Hình 4. Kết quả PCR với ORF75 của các mẫu WSSV trên tôm sú
M: thang chuẩn (1 kb) a. ORF75
Các mẫu WSSV trích từ tôm sú thể hiện 2 kiểu kích thước PCR khác nhau là 500 bp và 460 bp với tỉ lệ tương ứng là 58% và 42% (bảng 5), và có sự hiện diện kiểu kích thước đặc trưng của từng ao. Điều này cho thấy có sự tương đồng về kích thước PCR ở ORF75 của các mẫu WSSV trong cùng một ao. Riêng ở ao HD2 thể hiện cả 2 kiểu kích thước với tỉ lệ bằng nhau mà không thể hiện được kiểu gen đặc trưng do số lượng mẫu còn hạn chế và mặt khác cũng thể hiện sự đa dạng của WSSV trong phạm vi cùng một ao có thể tồn tại cùng lúc nhiều chủng WSSV khác nhau. Trong đó chủng WSSV
ưu thế trong ao sẽ thể hiện tỉ lệ nhiều hơn. Khi so sánh các mẫu WSSV trên tôm sú giữa các ao khác nhau ta thấy mỗi ao có kiểu kích thước đặt trưng cho thấy sự biến đổi của các mẫu WSSV trên ORF75 ở các ao khác nhau mang tính ngẫu nhiên cao. Như vậy khi ta sử dụng ORF75 để khảo sát các mẫu WSSV trên các cá thể tôm sú khác nhau thì có thể tìm ra chủng WSSV đặc trưng trong phạm vi ao.
b. ORF94
Ở ORF94 có sự biến động tương đối lớn về kiểu gen giữa các mẫu WSSV trích trên tôm sú ở các ao khác nhau, ở các ao không có kiểu gen đặc trưng, chỉ có duy nhất ao S-HD4 là có cùng kiểu gen trên tất cả các mẫu trong cùng ao (bảng 5). Như vậy sự biến đổi về kiểu gen ở ORF94 mang tính ngẫu nhiên thể hiện sự biến đổi mạnh ở ORF nầy, vì vậy không thể sử dụng ORF94 để nghiên cứu sự đa dạng của các chủng WSSV trên tôm sú trong phạm vi ao hay huyện.
c. ORF125
Kết quả thể hiện ở bảng 5 cho thấy có sự biến đổi về kiểu gen ở ORF125 giữa các mẫu WSSV trích từ tôm sú ở các ao khác nhau trong cùng huyện và có thể hiện kiểu gen đặc trưng trong từng ao (bảng 5), do đó ORF125 có khă năng được sử dụng như dấu phân tử để nghiên cứu sự khác biệt di truyền của các mẫu WSSV trên tôm sú phạm vi huyện thông qua kiểu gen đặc trưng của từng ao.