Trong những mặt đã làm được để thực hiện mục tiêu tối đa hóa lợi nhuận của doanh nghiệp thông qua chi phí và lợi nhuận doanh nghiệp cũng gặp không ít khó khăn.
Mặc dù doanh nghiệp liên tục tăng doanh thu và lợi nhuận khi tăng quy mô, nhưng tỷ suất lợi nhuận của doanh nghiệp tăng lên lại giảm xuống chưa ổn định. Doanh nghiệp sử dụng vốn có hiệu quả thì tốc độ tăng chi phí chậm hơn tốc độ tăng doanh thu và lợi nhuận nhưng doanh nghiệp chỉ thực hiện được năm 2008 nhưng đến năm 2009 lại giảm xuống thấp hơn năm 2007. Cho thấy năm 2009 việc thực hiện sử dụng phân bổ chi phí chưa thật sự hiệu quả.
Bộ máy quản lý của doanh nghiệp có cơ cấu ngày càng phức tạp, dẫn đến hoạt động kém hiệu quả khiến cho chi phí về quản lý doanh nghiệp liên tục tăng. Chi phí trả lãi vay năm 2008 tăng do nền kinh tế bất ổn có nhiều biến động, doanh nghiệp phải huy động vốn với chi phí cao chính vì vậy doanh nghiệp không thể quản lý nguồn vốn hiệu quả. Mà ngày nay việc bất ổn của nền kinh tế luôn tục có những biến động, chính vì vậy doanh nghiệp cần phải sử dụng nguồn vốn kinh doanh có hiệu quả để giảm thiểu những rủi ro không đáng có cho doanh nghiệp. Sử dụng vốn không hiệu quả có thể khiến doanh nghiệp thua lỗ cũng như tăng chi phí, giá thành tăng lên, sức cạnh tranh giảm xuống.
Chi phí nhiên liệu luôn tục tăng lên cả về cơ cấu và cả số tiền. Do doanh nghiệp tăng quy mô nên việc sử dụng nguồn nhiên liệu tăng lên. Nhiên liệu giá luôn tục tăng doanh nghiệp khó có thể kiểm soát sử dụng nguyên liệu với chi phí giảm xuống. Chính vì vậy doanh nghiệp cần phải có cơ chế quản lý và sử dụng nguồn nhiên liệu hiệu quả. Đây cũng chính là khó khăn của doanh nghiệp trong việc giảm chi phí để giảm giá thành sản phẩm.
Chi phí dịch vụ mua ngoài tuy về cơ cấu giảm xuống nhưng số tiền vẫn tăng lên. Để sử dụng chi phí dịch vụ mua ngoài doanh nghiệp cần tính đến việc tự sản xuất hay thuê ngoài hay mua dịch vụ bên ngoài là một quyết định cần tính đến để xem chi phí doanh nghiệp bỏ ra có hiệu quả hơn hay sử dụng bên ngoài có hiệu quả hơn, đó cũng là vấn để doanh nghiệp cần phải quyết định một cách đúng đắn để giảm thiểu chi phí.
Chi phí nguyên vật liệu chiếm cơ cấu lớn trong doanh nghiệp thường nhiều nhất. Doanh nghiệp chưa thực hiện được việc cắt giảm chi phí nguyên vật liệu, tiết kiệm chi phí nguyên vật liệu sử dụng hiệu quả, tránh thất thoát… một doanh nghiệp nào cũng cần thực hiện điều này để giảm thiểu tối đa chi phí, nhằm tăng lợi nhuận.
Chi phí nhân công trực tiếp cũng ảnh hưởng không nhỏ tới tình hình thực hiện chi phí của doanh nghiệp, khó khăn đặt ra trong việc sử dụng lao động với mức tiền lương trả cho công nhân viên ngày càng tăng, khoản chi phí này tăng khá nhiều vào năm 2009, cơ cấu chi phí nhân công tăng lên, số tiền cũng tăng lên. Năm 2009 lên tới con số 603.049.261 đồng. Sử dụng cán bộ công nhân viên với số lượng trong sản phẩm in ấn ngày càng tăng lên, chi phí nhân công thực hiện khó thay thế bằng sức của máy móc. Nhằm nâng cao sức cạnh tranh doanh nghiệp đã thực hiện chính sách miễn phí toàn bộ chi phí thiết kế để có thể tăng số lượng khách hàng. Chính vì lý do này khiến doanh nghiệp ngày càng tăng chi phí trả lương cho nhân viên. Cắt giảm, giảm lương cho công nhân viên là một điều không thể thực hiện, mà trên thực tế các doanh nghiệp luôn phải tăng lương, chính vì vậy phải sử dụng số tiền đầu tư của mình một cách hiệu quả. Tạo môi trường làm việc tốt cho cán bộ công nhân viên làm việc hiệu quả. Chế độ thăng tiến đảm bảo không bị sai sót hay có những hành vi không đúng gây mâu thuẫn giữa đồng nghiệp. Và hơn nữa việc tuyển chọn và đào tạo ra đội ngũ nhân viên kinh nghiệm và gắn bó với công ty là một điều mà doanh nghiệp nào cũng muốn thực hiện nhưng đó là một khó khăn của doanh nghiệp vì quy mô doanh nghiệp nhỏ chưa đủ để có môi trường thăng tiến tốt cho nhân viên công ty.
Chính những điều không thực hiện được của doanh nghiệp khiến doanh nghiệp chưa đạt được mức chi phí tối thiểu để tối đa hóa lợi nhuận. Doanh nghiệp cũng chưa sản xuất được ở sản lượng tối ưu, tại sản lượng Q = 249519 (chiếc) nhằm đạt lợi nhuận tối đa.