1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Nghiên cứu tạo dòng lúa chuyển gen mã hóa nhân tố phiên mã nhóm NAC liên quan đến tính chịu hạn

157 23 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Cấu trúc

  • ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI

  • Hà Nội – 2018

  • Hà Nội – 2018

  • Nghiên cứu sinh

    • Phạm Thu Hằng

    • Phạm Thu Hằng

  • DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT

  • DANH MỤC BẢNG

  • DANH MỤC HÌNH

  • MỞ ĐẦU

    • 1. Đặt vấn đề

    • Mục tiêu nghiên cứu

    • Đối tƣ ng v nội dung nghiên cứu

      • Đối tượng nghiên cứu của luận án:

      • ác n i ung nghiên cứu ch nh

    • Địa điểm nghiên cứu

    • Đóng góp mới của luận án

    • Ứng dụng thực tiễn của luận án

    • 1.1.2. Ảnh hƣởng của hạn hán đối với ngành sản xuất lúa gạo

    • 1.1.3. Ảnh hƣởng của hạn tới cây lúa

      • 1.1.3.1. Ảnh hưởng của hạn tới đặc điểm hình thái

      • 1.1.3.2. Hạn ảnh hưởng tới đặc điểm sinh lý

      • 1.1.3.3. Ảnh hưởng của hạn tới đặc điểm sinh hóa

      • 1.1.3.4. Ảnh hưởng của hạn ở mức đ phân tử

      • 1.1.3.4.1 Quá trình nhận và truyền tín hiệu

      • 1.1.3.4.2. ác protein tham gia vào quá trình đáp ứng điều kiện hạn

    • 1.2.1. Vai trò của nhân tố phiên mã liên quan tới đáp ứng stress hạn ở thực vật

      • 1.2.1.1. Nhân tố phiên mã AP2/ERF (APETALA2/EthyleneResponsive Element Binding Protein)

      • 1.2.1.2. Nhân tố phiên mã WRKY

      • 1.2.1.3. Nhân tố phiên mã bZIP (Basic Leucine Zipper)

      • 1.2.1.4. Nhân tố phiên mã MYB (myeloblastosis)

    • 1.2.2. Nhân tố phiên mã NAC v vai trò đáp ứng stress hạn ở thực vật

      • 1.2.2.1. Đặc điểm cấu trúc của nhân tố phiên mã NAC

    • Hình 1.2: Sơ đồ cấu trúc protein NAC [108]

      • 1.2.2.2. Vai trò của nhân tố phiên mã NA trong đáp ứng với stress hạn ở thực vật

    • Hình 1.3: Mạng lƣới điều hòa phiên mã các gen đáp ứng stress phi sinh học của nhân tố phiên mã NAC ở lúa [103]

    • Bảng 1.1: Chức năng của nhân tố phiên mã NAC [103]

    • 1.3.3. Hệ thống vector/promoter dùng trong chuyển gen thực vật

      • 1.3.3.1. Hệ thống vector biến nạp gen thông qua vi khuẩn A. tumefaciens

      • 1.3.3.2. Promoter sử dụng trong chuyển gen thực vật

    • 1.4.1. Tình hình nghiên cứu tạo giống lúa chuyển gen chống chịu hạn trên Thế giới

    • 1.4.2. Tình hình nghiên cứu tạo giống lúa chuyển gen ở Việt Nam

    • 2.1.1. Đối tƣ ng nghiên cứu

    • 2.1.2. Chủng vi sinh vật

    • 2.1.3. Vector và oligonucleotide

    • Bảng 2.1: Trình tự cácoligonucleotide sử dụng trong nghiên cứu.

