1. Vào thời điểm giao thời của sự thay đổi luật thuế:
Sự vận động của nền kinh tế thị trường tất yếu địi hỏi sự cận động của hệ thống chính sách thuế đẻe đảm bảo sự phù hợp của hệ thống thuế và lấp đi những kẽ hở để đối tượng nộp thuế lợi dụng, tuy nhiên chính thời điểm thay đổi của một chính sách thuế đơi khi tạo ra những kẽ hở mới cho cacs đối tượng nộp thuế lách qua.
Vào thời điểm gần đây, khi luật thuế GTGT ra đời với thuế suất đầu ra tương đối cao thay vì cho hàng loạt các hoạt động cĩ thuế suất thấp (1% đến 2%..) tại thời điểm 1/1/1999. Chính vì lý do này, hàng loạt các cơng trình xây dựng cơ bản, các cơng ty sản xuất kinh doanh ... đều cố gáng bằng cách này hay cách khác tăng khối lượng cơng trình hồn thành bàn giao, tăng cường xác nhận các hợp đồng mua bán hoặc xuất hố đơn bán hàng để cĩ thể tránh được thuế GTGT với một mưcs thuế xuất đầu ra cao hơn rất nhiều. Những biểu hiện đĩ, ngoài việc làm ảnha hưởng lớn đến số thu của Nhà nước, cịn làm giảm tính pháp lý, tínhcơng bằng của hệ thống thuế. Sự thay đổi của hệ thống luật thuế là tất yếu đối với một nước cĩ nền kinh tê đang phát triển và thường xuyên biến động. Tuy nhiên trên cơ sở biểu hiện này để cĩ thể nghiên cứu, xây dựng một hệ thống chính sách sao cho những tác động xấu của chúng là nhỏ nhất đối với nền kinh tế.
Đồng thời với việc ban hành một sự thay đổi của luật thuế, Bộ tài chính, Tổng cục thuế phải nghiên cứu cà đưa ra các phương án cụ thể để hạn chế tối đa việc lợi dụng sự thay đơỉ này. Ví dụ tại thời điểm 1/1/1999, khi luật thuế GTGT
bắt đầu cĩ hiệu lực, Bộ tài chính cĩ thể qui định tất cả các doanh nghiệp tổng kiểm tra kê kho vật liệu, kho thành phẩm cĩ sự giám sát của cơ quan tài chính, tổng kiểm kê tồn bộ hố đơn chứng từ do Bộ tài chính ban hành tại thời điểm 1/1/1999, tất cả các việc đĩ phải tiến hành đồng bộ, hàng loạt và tức thời. Khi đĩ sẽ hạn chế được một phần lớn thất tháo trong quá trình này.
2. Thuế suất thuế GTGT khá cao.
Theo nhận định của nhiều chuyên gia kinh tế, thuế suất thuế GTGT 10% tính cho các mặt hàng thơng thường cho tiêu dùng là khá cao, làm giảm sức mua, tiêu thụ sản phẩm hàng hố gặp nhiều khĩ khăn. Một minh chứng cho thấy thuế suất thuế GTGT cao, đĩ là cĩ trên 100 mặt hàng cĩ thuế suất thuế GTGT cao hơn thuế suất thuế doanh thu và Nhà nước đã nhiều lần phải điều chỉnh giảm thuế.
Mặc dù theo lý luận thuế GTGT do người tiêu dùng trả, khơng gây ảnh hưởng đến hoạt động sản xuất kinh doanh của các doanh nghiệp, nhưng nếu thuế suất cao, giá thanh tốn của hàng hố, dịch vụ sẽ cao, người tiêu dùng khĩ chấp nhận, tiêu thụ sẽ gặp khĩ khăn, các doanh nghiệp muốn bán được hàng buộc phải hạ giá bán và bị thua lỗ. Để tránh bị thua lỗ, các doanh nghiệp phải thu hẹp sản xuất.
3. Thuế GTGT làm đảo lộn mức thuế phải nộp.
Thuế GTGT được thiết kế với mức thu tương đương thuế doanh thu với mụ tiêu ổn định quan hệ phân phơí giữa Nhà nước với nền kinh tế xét trên tổng thể, nhưng thực tế cĩ làm đảo lộn mức thuế phải nộp của các ngành khác nhau. Cĩ ngành thuế phải nộp tăng gấp bội so với thuế doanh thu, cĩ ngành lại thấp hơn nhiều. Tương quan phân phối giữa các ngành bị đảo lộn vướng mắc phát sinh khơng chỉ liên quan đến lỗ lãi mà cịn liên quan đến vấn đề mới.
4. Thuế GTGT gây nhiều khĩ khăn cho doanh nghiệp về vốn.
Qui định phải nộp thuế GTGT đối với những mặt hàng nhập kho nhưng chưa bán làm cho một số doanh nghiệp khĩ khăn trong vấn đề vốn. Đặc biệt với những doanh nghiệp với số vốn ít thì qui định này làm cho họ thật sự điêu đứng.
