Khai thỏc và nuụi trồng thủy sản ở cỏc tỉnh ven biển Nam Bộ thời gian vừa qua đó từng bước được nõng lờn ở trỡnh độ phỏt triển mới. Nhưng chưa tương xứng với tiềm năng.
Với đặc điểm là gần 90% giỏ trị xuất khẩu thủy sản là từ nguồn nuụi trồng, thời gian vừa qua cỏc địa phương đó chỳ trọng cụng tỏc quy hoạch, nuụi trồng những vựng thủy sản đạt năng suất và hiệu quả kinh tế cao. Nhờ đú tốc độ tăng sản lượng nuụi trồng thủy sản khỏ nhanh, dần đỏp ứng đủ yờu cầu của nguyờn liệu chế biến xuất khẩu. Tuy nhiờn, việc phỏt triển vẫn chưa tương xứng với tiềm năng, và trong thời gian tới cần phải đẩy mạnh hơn nữa việc quy hoạch cỏc vựng nuụi trồng và khai thỏc, nhằm tạo ra nguồn nguyờn liệu ổn định cho xuất khẩu thủy sản.
Sự đầu tư về cơ sở hạ tầng, trang bị kỹ thuật, và nõng cao chất lượng con giống trong nuụi trồng thủy sản xuất khẩu đó được đầu tư, nhưng chủ yếu là chỉ đầu tư theo chiều rộng, cỏc hoạt động khoa học cụng nghệ trong nuụi trồng thủy sản vẫn cũn ở mức độ sơ khai, chủ yếu là học tập nước ngoài.
Về khai thỏc thủy sản, đa số sản lượng hải sản khai thỏc được là nhờ hoạt động khai thỏc ven bờ, số tàu thuyền cú cụng suất lớn chiếm tỷ trọng khỏ nhỏ. Đõy là một hạn chế rất lớn và cần phải được thay đổi trong thời gian tới do những đũi hỏi khỏch quan của việc tăng sản lượng thủy sản khai thỏc với việc bảo vệ nguồn lợi thủy sản, nhất là thủy sản ven bờ.
Bờn cạnh đú việc NTTS và khai thỏc hải sản cũn phụ thuộc rất nhiều vào điều kiện tự nhiờn, khớ hậu, thời tiết… Chớnh vỡ vậy sản lượng thủy sản cú được ở khu vực này khụng ổn định, điều này làm cho giỏ thu mua nguyờn liệu cũng bấp bờnh. Nú khụng chỉ ảnh hưởng đến thu nhập của bà con ngư dõn mà cũn ảnh hưởng đến chi phớ của doanh nghiệp chế biến xuất khẩu, ảnh hưởng đến hiệu quả kinh doanh của doanh nghiệp.