Bên cạnh những thuận lợi, Công ty cũng đứng trớc những khó khăn và thách thức:
Về khách quan:
Cùng với xu thế phát triển của nền kinh tế thị trờng, tất yếu tạo ra sự cạnh tranh ngày càng gay gắt đối với tất cả các lĩnh vực, các ngành kinh tế trong đó đặc biệt là kinh doanh dịch vụ, phải thờng xuyên chú trọng về tính cạnh tranh của dịch vụ do mình cung cấp. Sự ra đời của nhiều hãng Taxi trong địa bàn thành phố với số vốn lớn hơn, với trình độ quản lý cao hơn, với xe phục vụ kinh doanh vận tải tốt hơn. Đây là thách thức không nhỏ với Công ty cổ phần Kiên Long
Ngoài ra, giá nhiên liệu ngày càng tăng cao và có nhiều biến động, cộng thêm tình hình lạm phát hiện nay của nền kinh tế cũng khiến cho Doanh nghiệp phải đơng đầu với nhiều khó khăn trong việc cân đối giữa lợi nhuận và sự phát triển của Công ty, chi phí nhiên liệu, chi phí khấu hao, sửa chữa phơng tiện, chi phí tiền lơng, tiền phúc lợi cho nhân viên và lái xe ... với áp lực giá cớc dịch vụ cạnh tranh nên không thể nâng cao tùy ý đợc.
Vấn nạn Taxi “dù” cũng là một vấn đề nhức nhối với Công ty cổ phần Kiên Long vì những chiếc Taxi này bắt trộm sóng liên lạc bộ đàm của hãng và đón tranh khách trớc. Không những làm mất uy tín của hãng với khách hàng mà còn khiến cho khách hàng phải chịu nhiều thiệt thòi.
Do mới gia nhập Tổ chức thơng mại Thế giới WTO với các lộ trình giảm giá xe hơi đầu vào cha đáng kể nên giá xe còn quá cao so với khu vực là một cản trở rất lớn trong việc phát triển số lợng xe cũng nh thu hồi vốn.
Về chủ quan:
Công ty mới thành lập nên tiềm lực còn hạn chế, số lợng đầu xe ít, kinh nghiệm quản lý cha cao, đội ngũ lái xe cha dày dạn kinh nghiệm.
Do đặc thù của địa bàn hoạt động quá rộng, đòi hỏi của khách hàng ở từng địa bàn khác nhau, số lợng xe dàn mỏng gây không ít khó khăn cho quản lý, cán bộ, nhân viên gặp khó khăn trong việc đi làm, việc điều hành và kiểm soát trên mạng thông tin nội bộ của Công ty cũng bị hạn chế.
Cũng do địa bàn hoạt động rộng nên việc chạy rỗng (không khách) lớn kéo theo chi phí sản xuất lớn (xăng dầu, hao mòn). Việc bảo quản, bảo dỡng, giữ gìn phơng tiện cũng tốn kém hơn.