Thiết lập đợc hệ thống trờng lớp tơng đối hoàn chỉnh, khá toàn diện và rộng khắp trên các địa bàn dân c với đầy đủ tất cả các cấp học, ngành học hợp lý. Đến nay tất cả các xã đều có trờng tiểu học và trờng THCS. Trong huyện trớc đây có 2 trờng THPT là THPT Kỳ Anh vùng trong và trờng THPT Nguyễn Huệ vùng ngoài, nhng nay đã xây dựng thêm một trờng THPT ở Kỳ Lâm, nhằm đáp ứng yêu cầu học tập của con em vùng núi, vùng trên. Huyện có Trung tâm giáo dục hớng nghiệp dạy nghề, Trung tâm giáo dục thờng xuyên để bồi dỡng, nâng cao trình độ cho cán bộ và giáo viên, Trung tâm chất lợng cao và 33 Trờng mầm non, hầu hết các bé đều phải đến trờng, không qua học mẫu giáo không đợc vào học lớp 1.
Đồng thời lãnh đạo huyện cũng đã lập lại hệ thống trờng lớp, loại bỏ những trờng chuyên, lớp chọn không cần thiết nhằm qui tụ học sinh về những địa điểm thống nhất, tạo điều kiện thuận lợi cho công tác quản lý và giảng dạy. Đã xoá bỏ
trờng năng khiếu của huyện, trờng THCS Thị trấn, trờng THCS Kỳ Hng, trờng THCS Kỳ Đồng, thành lập trờng THCS Kỳ Anh (gọi là trung tâm chất lợng cao của huyện). Học sinh của trờng bao gồm: học sinh THCS Thị trấn Kỳ Anh, xã Kỳ Hng và tuyển thêm trong cả huyện nếu có nhu cầu. Trờng đặt tại địa điểm trờng THCS Thị trấn cũ và đặt dới sự quản lý của Đảng uỷ, UBND Thị trấn. Số học sinh còn lại của xã Kỳ Hng học tại trờng THCS Kỳ Châu. Học sinh của trờng THCS Kỳ Đồng tuỳ theo địa bàn thích hợp mà chuyển đến học ở 3 trờng: THCS Kỳ Giang, THCS Kỳ Phong, THCS Kỳ Phú. Trờng THCS Kỳ Long bao gồm học sinh hai xã Kỳ Long và Kỳ Liên. Trờng THCS Kỳ Phơng bao gồm học sinh hai xã Kỳ Phơng và Kỳ Nam. Trờng THCS Kỳ Lâm bao gồm học sinh hai xã Kỳ Lâm và Kỳ Hợp.
Hai năm nay trờng THPT dân lập đợc thành lập đã thu hút rất nhiều học sinh, đặc biệt là học sinh con nhà có điều kiện, hạn chế các tệ nạn xã hội ở bên ngoài và góp phần xây dựng trờng học ngày một khang trang hơn.