Trong giai đoạn hiện nay, thị trường luôn biến đổi kèm theo sự canh tranh gay gắt giữa các doanh nghiệp, do đó công tác hạch toán kế toán chi phắ xây lắp và giá thành xây lắp nói chung không thể tránh khỏi những tồn tại cần được nghiên cứu và tiếp tục hoàn thiện.
đơn giá nguyên vật liệu luôn có sự biến động, thay đổi liên tục, đơn giá thực tế tăng cao so với định mức được chủ đầu tư phê duyệt làm cho chi phắ nguyên vật liệu trực tiếp tăng lên dẫn đến giá thành xây lắp tăng lên.
Các thủ kho không dùng thẻ kho để theo dõi tình hình nhập, xuất, tồn vật liệu mà theo dõi bằng sổ tay. Điều này cho thấy việc theo dõi này không khoa học, không chặt chẽ.
Hiện nay, Công ty đã phân loại ra chi phắ tiền lương cho các công trình, hạng mục công trình bao gồm công nhân chắnh trong Công ty, công nhân dược Công ty ký hợp đồng lao động và lao động thuê ngoài thông qua hình thức giao khoán, lao động thời vụ nhưng khi hạch toán đưa chung vào TK 334 mà không mở các tài khoản chi tiết điều này sẽ gây khó khăn cho việc phân tắch chi phắ sử dụng lao động.
Hiện nay, công tác hạch toán kế toán tại Công ty cổ phần xây dựng số 3 Hải Phòng được thực hiện thủ công. Công ty chưa áp dụng hình thức hạch toán kế toán các phần hành bằng kế toán máy là tiến hành đi mua bản quyền để sử dụng phần mềm kế toán. Chắnh vì vậy đã ảnh hưởng rất lớn đến công tác kế toán, hiệu quả sản xuất kinh doanh, làm giảm đi sự nhanh chóng, chắnh xác, đảm bảo thông tin kịp thời cho Ban Lãnh đạo trong công tác điều hành sản xuất kinh doanh ở Công ty. Mặt khác, việc lưu trữ, tra cứu kiểm tra các số liệu kế toán Ờ tài chắnh cũng khó khăn hơn.