: xuất hiện phân đoạn ADN;
CDƯT (Kb) ADNPĐ
Thứ tự các dòng vải nghiên cứu * TB
ADN1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 2,8 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 11 2,4 2 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 1 1 0 0 1 1 28 2,0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1,9 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44 1,85 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1,67 6 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1,6 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1,5 8 0 0 1 0 1 1 1 1 0 0 1 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 1 1 21 1,45 9 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 3 1,3 10 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 1 1 15 1,2 11 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 0 1 1 35 1,0 12 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44 0,95 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0,9 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0,8 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0,75 16 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42 0,65 17 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 0,55 18 0 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 25 0,51 19 0 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24 0,48 20 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40 0,43 21 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 11 0,35 22 0 1 1 0 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30 0,25 23 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 TB ADN 9 10 12 9 11 9 9 10 10 8 9 8 8 8 8 7 8 8 7 8 12 13 9 12 8 9 11 10 7 10 10 9 12 10 8 10 8 9 9 13 12 11 10 13 14 435
Bảng 12. Các phân đoạn ADN đợc nhân bản ngẫu nhiên khi tiến hành phản ứng RAPD với mồi RA-142
Ghi chú : * là số thứ tự các dòng vải nghiên cứu đợc kí hiệu nh bảng 2, CDƯT: chiều dài ớc tính; PĐ ADN: phân đoạn ADN; TPĐ ADN: tổng số băng ADN; Số 1: phân đoạn ADN đợc nhân bản; Số 0: phân đoạn ADN không đợc nhân bản.
các phân đoạn ADN xuất hiện ở các dòng cũng không đồng nhất, ví dụ tại các vị trí 1,3Kb, 1,0Kb, 0,8Kb, 0,6Kb, 0,25Kb... Sự xuất hiện hay biến mất các phân đoạn ADN chứng tỏ quần thể vải nghiên cứu có sự thay đổi đáng kể ở mức độ gen (hình 7).
Với mồi RA-142, chúng tôi nhận đợc một phân đoạn ADN đặc trng cho các cây vải thiều Thanh Hà tại vị trí ớc tính là 0,75Kb. Đây có thể coi nh là chỉ thị để phân biệt giống vải thiều Thanh Hà với các giống làm đối chứng trong thí nghiệm.
3.3.1.2.4. Sản phẩm RAPD với mồi P-17
Đối với mồi ngẫu nhiên P-17, chúng tôi cũng nhận đợc kết quả về tính đa hình tơng tự nh các đoạn mồi trình bày ở trên. Trong tổng số 14 phân đoạn ADN đợc nhân bản, có tới 10 phân đoạn mang tính đa hình. Nhng theo phân tích thì thấy rằng, tính đa hình của các phân đoạn thu đợc chủ yếu do sự sai khác giữa dòng UH24 (cột 24), UT25 (cột 25), TL26 (cột 26) với các dòng vải thiều. Ví dụ, tại vị trí 2,1Kb và 0,9Kb, ở dòng UH24 (cột 24), UT25 (cột 25), TL26 (cột 26) xuất hiện phân đoạn ADN đợc nhân bản trong khi các dòng khác không có. Tại vị trí 1,5Kb và 1,05Kb, dòng TH24 (cột 24) không có 2 phân đoạn ADN tơng ứng xuất hiện. Cũng tơng tự ở dòng HB35 (cột 35) không xuất hiện phân đoạn ADN ở vị trí 1,9Kb (hình 8, bảng 13). Ngoài ra, tại một số vị trí khác cũng có sự không đồng nhất về phân đoạn ADN đợc nhân bản giữa các dòng vải nghiên cứu. Những kết quả nhận đợc trên đây một lần nữa khẳng định có sự sai khác về mặt di truyền của một số dòng vải nghiên cứu.
3.3.1.2.5. Sản phẩm RAPD với mồi RA-40
Điện di sản phẩm phản ứng RAPD của mồi RA-40, chúng tôi cũng nhận đợc kết quả tơng tự nh các mồi trên. Số phân đoạn ADN đợc nhân bản của 45 dòng vải nghiên cứu đối với mồi này là 21. Chiều dài ớc tính của các phân đoạn dao động từ 0,35Kb đến 2,0Kb.
Hình 8. Kết quả điện di sản phẩm RAPD của quần thể vải nghiên cứu với mồi P-17
Ghi chú: M: thang ADN 1Kb (DNA ladder); thứ tự các các cột còn lại nh bảng 2;
: xuất hiện phân đoạn ADN;
: Không xuất hiện phân đoạn ADN.
3Kb 2Kb 1Kb 0,5Kb
Bảng 13. Các phân đoạn ADN đợc nhân bản ngẫu nhiên khi tiến hành phản ứng RAPD với mồi P-17
CDƯT(Kb) ADNPĐ (Kb) ADNPĐ
Thứ tự các dòng vải nghiên cứu * TB
ADN1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 3,7 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 2,0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1,9 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44 1,7 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1,5 5 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44 1,45 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1,4 7 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42 1,35 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1,25 9 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 1,15 10 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 0,95 11 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44 0,94 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0,76 13 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 0,5 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 TPĐ ADN 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 362
Ghi chú : * là số thứ tự các dòng vải nghiên cứu đợc kí hiệu nh bảng 2, CDƯT: chiều dài ớc tính; PĐ ADN: phân đoạn ADN; TPĐ ADN: tổng số băng ADN; Số 1: phân đoạn ADN đợc nhân bản; Số 0: phân đoạn ADN không đợc nhân bản.
Hình 9. Kết quả điện di sản phẩm RAPD của quần thể vải nghiên cứu với mồi RA-40
Ghi chú:
M : thang ADN 1Kb (DNA ladder); thứ tự các các cột còn lại nh bảng 2; : xuất hiện phân đoạn ADN; : xuất hiện phân đoạn ADN;
: Không xuất hiện phân đoạn ADN.