- Do tốc độ tăng trưởng dư nợ khá cao, mặc dù đã rất cố gắng trong công tác huy động vốn nhưng toàn chi nhánh vẫn trong tình trạng bị mất cân đối về nguồn vốn và sử dụng vốn. Từ chỗ là đơn vị thừa vốn nhiều năm qua, năm 2004 ngay từ quý II đã trở thành đơn vị thiếu vốn, những tháng cuối năm nhiều ngày toàn chi nhánh bị thiếu vốn trên 100 tỷ đồng. Nguyên nhân là do 1 số đơn vị chưa thực sự coi trọng công tác huy động vốn như công tác cho vay, thị phần huy động vốn nói chung và đặc biệt ở thành phố không được mở rộng mà có phần thu hẹp. Huy động vốn bằng ngoại tệ đã triển khai ở tất cả các điểm nhưng hiệu quả còn thấp so với các NHTM khác trên địa bàn.
- Mặc dù dư nợ tăng trưởng khá cao, chất lượng tín dụng vẫn chưa thật ổn định: tỷ lệ nợ quá hạn thấp (chủ yếu tập trung cho vay DN) nhưng chưa đảm bảo vững chắc, một số khoản vay tuy chưa đến hạn nhưng tiềm Èn rủi ro. Tỷ trọng dư nợ ngoại tệ rất thấp so với khả năng huy động vốn bằng ngoại tệ tại địa phương.
- Tiến trình hiện đại hoá ngân hàng còn chậm so với một số NHTM trên địa bàn, chưa theo kịp yêu cầu phát triển của các nghiệp vụ, các dịch vụ ngân hàng hiện đại do nền kinh tế thị trường đòi hỏi nhất là ở các đơn vị huyện.
- Công tác cập nhật thông tin, báo cáo thống kê còn hạn chế, thể hiện: báo cáo chưa đầy đủ, chưa kịp thời, số liệu còn sai sót.
- Việc chấp hành kỷ cương điều hành có lúc, có nơi chưa thực sự nghiêm túc, thể hiện: cho vay vượt chỉ tiêu nguồn vốn trung hạn nội địa, vượt chỉ tiêu nguồn vốn uỷ thác đầu tư; trong lúc thiếu nguồn vốn đầu tư, ngân hàng tỉnh đã có văn bản quán triệt về việc tăng dư nợ song một số chi nhánh vẫn vi phạm.
- Trình độ năng lực, khả năng giao tiếp, ý thức trách nhiệm của một số Ýt cán bộ nghiệp vụ chưa thực sự đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ đặt ra. Cá biệt có những cán bộ do trình độ nhận thức còn hạn chế lợi dụng công việc được giao tham ô tài sản của ngân hàng.