PHẦN 4: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN
4.3. Kết quả phân tích gene psbA-trnH
- Genes psbA-trnH có mặt trong DNA lục lạp, là vùng không mã hóa cho protein nào ,khu vực không được phiên dịch psbA 3 ' và RNA cấu trúc thứ cấp. Khu vực này gồm 2 phần khác nhau để bảo tồn tiến hóa của chúng, 1 là đầu 3' của psbA (khu vực không được phiên mã) và 2 là psbA-trnH gồm 2 genes và những hoạt động của nó không phiên mã đệm. 4.3.1. Kết quả xếp thẳng hàng Phương pháp Maximum Likelihood Neighbor- Joining Minimum- Evolution UPGMA Maximum Parsimony Kết nhóm 7/8 7/8 6/8 7/8 7/8 Tỷ lệ % 87.5% 87.5% 75% 87.5% 87.5%
- Kết quả sắp xếp thẳng hàng cho 8 loại Panax của vùng gene psbA-trnH có độ dài là 445 ký tự.
4.3.2. Kết quả phân tích mô hình tiến hóa
- Bảng phân tích dữ liệu bằng mô hình tiến hóa của vùng gene psbA-trnH cho ta thấy được giá trị -lnL nhỏ nhất là -3241.438 . Tương ứng với giá trị -lnL vừa có được ta xác định được mô hình tiến hóa tương thích là K2.
4.3.3. Kết quả phân tích phát sinh chủng loài
4.3.3.1. Kết quả phân tích của phương pháp Maximum Likelihood
Kết quả
- Đối với gene psbA-trnH, cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp Maximum Likelihood thì có
+ 4 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax pseuoginseng, Panax stipuleanatus.
+ 4 loài chưa gom nhóm: Panax bipinnatifidus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng
4.3.3.2 Kết quả phân tích của phương pháp Neighbor-Joining
Kết quả
- Đối với gene psbA-trnH, cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp Neighbor-Joining thì có
+ 3 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax stipuleanatus.
+ 5 loài không kết nhóm: Panax bipinnatifidus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng, Panax pseuoginseng
4.3.3.3 Kết quả phân tích của phương pháp Minimum-Evolution
Kết quả
- Đối với gene psbA-trnH, cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp Minimum-Evolution thì có
+ 3 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax stipuleanatus.
+ 5 loài không kết nhóm: Panax bipinnatifidus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng, , Panax pseuoginseng
4.3.3.4. Kết quả phân tích của phương pháp UPGMA
Kết quả
- Đối với gene psbA-trnH, cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp UPGMA thì có
+ 4 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax stipuleanatus, Panax pseuoginseng
+ 4 loài không kết nhóm: Panax bipinnatifidus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.3.3.5 Kết quả phân tích của phương pháp Maximum-Parsimony
Kết quả
- Đối với gene psbA-trnH, cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp Maximum-Parsimony thì có
+ 4 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax stipuleanatus, Panax pseuoginseng
+ 4 loài không kết nhóm: Panax bipinnatifidus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.4. Biện luận
Đối với gene psbA-trnH qua 5 phương pháp xây dựng cây phát sinh chủng loài ta có
Ta có thể lấy giá trị chung cho việc phân định các loại nhân sâm qua khảo sát bằng gene psbA-trnH là 4/8 bằng 50% tổng số mẫu khảo sát Phương pháp Maximum Likelihood Neighbor- Joining Minimum- Evolution UPGMA Maximum Parsimony Kết nhóm 4/8 3/8 3/8 4/8 4/8 Tỷ lệ % 50% 37.5% 37.5% 50.% 50%