Cơ cấu nhóm thuốc điều trị gồm: 20 nhóm thuốc hóa dược, 07 nhóm thuốc đông y, thuốc từ dược liệu.
+ Nhóm thuốc điều trị ký sinh trùng, chống nhiễm khuẩn chiếm tỷ lệ cao nhất với 61 KM, giá trị sử dụng 2.114.329.246 đồng, chiếm tổng GTSD 48,52%.GTSD nhóm thuốc này cao hơn nhiều so với Trung tâm Y tế huyện Pác Nặm ,tỉnh Bắc Cạn với 76 KM, chiếm 44,80% GTSD [18].
+ Nhóm thuốc dung dịch điều chỉnh nuớc, điện giải, cân bằng Acid-Base và các dung dịch tiêm truyền khác với 27 KM (9,96%), có giá trị sử dụng 313.098.157 đồng, chiếm 7,19%, điều này hoàn toàn tương ứng với
MHBT tại TTYT chủ yếu là bệnh nhân mắc các bệnh về rối loại cân bằng điện giải.Tỷ lệ nhóm thuốc này cao hơn so với Bệnh viện đa khoa huyện Thuận Châu, tỉnh Sơn La với 23 KM, chiếm 4,62% GTSD [27], và Bệnh viện đa khoa huyện Bắc Yên, tỉnh Sơn La với 21 KM, chiếm 2,67% GTSD [14].
+ So sánh với các nghiên cứu khác, tỷ lệ sử dụng kháng sinh tại các bệnh viện thì tỷ lệ sử dụng kháng sinh tại Trung tâm Y tế huyện Mường Chà là 2.114.329.246 đồng.Kết quả sử dụng kháng sinh tại Trung tâm thấp hơn nhiều so với Bệnh viện đa khoa huyện Thuận Châu, tỉnh Sơn La năm 2018 là 61 KM chiếm 4.959.884.784 đồng, cao hơn Trung tâm Y tế huyện Pác Nặm, tỉnh Bắc Cạn năm 2018 là 2.056.188.000 đồng.
Sử dụng kháng sinh luôn là một vấn đề được quan tâm đặc biệt tại các bệnh viện, việc tập trung một tỷ lệ lớn thuốc cũng như kinh phí sử dụng cho nhóm thuốc điều trị ký sinh trùng, chống nhiễm khuẩn là do nhu cầu điều trị một tỷ lệ lớn các bệnh nhiễm trùng, bệnh về hô hấp trong mô hình bệnh tật của Việt Nam nói chung cũng như mô hình của Trung tâm nói riêng. Mặt khác còn cần sử dụng nhóm thuốc này trong nhiều bệnh khác như các trường hợp tai nạn thương tích, phòng nhiễm khuẩn trước và sau phẫu thuật. Tại Trung tâm Y tế huyện Mường Chà bên cạnh điều trị những bệnh nhiễm khuẩn bệnh viện còn tiếp nhận nhiều ca cấp cứu các huyện lân cận chuyển lên, phần nào giải thích cho nhu cầu sử dụng nhiều kháng sinh điều trị tại Trung tâm.
Các nhóm thuốc có số lượng KM nhiều đã và đang tạo điều kiện thuận lợi cho bệnh nhân đến điều trị, cũng như các bác sĩ trong việc lựa chọn thuốc. Nhưng cũng gây ra khó khăn cho Khoa dược vì phải cung ứng nhiều mặt hàng cùng một lúc, kèm theo đó là các vấn đề liên quan đến việc mua sắm, thủ tục hồ sơ, theo dõi, bảo quản và cấp phát.