tình trạng này.