Hiện nay, tới 80% nguyên liệu đầu vào cho ngành công nghiệp dược là nhập khẩu. Nguồn nguyên liệu trong nước chỉ đáp ứng 20% nhu cầu. Như vậy, ngành công nghiệp nước ta phụ thuộc khá lớn vào các công ty cung cấp nguyên liệu nước ngoài. Muốn phat triển ngành dược, trước tiên phải giảm bớt sự phụ thuộc này, cần phải có sự đầu tưđúng đắn cho việc bào chế công nghiệp các loại hóa dược.
Hiện nay, cả nước có 2 công ty có nhà máy sản xuất hóa dược, đó là SaoKim Pharma và Domesco Đồng Tháp. Tuy nhiên, lượng hóa dược sản xuất được còn ít về số lượng và chủng loại. Để xây dựng được nhà máy sản xuất hóa dược, công ty phải đầu tư một khoản tiền lớn để trang bị máy móc, nhà xưởng và nhân công. Như vậy, các công ty vẫn chưa khai thác triệt để các lợi ích của các nhà máy hóa dược. Nhà máy hóa dược
được xây dựng trước hết để phục vụ nhu cầu doanh nghệp và cung cấp nguyên liệu
đầu vào cho các công ty khác, sau đó sẽ tiến tới xuất khẩu. Nhưng hiện nay, các nhà máy hóa dược mới chỉ sản xuất theo nhu cầu doanh nghiệp mà chưa quan tâm đến nhu cầu của các công ty khác, số lượng các hóa dược sản xuất được còn ít. Từ đó, chi phí nguyên liệu đầu vào của doanh nghiệp giảm không đáng kể so với việc nhập khẩu nguyên liệu.
Việc xây dựng một hệ thống các nhà máy sản xuất hóa dược là cần thiết cho việc phát triển ngành công nghiệp dược. Các nhà máy phải được phân bố hợp lý giữa các vùng miền, tránh việc xây dựng các nhà máy này tập trung quá nhiều ở một nơi gây nên tình trạng thiếu ở khu vực này nhưng lại thừa ở khu vực khác. Bên cạnh đó, cần phải có những dự án quy hoạch cụ thể khu trồng nguyên liệu thô cung cấp cho các nhà máy này. Tuy nhiên, xây dựng thêm nhiều nhà máy sản xuất hóa dược không có nghĩa là xây dựng một các tràn lan. Khi lập dự án xây dựng các nhà máy sản xuất hóa dược, Nhà nước cần quản lý chặt chẽ, không nên giao cho các địa phương, các công ty thực hiện đại trà. Cần phải xét đến những điều kiện mà địa phương đó hiện có có phù hợp không. Ngành dược là một ngành có những yêu cầu khá khắt khe, vì thế cần quản lý chặt chẽ các nhà máy này đểđảm bảo chất lượng của các hóa dược.
Nước ta có một lượng lớn các cây dược liệu quý, đây chính là nguồn nguyên vật liệu chính cho các nhà máy sản xuất hóa dược. Tuy nhiên, việc trồng dược liệu còn mang tính manh mún, nhỏ lẻ, rải rác và tự phát nên chất lượng không đồng đều và số lượng không được ổn định qua các năm. Cần phải quy hoạch cụ thể khu vực trồng các loại dược liệu này nhằm tạo lập một nguồn nguyên vật liệu ổn định cho các nhà máy sản xuất hóa dược. Cần tránh việc quy hoạch bất hợp lý như chuyển đổi quá nhiều đất nông nghiệp trồng lương thực sang trồng dược liệu. Khu trồng dược liệu phải có giao thông thuận tiện, tránh việc phá rừng lấy đất trồng dược liệu.