- Chuyên hỗn hợp dung dịch lên cột thơi gel, li tâm cực đại 1 phút, đỗ địch chảy
263 TGGTAAGTGC ACARACAGCAA GTGGTTTCTG GTACCTTGTA CACCATCACT KPS1 TGGTAAGTGC ACAACAGCAA GTGGTTTCTG GIACCTTGTA CACCATCACT
KPS1 TGGTAAGTGC ACAACAGCAA GTGGTTTCTG GIACCTTGTA CACCATCACT “+ + + * | kv k2 + *** | +3 + + ** | ++ + z + + | 2 ++ 2l...
160 170 180 190 290
DX208 TTIGGAGGCAA AAGATGGTGG GCARAAAGAAG GTTTATGAAG CCAAAGTCTG PAEC3 TTGGAGGCAA AAGATGGTGG GCAAAAGAAG GITTATGAAG CCAAAGTCTG PAEC3 TTGGAGGCAA AAGATGGTGG GCAAAAGAAG GITTATGAAG CCAAAGTCTG AF454396 TTGGAGGCAA AAGATGGTGG GCAAAAGAAG GITTATGAAG CCAAAGTCTG KP11 TTGGAGGCAA AAGATGGTGG GCAAAAGAACG GTITTATGAAG CCAAAGTCTG MN93 TTIGGAGGCAA AAGATGGTGG GCARAAAGAAG GTTTATGAAG CCAAAGTCTG 263 TTIGGAGGCAA AAGATGGTGG GCARAAAGAAG GTTTATGAAG CCAAAGTCTG KPS1 TTGGAGGCAA AAGATGGTGG GCAAAAGAAG GITTATGAAG CCAAAGTCTG
kị + + | kị ‡ + +} * | vs +‡* z*** | se + z + + | 2 +++2 |...
210 220 230 240 250
DX208 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTTG PAEC3 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTITG PAEC3 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTITG AF454396 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTITG KP11 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTTG MN93 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTTG 263 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCARAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGTTG KPS1 GGAGAAGCCA TGGTTGAACT TCAAGGAGCT GCAAGAGTTC AAACTTGITG
-|..-- | -l..« 260
DX208 GAGAGGCACC TGCATACG
PAEC3 GAGAGGCACC TGCATACG
AEF454396 GAGAGGCACC TGCATAG
KP1I1 GAGAGGCACC TGCATAG
MN93 GAGAGGCACC TCGCATAG
263 GAGAGGCACC TGCATAG
KPS1 GAGAGGCACC TGCATAG
TGGTAAGTGC ACARACAGCAA GTGGTTTCTG GTACCTTGTA CACCATCACT
Hình3.1 6. So sánh trình tự vùng mã hĩa của gen cystatin ở 7 giống đậu xanh
Do trình tự nucleotide ở vùng mã hĩa giống nhau 100% nên trình tự amino acid của 7 giống đậu xanh so sánh ở trên cũng giống nhau 100%. Chiều đài
protein cystatin của các giống đậu xanh so sánh ở trên là 88 amino acid. Vì vậy chúng tơi kết luận: khơng cĩ sự khác biệt về trình tự amino acid của hai giống DX208 (chịu hạn tốt) và PAEC3 (chịu hạn kém). Kết quả thể hiện ở hình 3. 17.
10 20 30 40 50
DX208 MSOELESVEI DSLARFAVEE HNKKONALLE FGRVVSAOOO VVSGTLYTTT
PAEC3 MSQELESVEI DSILARFAVEE HNKKONALLE EFGRVVSAOOO VVSGTLYTITT
263 MSOELESVEI DSLARFAVEE HNKKONALLE FGRVVSAOOO VVSGTLYTTT
KP11 MSOELESVEI DSLARFAVEE HNKKONALLE FGRVVSAOOO VVSGTLYTTT
KPS1 MSOELESVEI DSLARFAVEE HNKKONALLE FGRVVSAOOO VVSGTLYTTT
MN93 MSOFELESVEI DSILARFAVEE HNKKONALLE FGRVVSAOOO VVSGTLYTTT
AF454396 MSOELESVEI DSLARFAVEE HNKKONALLE EGRVVSAOOO VVSGTLYTIT
.]..--l ¬"= .|...-l .J.«-
60 70 80
DX208 LEAKDGGOKK VYEAKVWEKP WILNFKELOEF KLVGEAPA
PAEC3 LEAKDGGOKK VYEAKVWEKP WLNEKELOEE KLVGEAPA
263 LEAKDGGOKK VYERAKVWEKP WLNFKELOEEF KLVGEAPA
KP11 LEAKDGGOKK VYERAKVWEKP WLNFKELOEEF KLVGEAPA
KPSI LEAKDGGOKK VYEAKVWEKP WILNFKELOEF KLVGEAPA
MN93 LEAKDGGOKK VYEAKVWEKP WILNFKELOEF KLVGEAPA
AF454396 LEAKDGGOKK VYEAKVWEKP WLNEKELOEE KLVGEAPA
Hình3.1 7. So sánh trình tự amino acid của DX208, PAEC3, KP11, KPS1, MN93, 263, AF454396
Số hĩa bởi Trung tâm Học liệu — Đại học Thái Nguyên 50
Các kết quả thu được ở trên cho thấy, chưa cĩ mối liên quan giữa tính
trạng chịu hạn với trình tự nucleotide của gen cystatin. Vì vậy, cần nghiên cứu về promotor và trình tự nucleotide của nĩ trong điều kiện hạn để cĩ thể xác định
được chỉ thị phần tử liên quan đến tính chịu hạn của cây đậu xanh.
51