Theo Quyết địn 2148/QĐ-TCHQ ngày 31-12-2005 của Tổng cục hải quan, QLRR trong ngành hải quan được phõn thành 3 cấp thực hiện:
* Quản lý rủi ro cấp chiến lược được thực hiện tại Tổng cục Hải quan. Cụng việc này chủ yếu thực hiện thụng qua việc đỏnh giỏ cỏc nguồn thụng tin, dữ liệu toàn diện để cơ quan hải quan cú thể phõn định được nhiều lĩnh vực cụng việc với cỏc mức độ rủi ro khỏc nhau từ đú cú hành động can thiệp khi cần thiết. Việc đỏnh giỏ rủi ro theo phương thức này đó đỏnh dấu bước chuyển đổi tư duy rất quan trọng của Hải quan Việt Nam. Từng bước, Hải quan Việt Nam từ bỏ tư duy “gỏc cửa” để chuyển sang tư duy “ngăn chặn” và thực hiện cụng tỏc quản lý cú hiệu quả hơn. Cho đến nay, cơ quan Tổng cục Hải quan đó đảm bảo sự thống nhất trong toàn ngành về:
- Xõy dựng, ban hành, sửa đổi bổ sung bộ tiờu chớ quản lý rủi ro. - Ban hành cỏc quy định hướng dẫn thực hiện quản lý rủi ro.
- Xõy dựng, quản lý, vận hành, kiểm soỏt hệ thống thụng tin nghiệp vụ hải quan và cơ sở dữ liệu quản lý rủi ro theo phõn cấp, đảm bảo cỏc yờu cầu an ninh, an toàn về mặt kỹ thuật, bảo mật hệ thống cơ sở dữ liệu trong toàn ngành hải quan.
- Thu thập, cập nhật, quản lý thụng tin nhằm hoàn thiện cơ sở dữ liệu quản lý rủi ro.
- Phối hợp với cỏc cơ quan trong và ngoài ngành Tài chớnh trao đổi thụng tin với hải quan cỏc nước, Tổ chức Hải quan Thế giới để xõy dựng hệ thống cơ sở dữ liệu thụng tin nghiệp vụ hải quan phục vụ quản lý rủi ro.
- Xõy dựng hệ thống tổ chức, đào tạo nguồn nhõn lực.
Việc tham mưu đề xuất, xõy dựng, thu thập thụng tin và quản lý vận hành quy trỡnh quản lý rủi ro trong toàn ngành được giao cho cỏc Cục Điều tra chống buụn lậu, Cục Kiểm tra sau thụng quan, Vụ giỏm sỏt quản lý và Vụ Kiểm tra thu thuế xuất nhập khẩu theo từng mảng chức năng phự hợp, trong đú, Cục Điều tra chống buụn lậu cú trỏch nhiệm chủ trỡ cụng tỏc trờn.
*Quản lý rủi ro cấp hoạch định triển khai được thực hiện tại cỏc Cục hải quan địa phương. Là cơ quan trung gian trong phõn cấp quản lý rủi ro của Hải quan Việt Nam, Cục hải quan địa phương cú nhiệm vụ chớnh là kết hợp những thụng tin, cỏc dữ liệu thu thập được cung cấp bởi Tổng cục Hải quan, cựng với những thụng tin thu thập được dựa vào tỡnh hỡnh thực tế trờn địa bàn quản lý, cung cấp cơ sở dữ liệu thụng tin một cỏch đầy đủ nhất. phục vụ cỏc chi cục hải quan cửa khẩu trong việc phõn định mức độ rủi ro và quyết định hỡnh thức kiểm tra thực tế hàng húa. Cục hải quan địa phương cú nhiệm vụ:
- Triển khai quản lý, vận hành hệ thống quản lý rủi ro theo quy định và hướng dẫn của Tổng cục Hải quan.
- Xõy dựng, quản lý, cập nhật thường xuyờn cỏc thụng tin vào cơ sở dữ liệu trờn cơ sở Bộ tiờu chớ quản lý rủi ro chung trong phạm vi địa bàn được phõn cụng quản lý.
- Tiếp nhận đầy đủ, kịp thời, chớnh xỏc thụng tin về quản lý rủi ro và hướng dẫn thực hiện cho cỏc Chi cục, cỏc đơn vị trực thuộc cú trỏch nhiệm.
- Bỏo cỏo Tổng cục Hải quan kịp thời toàn bộ tỡnh hỡnh quản lý sử dụng và cỏc vướng mắc phỏt sinh trong quỏ trỡnh vận hành hệ thống quản lý rủi ro.
- Phối hợp với cỏc cơ quan, đơn vị trong và ngoài ngành tài chớnh tại địa phương để thu thập thụng tin phục vụ quản lý rủi ro theo phõn cấp.
* Quản lý rủi ro cấp chiến thuật được thực hiện tại cỏc chi cục hải quan,
điểm thụng quan nội địa và bởi cỏc cỏn bộ hải quan làm nhiệm vụ trực tiếp tại hiện trường.
Thực tế khụng phải khi nào cũng phỏt sinh vấn đề giống nhau, cũng khụng phải trong kho cơ sở dữ liệu luụn sẵn sàng cung cấp thụng tin chớnh xỏc về cỏc lụ hàng xuất nhập khẩu, về chủ hàng và dự đoỏn trước được tất cả
tỡnh hỡnh sắp diễn ra. Vỡ vậy, ngoài những thụng tin cú sẵn trong hệ thống cơ sở dữ liệu rủi ro, căn cứ vào tỡnh hỡnh thực tế và thụng tin do khỏch hàng khai bỏo khi làm thủ tục hải quan, cỏc đơn vị chủ động triển khai lực lượng, trang thiết bị vật chất, bố trớ cụng việc để đạt được hiệu quả cao nhất. Đồng thời, khi phỏt hiện thờm cỏc yếu tố rủi ro mới phỏt sinh cần bỏo cỏo ngay lờn Cục Hải quan cấp chủ quản để cập nhật, bổ sung dữ liệu thụng tin, làm cơ sở xỏc định rủi ro cho cỏc lụ hàng tiếp theo. Nhiệm vụ cụ thể ở cấp này là:
- Tiếp nhận đầy đủ và sử dụng thụng tin từ hệ thống cơ sở dữ liệu của Cục Hải quan quản lý trực tiếp.
- Căn cứ vào quy trỡnh thủ tục hải quan hiện hành, kết hợp với cỏc nguồn thụng tin khỏc của Chi cục để lựa chọn và quyết định kiểm tra hải quan.
- Bỏo cỏo Cục Hải quan quản lý trực tiếp kịp thời toàn bộ tỡnh hỡnh quản lý, sử dụng và cỏc vướng mắc phỏt sinh trong quỏ trỡnh vận hành hệ thống quản lý rủi ro.
- Phối hợp với cỏc cơ quan, đơn vị trờn địa bàn quản lý để thu thập thụng tin phục vụ quản lý rủi ro theo phõn cấp.