PHẦN 4: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN
4.2. Kết quả phân tích vùng gene ITS
- ITS(for internal transcribed spacer) là một vùng không có chức năng RNA và nằm giữa cấu trúc RNA ribosome ( rRNA )
4.2.1. Kết quả sắp xếp thẳng hàng
- Kết quả sắp xếp thẳng hàng cho 8 loại Panax của vùng gene ITS có độ dài là 623 ký tự
- Bảng phân tích dữ liệu bằng mô hình tiến hóa của vùng gene ITS cho ta thấy được giá trị -lnL nhỏ nhất là -3771.172. Tương ứng với giá trị -lnL vừa có được ta xác định được mô hình tiến hóa tương thích là JC+G (Jukes – Cantor + Gamma).
4.2.3. Kết quả phân tích phát sinh chủng loài
4.2.3.1. Kết quả phân tích của phương pháp Maximum Likelihood
Kết quả
- Đối với gene ITS cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp Maximum Likelihood thì có
+ 7 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax pseuoginseng, Panax stipuleanatus. Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.2.3.2 Kết quả phân tích của phương pháp Neighbor-Joining
Kết quả
- Đối với vùng gene ITS bằng phương phápNeighbor-Joining thì có
+ 7 loài Panax có thể kết nhóm lại vói nhau : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax pseuoginseng, Panax stipuleanatus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.2.3.3 Kết quả phân tích của phương pháp Minimum-Evolution
Kết quả
- Đối với vùng gene ITS bằng phương pháp Minimum-Evolution thì có :
+ 6 loại được kết nhóm: Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax pseuoginseng, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.2.3.4 Kết quả phân tích của phương pháp UPGMA
Kết quả
- Đối với vùng gene ITS, cây phát sinh chủng loài được dưng bằng phương pháp UPGMA thì có:
+ 7 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax pseuoginseng, Panax stipuleanatus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.2.3.5 Kết quả phân tích của phương pháp Maximum-Parsimony
Kết quả
- Đối với vùng gene ITS, cây phát sinh chủng loài được dựng bằng phương pháp Maximum-Parsimony thì có
+ 7 loài Panax : Panax notoginseng, Panax trifolus, Panax pseuoginseng, Panax stipuleanatus, Panax japonicus, Panax quinquefolius, Panax ginseng.
4.2.4. Biện luận
Đối với vùng gene ITS qua 5 phương pháp xây dựng cây phát sinh chủng loài ta có
Ta có thể lấy giá trị chung cho việc phân định các loại nhân sâm qua khảo sát bằng vùng gene ITS là 7/8 bằng 87.5% tổng số mẫu khảo sát .