- IF2 là một GTPase (protein gắn và thủy phân GTP) IF2 tương tác với 3 thành phần của bộ máy khởi đầu là tiểu đơn vị 30S, IF1 và
7. Khởi đầu chuỗi peptid ở nhân thật •Đặc điể m khởi đầu chuỗi peptid ở nhân thật
• Trình tự dẫn mARN nhân thật không được xem như trình tự Shine-Dalgarno ở nhân nguyên thủy.
• Đầu tận cùng 3’ của rARN 18S (tương đương với rARN 16S ở vi khuẩn) không có trình tự CCUCC.
• Bộ ba AUG có thể chỉ là bộ ba mã hóa bình thường nhưng cũng có thể là bộ ba khởi đầu.
• mARN ở nhân thật là monocistronic, chúng chỉ chứa một trình tự mã hóa và khởi đầu, thường xảy ra ở bộ ba khởi đầu AUG trong mARN.
• Ở nhân thật Met-tARNiMet phải được gắn kết trước vào tiểu đơn vị 40S. Điều đó cho thấy rằng đối mã (CAU) trên tARN-khởi đầu đã
Marilyn Kozak đã đề xuất mơ hình “quét” để nhận diện codon khởi đầu ở tế bào nhân thật. Trước tiên tiểu đơn vị nhỏ 40S của
ribosom gắn vào đầu tận cùng 5’ của mARN, sau đĩ di chuyển dọc theo mARN tới khi gặp codon khởi đầu AUG.
Năng lượng cho sự di chuyển lấy từ sự thủy phân ATP và sự tương tác khởi đầu với mARN cĩ thể liên quan tới cấu trúc chĩp 5’ (CAP). Codon AUG cĩ thể chỉ là codon mã hĩa bình thường nhưng cũng cĩ thể là codon khởi đầu, nếu nĩ được định vị trong một “ngữ cảnh” đúng. Ngữ cảnh biết tới nhiều nhất do Kozak phát hiện, do đĩ cịn được gọi là trình tự Kozak.
Tiểu đơn vị 40S sẽ bỏ qua codon AUG bình thường cho đến khi định vị tại
codon AUG khởi đầu nằm trong ngữ cảnh tốt. 95% các trường hợp khởi đầu ở tế bào nhân thật xảy ra tại codon khởi đầu AUG, hầu như khơng dùng tới GUG.
Khởi đầu dịch mã ở tế bào nhân thật phức tạp hơn rất nhiều so với tế bào nhân nguyên thủy và cĩ hơn 30 peptid tham gia.