Bên cạnh những thành tựu đạt được thì công tác quản lý chi NSNN cho sự nghiệp GDPT vẫn còn nhiều hạn chế như sau:
• Quá trình lập dự toán ngân sách chưa xuất phát từ các trường thụ hưởng ngân sách mà thường dựa vào số liệu ước thực hiện và những định hướng nhiệm vụ chung của Đảng và Nhà nước xây dựng nên.
• Định mức được xây dựng chưa sát với tình hình thực tế của các trường: số lượng học sinh, giáo viên…
• Định mức ngân sách phân bổ cho các trường chưa hợp lý, do các khoản chi thường xuyên luôn biến đổi theo tình hình KT - XH của đất nước, và của Thành phố Hà Nội, gây khó khăn cho các đơn vị thụ hưởng ngân sách.
• Chính những điều này cũng một phần ảnh hưởng đến việc cấp phát, thanh toán và kiểm soát các khoản chi NSNN cho sự nghiệp GDPT ở Thành phố Hà Nội.
• Thủ tục cấp phát, thanh toán còn rườm rà, khó khăn, không khách quan, làm ảnh hưởng đến tiến độ kinh phí đến được với đơn vị thụ hưởng ngân sách.
• Công tác cấp phát ngân sách cho các đơn vị giáo dục còn nhiều vấn đề như tình trạng hợp thức hóa các khoản chi của đơn vị, chi cho hết không để thừa…
• Việc xin cấp bổ sung ngân sách cho các trường còn nhiều khó khăn, do đó gây ảnh hưởng tới hoạt động của các trường.
• Kho bạc nhà nước và các cơ quan tài chính hay gặp khó khăn trong việc thanh toán và kiểm soát các nội dung chi, mục đích chi và hiệu qua sử dụng các khoản chi.
• Việc quyết toán ngân sách cho GDPT ở các trường còn chậm, việc thực hiện mới chỉ kiểm tra chứng từ, chứ chưa kiểm soát được các khoản chi thực và chất lượng của chúng.
• Đôi khi chưa có sự phối hợp và quy định trách nhiệm giữa các đơn vị quyết toán
CHƯƠNG III
GIẢI PHÁP HOÀN THIỆN VÀ ĐỔI MỚI CÔNG TÁC QUẢN LÝ CHI NGÂN SÁCH NHÀ NƯỚC CHO