Về mặt quản lý, bộ máy quản lý của công ty được tổ chức gọn nhẹ, thực hiện chuyên môn hoá cao, không ngừng nâng cao trình độ cho cán bộ, công nhân viên.Công ty có bộ máy kế toán làm việc hiệu quả. Từng cá nhân có trách nhiệm cao đối với phần hành kế toán mà mình đảm nhận. Trong bộ máy kế toán có sự
phân công công việc rõ ràng, không có sự trồng chéo trong quản lý, điều hành và trong công tác hạch toán.
Mỗi nhân viên trong phòng có nhiệm vụ theo dõi từng đối tượng kế toán riêng theo trình tự cả về trách nhiệm, quyền lợi và nghĩa vụ đồng thời tiến hành kế toán theo dõi cho đối tượng đó, chịu trách nhiệm về công tác kế toán khi có vấn đề xảy ra. Tinh thần trách nhiệm, ý thức về công việc cao, có tính chuyên môn hoá. Công ty có phần mềm kế toán riêng biệt đó là phần mềm kế toán dùng cho công tác kế toán tại đơn vị hàng hải. Phần mềm có tính năng phù hợp với lĩnh vực hoạt động kinh doanh của công ty.
Công ty đã sử dụng hệ thống tài khoản kế toán theo quy định hiện hành của nhà nước và được chi tiết cho từng loại làm cho các doanh nghiệp, nhà đầu tư dễ dàng đọc báo cáo hơn. Hệ thống tài khoản sử dụng thống nhất làm căn cứ để lập các báo cáo theo quy đinh hiện hành của nhà nước. Mỗi một phần hành đều được xây dựng một hệ thống tài khoản riêng, các tài khoản này có mối liên hệ mật thiết với nhau.
Công ty áp dụng hình thức sổ Chứng từ ghi sổ rất phù hợp cho công tác kế toán vận dụng phần mềm kế toán, phương pháp kiểm kê định kỳ và nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ kết hợp việc kiểm kê vào cuối mỗi năm nên rất phù hợp với chính sách kế toán hiện tại của công ty. Việc luân
chuyển sổ sách chứng từ giữa các bộ phận được thực hiện nhanh chóng tạo điều kiện cho việc tập hợp chi phí, tính giá thành được đầy đủ,chính xác.