Từ năm 1989 Việt Nam bắt đầu xuất khẩu gạo với số lợng lớn, nhanh chóng chiếm đợc vị trí là một trong những nớc xuất khẩu gạo lớn nhất trên thế giới. Xuất khẩu gạo tăng nhanh cả về số lợng và kim ngạch, chất lợng gạo đã có những tiến bộ. Một trong những yếu tố dẫn đến kết quả trên là chúng ta đã có cơ chế đièu hành xuất khẩu gạo. Cơ chế này đợc hoàn thiện liên tục qua từng năm. Trong đó, Nhà nớc thực hiện tổ chức thu mua gạo xuất khẩu thông qua các đầu mối xuất khẩu, và hạn ngạch xuất khẩu gạo, nhằm điều tiết lợng gạo xuất khẩu.
Nhà Nớc phân bổ đầu mối cho các tỉnh vùng lúa, Nhà Nớc can thiệp trực tiếp vào hoạt động xuất khẩu gạo nhằm thực hiện nguyên tắc u tiên hàng đầu cho mục tiêu an ninh lơng thực quốc gia. Ngoài ra Chính Phủ còn phân bổ hạn ngạch cho các tỉnh vùng lúa, uỷ nhiệm cho lãnh đạo các tỉnh điều hành và quản lý nhằm đảm bảo cơ chế xuất khẩu gạo đợc linh hoạt hơn.
Nhiều năm qua đầu mối xuất khẩu gạo là một điểm nóng trong hoạt động xuất khẩu gạo. Thời gian đầu, nhiều Doanh nghiệp nhà nớc tìm mọi cách để đợc trực tiếp xuất khẩu gạo. Nhiều hoạt động tranh mua tranh bán trong nớc thơng nhân nớc ngoài lợi dụng để ép giá, ép cấp gây tổn hại lợi ích quốc gia trong xuất khẩu gạo. Nhằm khắc phục
tình trạng cạnh tranh tự phát hỗn loạn, năm 1992 Bộ Thơng Mại không chỉ quyết định mức giá tối thiểu mà còn cùng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn chủ trơng tinh giảm số doanh nghiệp nhà nớc đợc phép xuất khẩu gạo nhằm nâng cao trình độ tập trung hoá và chuyên môn hoá xuất khẩu, tăng sức cạnh tranh trên thị trờng thế giới. Tuy nhiên trong quá trình thực hiện có nhiều trở ngại phức tạp nảy sinh. Tuy Nhà Nớc quy tụ đợc phần lớn (khoảng 70%) lợng gạo xuất khẩu vào số ít doanh ngiệp đầu mối chính nhng số doanh nghiệp nhỏ vẫn còn khá đông. Do đó tổng số doanh nghiệp xuất khẩu gạo vẫn nhiều, thậm chí còn tăng qua các năm nh sau: năm 1989 : 23 đầu mối xuất khẩu gạo, 1991:26, 1992:43, 1993:43, 1994:45, 1996:15, 1997:16, 1998: 33, 1999:40
Sau khi sắp xếp lại hệ thống lơng thực quốc doanh thành 2 Tổng Công ty lơng thực Trung Ương vào năm 1995, sang năm 1996 chính phủ lại rà soát kĩ các doanh nghiệp xuất khẩu gạo. Do vậy lần đầu tiên vào năm 1996 cả nớc chỉ còn 15 doanh nghiệp đầu mối xuất khẩu trực tiếp và cũng là lần đầu tiên đảm bảo xuất khẩu gạo vợt ngỡng 3 triệu tấn. Đến các năm gần đây số đầu mối lại có hớng tăng nhanh và thực tế lại xuất khẩu với không ít bất cập.
Hàng năm Chính phủ có quyết định riêng về điều hành xuất khẩu gạo và tiêu thụ lúa gạo. Nhà nớc còn hỗ trợ tài chính mua lúa gạo tạm trữ, lợng mua tạm trữ năm 1999 là 1,5 triệu tấn quy ra thóc, năm 2000 là 1 triệu tấn quy gạo đợc hỗ trợ lãi vay Ngân hàng trong 6 tháng. Trong thời gian gần đây, cùng với quá trình hội nhập nền kinh tế thế giới, chính sách khuyến khích xuất khẩu, mức thuế xuất khẩu của Việt Nam đã giảm dần và năm 1999 thuế xuất khẩu gạo đợc quy định: gạo 25% tấm thuế suất 0%, các loại khác thuế suất 1%.
Từ cuối năm 1999 đến nay, giá gạo thị trờng thế giới liên tục giảm làm cho giá gạo Việt Nam xuất khẩu cũng phải giảm theo. Để tiêu thụ kịp thời lúa hàng hoá cho nông dân và để ngăn chặn tình trạng giá lúa liên tục xuống thấp, Chính phủ quyết định giao cho tổng công ty l- ơng thục Miền Nam và công ty kinh doanh xuất khẩu gạo ở các tỉnh Đồng Bằng Sông Cửu Long mua tạm trữ 1 triệu tấn gạo và doanh nghiệp đợc hỗ trợ lãi vay ngân hàng trong 12 tháng, đồng thời áp dụng các giải pháp kích cầu và hạn chế cung.
Đến năm 2001 Nhà nớc thực hiện bãi bỏ qui định về hạn ngạch xuất khẩu gạo, để bất cứ Doanh nghiệp nào có đăng ký kinh doanh trong ngành lơng thực cũng có thể xuất khẩu gạo trực tiếp. Bên cạnh đó Chính phủ còn chủ trơng quy hoạch gắn các công ty kinh doanh lơng thực xuất khẩu vơí từng vùng lúa gạo để công ty phối hợp với địa phơng có nhiệm vụ bao tiêu sản phẩm, thu mua lúa cho nông dân, trực tiếp hỗ trợ cho nông dân các yếu tố đầu vào của sản xuất, đảm bảo lợi ích của ngời nông dân và ổn định thị trờng các doanh nghiệp chế biến kinh doanh gạo đạt tiêu chuẩn xuất khẩu.
Ngoài ra còn có một số trung tâm giao dịch ở những vùng lúa tập trung đợc xây dựng để ngời sản xuất có thể giao dịch trực tiếp với các doanh nghiệp thu mua lơng thực theo phơng thức và giá sàn qui định của Nhà nớc.
Mục đích hệ thống tổ chức xuất khẩu gạo này là nhằm làm cho gạo Việt Nam có sức cạnh tranh hơn trên thị trờng thế giới.