định tính trạng tăng số hạt trín bông
Đa hình giữa hai giống lúa có thể đƣợc phât hiện bằng chiều dăi khâc nhau của câc đoạn lặp lại đƣợc khuếch đại bởi phản ứng PCR khi sử dụng cùng một cặp mồi SSR. Việc nhận dạng đa hình ADN giữa câc giống cho gen vă nhận gen với câc chỉ thị SSR trín 12 NST nhằm phục vụ chọn lọc nền di truyền giống nhận gen vă chọn lọc câc câ thể con lai.
Dòng KC25 có mang QTL quy định tính trạng tăng số hạt trín bông
Yd7. Nhằm mục đích tìm kiếm chỉ thị có thể sử dụng xâc định nền di truyền
trong câc câ thể con lai, tiến hănh phản ứng PCR với ADN của câc giống lúa OM6976; KC25.
Sử dụng 156 chỉ thị SSR trín 12 nhiễm sắc thể đê xâc định 58/156chỉ thị cho đa hình giữa giống OM6976 vă KC25 một văi kết quả chạy đa hình đƣợc thể hiện qua Hình 3.2, Hình 3.3, Hình 3.4
Quan sât Hình 3.2 ta thấy câc chỉ thị RM1208, RM10916, đƣờng chạy số 3(mẫu DNA của giống KC25) xuất hiện băng ADN cao hơn câc băng ở đƣờng chạy số 2 đƣờng chạy số 5 (mẫu ADN của giống OM6976). Chỉ thị RM24865 ở đƣờng chạy số 3 xuất hiện băng ADN thấp hơn băng ADN ở đƣờng chạy số 5. Sự chính lệch về vị trí câc băng ADN ở đƣờng chạy 5 với 3 thể hiện đa hình giữa câc giống OM6976 với giống KC25.
Hình 3.3. Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM19199; RM19238; RM22825
L.Marker; 3.KC25; 5.OM6976
Kết quả Hình 3.3 cũng cho thấy chỉ thị RM19199, RM22825 có vị trí mẫu ADN ở đƣờng chạy số 3 cao hơn câc đƣờng chạy số 2, 4, 5. Ở chỉ thị RM19238 mẫu ADN ở đƣờng chạy số 2, 4 lín mờ, đƣờng chạy số 3 vă 5 lín rõ, có sự khâc biệt vị trí ở đƣờng chạy số 3 vă số 5. Chỉ thị RM21471 ở tất cả câc giếng không xuất hiện băng vạch năo có thể do mồi không hoạt động hoặc do lăm phản ứng sai.
Hình 3.4. Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM6; RM3; RM345
L.Marker; 3.KC25; 5.OM6976
Chỉ thị RM6, RM3, RM345 mẫu ADN ở đƣờng chạy số 3 có vị trí thấp hơn đƣờng chạy số 5 do vậy chỉ thị RM6, RM3, RM345 cho đa hình giữa câc giống OM6976 vă KC25.
Sau khi phđn tích câc kết quả chạy điện di kiểm tra chúng tôi xâc định đƣợc 58/156 chỉ thị cho đa hình giữa OM6976 với KC25. Kết quả tổng hợp đƣợc thể hiện ở Bảng 3.1.
Bảng 3.1. Câc chỉ thị SSR cho đa hình giữa giống OM6976 vă KC25
STT Tín chỉ thị cho phđn tử đa hình Số lƣợng 1 RM10115, RM10136, RM10741, RM10800, RM10815, RM10916, RM11062, RM11438, RM11504, RM1287, RM3412b, RM493, RM5365, RM7075 14 2 RM207, RM526, RM5356, RM6, RM7355 5 3 RM14795, RM14820, RM282, RM3297, RM3654, RM5480 6
4 RM16589, RM16820, RM280, RM349, RM551 5 5 RM19199; RM31 2 6 RM19238, RM3, RM345, RM494, RM527, RM528, RM7434 7 7 RM11, RM21769, RM7338 3 8 RM22825, RM331, RM447 3 9 RM296, RM11874, RM1208 3 10 RM24865, RM25181, RM25271, RM3628 4 11 RM19840, RM341, RM3625 3 12 RM1194, RM247, RM7102 3 Tổng 58
Câc chỉ thị cho đa hình giữa giống cho gen KC25 vă giống nhận gen OM6976 sẽ đƣợc sử dụng để đânh giâ xâc định nín di truyền ở câc thế hệ con lai.
Kết quả khảo sât đa hình trín 12 NST của câc giống nghiín cứu với câc chỉ thị SSR đƣợc minh họa bởi một số hình ảnh sau đđy:
Hình 3.5 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM3482; RM3628; RM3625; RM3654; RM3753
Hình 3.6 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM11745; RM11799; RM11874; RM20163;
RM20192
L.Marker; 3.KC25; 5.OM6976
Hình 3.7 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM31; RM 148; RM 296; RM247; RM282
Hình 3.8 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM10115; RM10649; RM10681;
RM10694A;RM10694; RM10720
L.Marker; 3.KC25; 5.OM6976
Hình 3.9 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM10741; RM10782; RM10806; RM10815;
RM10820
Hình 3.10 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM16589; RM16820; RM17391; RM17411;
RM09034
L.Marker; 3.KC25; 5.OM6976
Hình 3.11 Một số hình ảnh khảo sât đa hình với ADN câc giống cho vă nhận gen với chỉ thị RM11438; RM12769; RM13197; RM13332;
RM14795; RM14820
L.Marker; 3.KC25; 5.OM6976
