Bên cạnh những ưu điểm trên thì công tác hạch toán chi phí của Công ty vẫn còn một số hạn chế cần phải khắc phục để góp phần hoàn thiện hơn công tác hạch toán chi phí nói riêng và công tác hạch toán kế toán nói chung. Sau đây là một số điểm hạn chế còn tồn tại tại Công ty:
Về Bộ máy kế toán tại Công ty:
Tại Công ty vẫn chưa phân tách được chức năng tài chính trong phòng kế toán. Chức năng tài chính chủ yếu do kế toán trưởng thực hiện còn các nhân viên chỉ thực hiện công tác kế toán đơn thuần. Mảng tài chính là một mảng rất quan trọng, việc phân tích các chỉ tiêu tài chính sẽ giúp cung cấp đầy đủ hơn tình hình tài chính của Công ty đồng thời đưa ra các quyết định đúng đắn. Thêm nữa trong bộ máy kế toán chưa có bộ phận kiểm tra và kiểm toán
nội bộ, do vậy Công ty khó kiểm soát công tác kế toán của mình trong thời gian dài cũng như có cái nhìn toàn diện hơn về Công ty giúp phát hiện những khuyết điểm trong bộ máy kế toán của mình.
Về hệ thống tài khoản sử dụng:
Hệ thống tài khoản Công ty sử dụng là theo quyết định 15/3/2006/QĐ- BTC là hoàn toàn phù hợp nhưng bên cạnh đó một số tài khoản cần được mở chi tiết như: TK 621 vẫn chưa được mở chi tiết cho NVL chính và NVL phụ, vẫn gộp chung chi phí vật liệu và công cụ dùng cho phân xưởng vào tiểu khoản chi phí dich vụ mua ngoài và chi phí khác bằng tiền. Mặc dù việc hạch toán như trên là không gây ra sai lầm trong việc tính tổng chi phí và tính giá thành sản phẩm nhưng như vậy là chưa đúng với nguyên tắc, mặt khác theo dõi thông tin không rõ ràng, chi tiết.
Về phương pháp hạch toán và tập hợp chi phí:
Đối với NVL xuất kho được tính giá theo phương pháp trung bình tháng làm cho công việc tính giá sẽ dồn vào cuối kỳ nên ảnh hưởng đến tiến độ các khâu kế toán khác, làm mất đi sự linh hoạt trong việc áp dụng các phương pháp tính giá xuất
Đối với hạch toán chi phí nhân công trực tiếp kế toán đã không tiến hành trích trước lương phép cho công nhân sản xuất, điều này dẫn đến việc việc hạch toán chi phí và tính giá thành sẽ không hợp lý, kỳ nào công nhân nghỉ nhiều hay ít thì tiền lương sẽ tăng hoặc giảm tương ứng một mặt sẽ ảnh hưởng đến chi phí và giá thành sản phẩm một mặt sẽ ảnh hưởng đến việc cung cấp thông tin cho các nhà quản trị để đưa ra chính sách về giá cả và tiêu thụ sản phẩm của Công ty.
Trong hạch toán chi phí sản xuất chung, Công ty Cổ phần Đầu Tư và Xây Dựng Tiền Hải đã lựa chọn phương pháp tính khấu hao theo đương thẳng. Với phương pháp này thì số khấu hao hàng năm không thay đổi trong
suốt thời gian sử dụng hữu ích của tài sản. Nhưng bên cạnh những ưu điểm của nó thì còn có nhược điểm là thu hồi vốn chậm, do đó việc đầu tư TSCĐ không kịp thời làm cho TSCĐ sẽ bị lạc hậu, không đáp ứng được nhu cầu trong sản xuất kinh doanh. Mặt khác, khấu hao lại được tính theo tròn tháng dẫn đến không phản ánh đúng bản chất và giá trị hao mòn của tài sản cố định, không thấy được một cách chính xác tình hình biến động tăng giảm TSCĐ trong tháng và đặc biệt là không theo qui định của nhà nước.
Về việc đánh giá sản phẩm dở dang cuối kỳ:
Đánh giá sản phẩm làm dở là một phần rất quan trọng, ảnh hưởng lớn đến việc tổng hợp chi phí và tính giá thành sản phẩm, cung cấp thông tin cho các nhà quản trị. Trong trường hợp tính giá thành sản phẩm sai làm cho các nhà quản lý đưa ra những chiến lược, những chính sách sai lệch ảnh hưởng xấu đến hoạt động sản xuất kinh doanh của Công ty. Tại Công ty Cổ phần Đầu Tư và Xây Dựng Tiền Hải, đã không đánh giá sản phẩm làm dở tuy thuận tiện cho kế toán nhưng nó không đảm bảo sự chính xác các khoản chi phí thực tế tính vào giá thành, dẫn đến các quyết định sai về giá bán.
Về việc tính giá thành sản phẩm hoàn thành
Công ty Cổ phần Đầu Tư và Xây Dựng Tiền Hải đã áp dụng việc tính giá thành theo phương pháp trực tiếp. Cũng như các phương pháp khác, trong bản thân phương pháp này chứa đựng những ưu điểm và những hạn chế nhất định. Đây là phương pháp đơn giản, dễ tính toán nhưng không hợp lý vì phương pháp này chỉ thích hợp với những doanh nghiệp mà quá trình sản xuất mang tính đơn chiếc (chỉ sản xuất 1 loại sản phẩm). Trong khi đó, Công ty lại sản xuất đa dạng hoá các sản phẩm với cùng một quy trình công nghệ sản xuất 8 loại sản phẩm với mẫu mã và kích thước khác nhau.
Về việc lập và ghi sổ sách kế toán :
Công ty chưa thực hiện việc lập, ghi sổ theo đúng chế độ cho phù hợp với hình thức sổ Nhật ký chứng từ mà Công ty đã lựa chọn. Công ty đã lập các sổ chi tiết tài khoản 621, 622, 627 thay cho việc lập các Bảng kê.