- Về bộ máy quản lý của chính quyền huyện Diễn Châu:Chính quyền huyện Diễn Châu chưa làm tốt khâu tuyển dụng và chưa sắp xếp bộ máy cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất một cách hợp lý, chất lượng và số lượng cán bộ chưa đủđể đáp ứng khối lượng của việc cáp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất trên địa bàn huyện. Đội ngũ cán bộ chuyên môn ở xã, chủ yếu là trung cấp, đại học tại chức, có một số đơn vị chưa có chuyên môn, nên việc nắm bắt thực hiện, áp dụng luật chưa thực sự nhuần nhuyễn.
- Một số hộ gia đình, cá nhân không tiến hành KKĐK vì những lý do như chưa có nhu cầu sử dụng đến GCN, chưa hiểu rõ được tầm quan trọng của GCN, ngại làm thủ tục cấp GCN do phải đến nhiều cơ quan và phải đi lại nhiều lần
- Khó khăn trong việc kiểm tra xác nhận nguồn gốc sử dụng đất, không có hồ sơ xác định chính xác thời điểm sử dụng đất.
- Đang còn xảy ra việc tranh chấp đất đai giữa xã và huyện lân cận do chưa xác định được rõ địa giới hành chính
- Phần diện tích sai lệch do thời gian trước chưa áp dụng khoa học kỹ thuật chủ yếu là đo bằng thước dây gây ra sai lệch so với số liệu đo bằng máy. Điều này làm cho quá trình rà soát, xác minh, giải trình mất thời gian.
- Hệ thống các trang thiết bị, máy móc phục vụ cho công tác quản lý đất đai còn thiếu thốn, lạc hậu.
- Người dân chưa nắm rõ hay thiếu thông tin về việc làm thủ tục cấp GCN, giới hạn về trình độ của người dân mặc dù cán bộđã hướng dẫn cụ thể nhưng vẫn có
sai sót trong lập hồ sơ. Tinh thần trách nhiệm của người dân không cao trong việc bổ sung hồ sơđể cấp GCN