- Chưa mở rộng được thị trường và mặt hàng nhập khẩu: Thị trường nhập khẩu chính của công ty Phượng Hoàng là Singapore và Argentina, trong vài năm gần đây Phượng Hoàng cũng công ty chưa mở rộng thêm được sang các thị trường châu Âu mặc dù đã tiến hành nhập khẩu bánh kẹo được hơn 10 năm, thị trường châu Âu được đánh giá là thị trường lớn sản xuất bánh kẹo, sữa cao cấp. Trong khi môi trường trong nước cạnh tranh ngày càng gay gắt, các đối thủ của công ty
- Kim ngạch nhập khẩu chưa xứng tầm với khả năng của công ty Phượng Hoàng: kinh doanh nhập khẩu hơn 10 năm nhưng việc mở rộng thị trường nhập khẩu và mặt hàng của công ty Phượng Hoàng còn hạn chế, trong khi các đối thủ cạnh tranh của công ty đã nhanh chóng đa dạng hóa sản phẩm và dịch vụ cung ứng, tăng thêm sự lựa chọn cho người mua, gây sức ép lớn trong cạnh tranh, giảm lượng hàng bán ra của công ty. Việc chỉ tập trung vào một số mặt hàng truyền thống của mình sẽ khiến Phượng Hoàng khó mở rộng được hoặc tăng chậm KNNK trong các năm tiếp theo khi sẽ khó mở rộng sẽ không tận dụng được hết khả năng của công ty .
- Thiếu cán bộ nghiệp vụ giỏi, chưa triển khai được một số ứng dụng của TMĐT vào nghiệp vụ kinh doanh xuất nhập khẩu : hải quan điện tử
- Hình thức nhập khẩu chủ yếu là trực tiếp, công ty phải tự tiến hành các hoạt động nhập khẩu, tự lo chi phí cho các hoạt động, tốn kém nhiều công sức, tự chuẩn bị nguồn vốn cho hoạt động nhập khẩu
- Phương thức thanh toán chứa nhiều rủi ro cho mình: do phải thanh toán trước tiền hàng nên công ty phải chuẩn bị sẵn một lượng vốn để có thể nhập khẩu, nếu hàng hóa được giao không đúng về chất lượng, việc điều tra nguyên nhân, xử lý vi phạm tốn kém thời gian, gián đoạn công việc kinh doanh.
- Đồng tiền vay thanh toán tiền hàng nhập khẩu là VNĐ , trong khi hiện nay lãi suất VNĐ cao hơn USD, theo các chuyên gia nhận xét thì vay USD có lợi hơn trong ngắn hạn nhưng sợ rủi ro nên công ty vẫn vay VNĐ, chưa có phương án về ngoại tệ cho nhập khẩu, doanh nghiệp bị động.