Nhiều doanh nghiệp hoạt động chủ yếu bằng vốn vay này khi áp dụng luật thuế GTGT phải vay thêm vốn để nộp cho phần thuế đầu vào, gánh nặng thiếu vốn đã nặng nay lại càng nặng thêm cho du sau này se được khấu trừ thuế hay hoàn thuế. Trường hợp các doanh nghiệp bán hàng đại lý khi chuyển hàng cho đai lý phải nộp ngay thuế GTGT, trong khi đĩ phải chỉ khi nào đại lý bán được hàng mới thu được thuế GTGT từ người mua. Như vậy vốn của doanh nghiệp bị chiếm dụng một cách bất hợp lý.
5. Tốc độ hoàn thuế cho doanh nghiệp cịn chậm.
Quá trình thủ tục xin hoàn thuế khá rắc rối, mất nhiều thời gian và cơng sức của ác doanh nghiệp. Để được hoàn thuế, các doanh nghiệp phải nộp hồ sơ và tồn bộ hố đơn, chứng từ lên cơ quan thuế rồi chờ nhân viên thuế xuống đơn vị kiểm tra, đối chiếu hố đơn thực hiện băng phương pháp thủ cơng, kéo dài thời gian kiểm tra làm chậm việc hoàn thuế, bên cạnh đĩ cịn nhiều hiện tượng tiêu cực khác cũng gây thêm khĩ khăn cho doanh nghiệp.
6. Tình trạng gian lận thuế ngày càng trở nên nguy hiểm hơn.
Hiện nay hố đơn bất hợp pháp đa dạng và phong phú chưa từng cĩ và trở thành hàng hố được mua bán cơng khai. Vấn đề này đã làm đau đầu cơ quan thuế hơn bao giờ hết. Trước đây khi thực hiện thuế doanh thu sử dụng hố đơn giả, chỉ cĩ thể ăn gian thuế trên số hàng bán ra, cịn bây giờ, với hố đơn giả, Nhà nước khơng những khơng thu được đồng nào mà ngược lại cịn phải chi thêm để hoàn thuế.
Bên cạnh đĩ, việc sử dụng hố đơn bất hợp pháp tạo ra sự cạnh tranh khơng lành mạnh giưa các doanh nghiệp. Doanh nghiệp nào khơng trốn thuế được sẽ mất dần sức cạnh tranh, những cơ sở trốn thuế sẽ cĩ điều kiện hạ giá thành sản phẩm để cạnh tranh. Hậu quả là những doanh nghiệp làm ăn chân chính bị thua thiệt, sân chơi giữa các doanh nghiệp trở nên bất bình đẳng. Nếu tình trạng này khơng được ngăn chặn và xử lý kịp thời sẽ làm cho nguồn Ngân sách bị thâm hụt một khoản rất lớn và tác động tiêu cực đến nền kinh tế nước ta, làm giảm hiệu lực của luật thuế.
7. Về việc khấu trừ thuế GTGT và xét giảm thuế GTGT.
Cách tính thuế đầu vào được khấu trừ trong trường hợp kinh doanh hàng hố chịu thuế GTGT cịn nhiều phức tạp. Những qui định về khấu trừ khống và xét giảm thuế GTGT cịn thiếu chặt chẽ, rườm rà, mang tính chắp vá.
8. Về hai phương pháp tính thuế và hai loại hố đơn.
Thực tế nền kinh tế nước ta cĩ khoảng 4 vạn doanh nghiệp cĩ khá nhiều tổ chức hạch tốn và gần 1,6 triệu hộ chủ yếu lá sản xuất kinh doanh nhỏ. Cho nên khi thực hiện thuế GTGT đã đáp ứng hai phương pháp tính thuế cà hai loại hố đơn, áp dụng phương pháp khấu trừ và hố đơn GTGT đối với các doanh nghiệp đủ điều kiện hạch tốn kế tốn và áp dụng phương pháp trực tiếp thêm GTGT cà sử dụng hố đơn thơng thường đối với các hộ kinh doanh nhỏ. Việc áp dụng đồng thời hai cách tính thuế GTGT và hai loại hố đơn trong điều kiện nền kinh tế nước ta hiện nay là cần thiết, song trên thực tế lại nảy sinh những bất cập gây trở ngại cho các doanh nghiệp và các hộ kinh doanh. Các doanh nghiệp thực hiện theo phương pháp khấu trừ thuế khơng được khấu trừ đầu vào khi mua hàng hố, dịch vụ của các đơn vị tính thuế theo phương pháp trực tiếp, gây mất cơng bằng trong các thành phần kinh tế, hoặc nảy ra tình trạng chống thuế. Ngoài ra, những bất cập trong kế tốn thuế GTGT, trong chế độ hố đơn, chứng từ đối với hàng hố lưu thơng trên thị trường... cũng gây nhiều khĩ khăn cho cơng tác thu của ngành thuế và cho các hộ kinh doanh nhỏ.
