Trong giai đoạn từ năm 2000 - 2015. Mỗi tháng, trung bình lượng hàng hoá qua cảng đạt khoảng 110 000 -120 000 TEU tương đương với 2,5 triệu tấn thông qua mỗi năm, doanh thu hàng năm tại Cảng đạt từ 75 - 80 tỷ đồng, trở thành một trong những doanh nghiệp top đầu của Tổng công ty Hàng Hải Việt Nam về hiệu quả kinh tế và hiệu quả đầu tư.
Khối lượng hàng hoá thông qua cảng Transvina giai đoạn 2010 - 2015
Tuy nhiên càng về sau, nhiều Cảng khai thác tàu Container khác lần lượt ra đời với công nghệ xếp dỡ hiện đại hơn, cầu tàu rộng hơn, bãi container lớn hơn và gần thượng nguồn hơn như Cảng Đoạn Xá, Cảng Green Port, Cảng Nam Hải. Chính vì vậy mà thị phần của Cảng Transvina càng ngày càng giảm đi.
Trong giai đoạn 2015 - 2017, lượng hàng hoá qua Cảng giảm dần, sản lượng Cảng hiện nay theo thống kê chỉ còn khoảng 80 - 90 nghìn TEU mỗi tháng. Tàu làm hàng tại Cảng chủ yếu là tàu hàng nội địa, sà lan. Các tàu nước ngoài hầu như vào các cảng mới xây dựng tại khu vực phía Đình Vũ, vì luồng sâu hơn, hành trình từ cầu cảng ra biển được rút ngắn hơn, mặt khác hiện nay khu vực Đình Vũ đã được kết nối với hệ thống giao thông quốc gia như hệ thống đường cao tốc, đường 5A, đường 5B, đồng thời các bãi Logictics phần lớn đều được xây dựng tập trung ở khu vực này.
Các tàu cập Cảng chủ yếu là sà lan, tàu nội địa dẫn đến kết quả sản xuất kinh doanh của Cảng giảm mạnh. Hiện giờ doanh thu của Cảng Transvina chỉ khoảng 53-60 tỷ đồng/năm, đồng thời làm cho lợi nhuận giảm đi.
Năm 2017-2018, Cảng vẫn đang gặp nhiều khó khăn vì lượng tàu vào cảng rất ít chỉ còn
một vài tàu nhỏ, chủ yếu làm hàng chuyển tải sà lan từ cảng Cái Lân về Hải Phòng với giá cước rất thấp. Để khắc phục tình trạng hiện nay, Cảng đang trình Cục Hàng Hải để kiểm định, nâng cấp và tiếp nhận tàu có tải trọng lớn hơn vào để xếp dỡ hàng hoá. Đồng thời Cảng cũng cố gắng duy trì cân bằng thu chi và đảm bảo công việc cho cán bộ công nhân viên.