CDƯT(Kb) (Kb)
PĐADN ADN
Thứ tự các dòng vải nghiên cứu * TB
ADN1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
Bảng 11. Các phân đoạn ADN đợc nhân bản ngẫu nhiên khi tiến hành phản ứng RAPD với mồi RA45
3Kb 2Kb 1Kb 0,5Kb
2,3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 442,0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2,0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1,95 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43 1,85 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1,65 5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1,5 6 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41 1,48 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1,45 8 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 9 1,25 9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1,10 10 1 0 1 0 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 33 1,08 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1,05 12 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44 0,96 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0,93 14 1 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41 0,9 15 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0,85 16 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0,75 17 0 0 1 0 0 1 1 0 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 0 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30 0,68 18 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 0,58 19 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42 0,5 20 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 7 0,46 21 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45 0,45 22 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0,35 23 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0,25 24 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 TPĐ ADN 11 8 11 8 9 12 10 9 9 10 10 8 9 10 9 10 11 10 9 10 10 10 10 13 11 9 10 10 10 10 10 9 10 11 9 10 10 10 11 9 10 10 9 11 12 447
Ghi chú : * là số thứ tự các dòng vải nghiên cứu đợc kí hiệu nh bảng 2, CDƯT: chiều dài ớc tính; PĐ ADN: phân đoạn ADN; TPĐ ADN: tổng số băng ADN; Số 1: phân đoạn ADN đợc nhân bản; Số 0: phân đoạn ADN không đợc nhân bản.
Tính đa hình của quần thể vải nghiên cứu đợc chỉ ra rất rõ ràng tại các vị trí đợc đánh dấu bằng mũi tên trên hình 6. Tại vị trí 1,6Kb dòng TH1 (cột 1), TH17 (cột 17), UH24 (cột 24) xuất hiện phân đoạn ADN trong khi các dòng khác không có. Tại vị trí 1,3Kb có xuất hiện phân đoạn ADN đợc nhân bản ở duy nhất dòng TH20 (cột 20). Trong khi đó, ở dòng TH4 (cột 4), TH9 (cột 9), VT19 (cột 19), TH20 (cột 20) không xuất hiện phân đoạn ADN nh các dòng khác tại vị trí ớc tính là 0,8Kb. Từ các kết quả này có thể thấy đợc rằng đã có sự đã có sự sai khác về mặt di truyền ở một số dòng vải nghiên cứu.
3.3.1.2.2. Sản phẩm RAPD với mồi RA-142
Sau khi điện di sản phẩm của phản ứng RAPD với mồi RA-142, chúng tôi thu đợc tổng số 23 phân đoạn ADN. Dòng có nhiều phân đoạn ADN xuất hiện nhất là dòng TH45 với 14 phân đoạn còn dòng có ít phân đoạn nhất là TH16, TH19, TH29 với 7 phân đoạn. Trong đó, phân đoạn có chiều dài ngắn nhất là 0,25Kb và phân đoạn dài nhất là 2,9Kb. Đây là mồi tạo ra sự đa hình phong phú nhất. Trong tổng số 23 phân đoạn ADN có tới 22 phân đoạn mang tính đa hình và chúng đợc phân bố cụ thể nh sau (hình 7, bảng 12).
Tính đa hình ADN đợc chỉ ra bởi mồi RA-142 khá rõ ràng. Sự xuất hiện của các phân đoạn ADN tại cùng một vị trí là rất khác nhau khi so sánh giữa dòng UH24, UT25, TL26 với các dòng khác. Điều này cũng thực sự dễ hiểu vì đó là 3 giống vải nhập từ Trung Quốc đợc dùng làm đối chứng.
Với các dòng còn lại của quần thể vải thiều Thanh Hà, mồi RA-142 cũng chỉ ra nhiều phân đoạn đa hình. Ví dụ, ở dòng TH1 (cột 1), TH16 (cột 16), TH34 (cột 34) có thấy xuất hiện phân đoạn ADN với chiều dài ớc tính vào khoảng 1,6Kb. Tại vị trí 1,5Kb chỉ có 3 dòng TH22 (cột 22), TH27 (cột 27) và TH38 (cột 38) xuất hiện phân đoạn ADN. Trong khi đó, ở vị trí 0,4Kb trên điện di đồ, dòng TH4 (cột 4), TH12 (cột 12), TH20 (cột 20), TH23 (cột 23) và TH29 (cột 29) không xuất hiện phân đoạn ADN. Tại nhiều vị trí khác,
Hình 7. Kết quả điện di sản phẩm RAPD của quần thể vải nghiên cứu với mồi RA-142
Ghi chú: M : thang ADN 1Kb (DNA ladder); thứ tự các các cột còn lại nh bảng 2; : Chỉ thị RAPD