1. Quy hoạch cụm cảng thành phố Hồ Chí Minh đến năm 2020 cơ bản phù hợp với quy hoạch chung của thành phố đến năm 2020 được phê duyệt trong quyết định số 123/1998/QĐ-TTg ngày 10/7/1998 của Thủ tướng Chính phủ và phù hợp với quy hoạch nhĩm cảng biển thành phố Hồ Chí Minh- Đồng Nai-Bà RịaVũng Tàu (nhĩm số 5).
2. Cụm cảng khu vực thành phố Hồ Chí Minh bao gồm khu cảng Sài Gịn (sơng Sài Gịn), khu cảng Nhà Bè (sơng Nhà Bè), khu cảng Cát Lái (sơng Đồng Nai), khu cảng Hiệp Phước (sơng Sồi Rạp). Cụm cảng Hiệp Phước và cụm cảng Cát Lái sẽ là các cảng chính phục vụ trực tiếp việc xuất nhập khẩu hàng hĩa bằng đường biển của thành phố Hồ Chí Minh.
Dự kiến cơng suất cụm cảng vào năm 2020 đạt 35,1 triệu tấn/năm và khoảng 326 ngàn lượt hành khách/năm. Quy mơ các khu cảng Sài Gịn, khu cảng Nhà Bè, khu cảng Cát Lái chỉ đáp ứng cho tầu chở Container 15000- 20000 DWT, tầu bách hĩa, hàng rời 20000-25000 DWT, tàu chở hàng lỏng đến 30000 DWT, tàu khách đến 50000 GRT; cảng Hiệp Phước cĩ thể đáp ứng cao hơn.
• Các cảng trên tồn đoạn sơng Sài Gịn khơng mở rộng phát triển thêm, cĩ kế hoạch di dời cụ thể cho từng giai đoạn. Trước mắt giai đoạn từ nay đến năm 2010 di dời các cảng Nhà Rồng, Khánh Hội, Tân Cảng; riêng Tân Cảng đề nghị hồn thành việc di dời sớm hơn (vào khoảng năm 2006- 2007).
• Đầu tư xây dựng phát triển khu cảng Cát Lái, khu cảng Hiệp Phước phục vụ di chuyển các cảng trong nội thành và đáp ứng nhu cầu xuất nhập khẩu hàng hĩa của khu vực, các khu cơng nghiệp, khu chế xuất sau cảng, các nhà máy, cơ sở sản xuất ven sơng Đồng Nai, sơng Nhà Bè, sơng Sồi Rạp.
• Khu cảng Nhà Bè chủ yếu phục vụ cho nhu cầu nhập xăng dầu của thành phố Hồ Chí Minh và các vùng phụ cận. Đồng thời sẽ xây dựng cảng tổng hợp Nhà Bè phục vụ việc di chuyển các cảng trong nội thành và phục vụ khu cơng nghiệp Nhà Bè sau này.
• Xây dựng một bến tàu khách 50000 GRT tại trung tâm khu bến Nhà Rồng-Khánh Hội.
• Nghiên cứu xây dựng bến canơ, tàu khách tại Cần Giờ phục vụ du lịch và khai thác tuyến Vũng Tàu-Cần Giờ-thành phố Hồ Chí Minh. Việc xây dựng phải gắn với việc bảo tồn khu rừng sinh thái ngập mặn ở huyện Cần Giờ và hành lang ven sơng Lịng Tàu-Nhà Bè.