9. Xử lý thuế GTGT đối với hàng nhập khẩu.
Trong hơn 6 tháng đầu năm, thuế suất hàng nhập khẩu, nhất là đối với nguyên, nhiên, vật liệu quá cao. Việc áp mã thuế thiếu chính xác, thời gian nộp thuế quá ngắn. Vấn đề hoàn thuế cịn chậm và phức tạp trong kiểm tra hố đơn. Do vậy nhiều doanh nghiệp phải chịu thêm lãi suất ngân hàng từ số tiền vay nộp thuế trước nhưng chậm được trả lại. Song mặt khác, chính nhiều doanh nghiệp cũng chưa nghiêm túc kê khai và hồn thành các thủ tục cần thiết, dẫn đến tình trạng châm trễ trong việc hoàn thuế.
10. Vướng mắc về thủ tục.
Trong Nghị quyết 90/1999_UBTVQH khố IX qui định vật tư xây dựng loại trong nước chưa sản xuất được nhập khẩu để chế tạo tài sản cố định của doanh nghiệp khơng phải chịu thuế GTGT. Hoặc điều 4 luật thuế GTGT qui định khơng thu thuế GTGT đối với dây truyền thiết bị toàn bộ, đồng bộ. Đến nay vẫn chưa cĩ hướng dẫn để thực hiện. Thí dụ: Phụ tùng, phụ kiện đi kèm, vật tư xây dựng cấu thành nên thiết bị cĩ được hưởng tiêu chuẩn khơng thu thuế GTGT như máy mĩc, thiết bị, phương tiện vận tải hay khơng thì đến nay vẫn chưa làm rõ.
11. Chưa nhất quán trong thực hiện nguyên tắc.
Do phải xử lý những bất cập, chưa phù hợp với thực tê, để đảm bảo cho sản xuất kinh doanh bình thường, Chính phủ, Bộ tài chính đã phải giảm 50% thuế GTGT cho một số mặt hàng, mở rộng thêm một số đối tượng khơng chịu thuế GTGT... Tất cả những xử lý theo hướng "vướng đâu gỡ đấy" đã làm cho biểu thuế suất biến dạng di so với thiết kế ban đàu. Từ 3 mức thuế suất đến nay khơng cịn là 3 mà đã trở thanh 4 đến 5 mức thuế suất. Trên thực tế gây nên sự bất hợp lý mới cho sự cạnh tranh bình đẳng của doanh nghiệp.
Tạo ra hai sân chơi khác nhau trong nền kinh tế. Hiện nay thuế GTGT được tính theo hai phương pháp là phương pháp trực tiếp và phương pháp khấu trừ.
Khi các đơn vị thực hiện theo phương pháp khấu trừ cung ứng hàng hố, dịch vụ cho các đơn vị thực hiện theo phương pháp trực tiếp thi những đơn vị này khơng được khấu trừ, trong khi trong giá trị hàng hố đã cĩ phần thuế GTGT nên đã làm cho thuế đánh chồng chéo lên thuế. Ngược lại, khi các đơn vị thực hiện theo phương pháp trực tiếp cĩ quan hệ giao dịch cung ứng dịch vụ, hàng hố cho các đơn vị thực hiện thuế theo phương pháp khấu trừ thuế GTGT, thực chất đơn vị nhận phải trả phần thuế GTGT chìm trong giá bán mà đơn vị trực tiếp đã nộp. Từ cách thực hiện như trên ta thấy hiện đang tồn tại hai sân chơi khác nhau mà mỗi sân chơi chỉ chơi theo một hình, chính vì vậy đang hình thành hai xu hướng là một số đơn vị đang nộp thuế theo phương pháp khấu trừ chuyển sang nộp theo phương
pháp trực tiếp và ngược lại, tuỳ thuộc vào chiến lược khách hàng của họ và dĩ nhiên
là ngành thuế khĩ lịng giải quyết ngay đưọc. Hơn nữa, trong thực tế thu thuế tính
thưo phương pháp trực tiếp rất khĩ chính xác, nên vẫn chủ yếu tính theo phương
pháp khốn (đối với hộ nhỏ) như thuế doanh thu trước đay, chính điều này đã gây
khơng ít lúng túng, khĩ khăn cho thưong nghiệp quốc doanh một khi họ phải cạnh
tranh trực tiếp với các hộ buon ban tính thuế theo phương pháp trực tiếp.
12. Quản lý sử dụng hố đơn chứng từ cịn chưa tốt.
Tuy đại bộ phận doanh nghiệp đã chấp hố đơnàh tốt chế độ hố đơn, in và sử dụng hố đơn giả, mua đi bán lại hố đơn, viết khơng đúng doanh số trên hố đơn để trốn thuế và chiếm đoạt tiền của Nhà nước trong khâu thối thuế.