    • 2.1.4. Hóa chất

    • 2.1.5. Thiết bị

    • 2.2.1. Xử lý mẫu thực vật

      • 2.2.1.1. Đánh giá khả năng chịu hạn của các giống lúa Việt Nam

      • 2.2.1.2. Xử lý cây lúa với các điều kiện stress giả định

      • 2.2.1.3. Đánh giá khả năng chịu hạn của cây lúa chuyển gen

    • 2.2.2. Tách chiết, định lƣ ng DNA/RNA

      • 2.2.2.1. Tách chiết DNA plasmid

      • 2.2.2.2. Tách chiết RNA từ mô thực vật

      • 2.2.2.3. Điện di DNA/RNA trên gel agarose

      • 2.2.2.4. Đánh giá mức đ biểu hiện gen bằng kỹ thuật RT-PCR

      • 2.2.2.5. Xác định tương đối số lượng ản cop ằng kỹ thuật qRT-PCR

    • 2.2.4. Thiết kế cấu trúc biểu hiện gen OsNAC1 trong tế bào thực vật

      • 2.2.4.1. Thiết kế hệ vector biểu hiện OsNAC1 điều khiển bởi promoter cảm ứng stress

    • Hình 2.1: Sơ đồ thiết kế vector biểu hiện pCAM-Rd29A/OsNAC1 và pCAM- Lip9/OsNAC1

      • 2.2.4.2. Thiết kế vector biểu hiện OsNA 1 điều khiển bởi promoter hoạt đ ng mạnh

    • Hình 2.2: Sơ đồ thiết kế vector biểu hiện pBI-35S/OsNAC và pBI- Ubi/OsNAC1

    • 2.2.5. Tạo cây lúa chuyển gen biểu hiện OsNAC1

      • 2.2.5.1. Biến nạp plasmid vào tế bào vi khuẩn A. tumefaciens

      • 2.2.5.2. Chuyển nạp gen vào lúa thông qua vi khuẩn A. tumefaciens

    • 2.2.6. Sàng lọc các dòng lúa chuyển gen

    • 2.2.7. Các phƣơng pháp định lƣ ng sinh lý, sinh hóa ở cây lúa

      • 2.2.7.1. Xác định hàm lượng nước tương đối trong lá

      • 2.2.7.2. Phương pháp xác định hàm lượng chlorophyll

      • 2.2.7.3. Phương pháp xác định hàm lượng proline

      • 2.2.7.4. Xác định mức đ tích tụ ROS

    • 2.2.8. Phƣơng pháp xử lý số liệu thống kê

    • 3.1.1. Khảo sát khả năng chịu hạn của một số giống lúa Việt Nam

    • Bảng 3.1: Kết quả đánh giá khả năng chịu hạn một số giống lúa Việt Nam

    • 3.1.2. Phân lập gen mã hóa nhân tố phiên mã nhóm NAC liên quan tới tính chịu hạn

      • 3.1.2.1. Tách chiết RNA tổng số từ mẫu lúa xử lý hạn

    • Hình 3.1: Tách chiết RNA tổng số từ mẫu lúa xử lý hạn

      • 3.1.2.2. Phân lập các gen mã hóa nhân tố phiên mã nhóm NAC

    • Nhân dòng các gen mã hóa nhân tố phiên mã NAC vào vector pGEM-T

    • Hình 3.3: Sàng lọc thể biến nạp bằng PCR trực tiếp khuẩn lạc

    • Hình 3.4: Kiểm tra plasmid tái tổ h p bằng PCR

    • Hình 3.5: Kiểm tra plasmid tái tổ h p bằng enzyme cắt giới hạn

    • Giải trình tự gen mã hóa nhân tố phiên mã nhóm NAC

    • Hình 3.6: Phân tích trình tự axit amin suy diễn của protein OsNAC1, OsNAC5

    • 3.2.1. Thiết kế vector biểu hiện OsNAC1 điều khiển bởi promoter hoạt động liên tục

      • 3.2.1.1. Ghép nối đoạn gen OsNAC1 vào vector pBI-35S và pBI-Ubi

    • Hình 3.8: Xử lý vector pBI-Ubi, pBI-35S và pGEM/OsNAC1 bằng enzyme cắt giới hạn

    • Hình 3.9: PCR trực tiếp khuẩn lạc mang pBI-Ubi/OsNAC1 và pBI- 35S/OsNAC1

      • 3.2.1.2. Kiểm tra vector tái tổ hợp pBI-Ubi/OsNAC1 và pBI-35S/OsNAC1

    • 3.2.2. Thiết kế vector biểu hiện OsNAC1 điều khiển bởi promoter hoạt động cảm ứng stress

      • 3.2.2.1. Ghép nối đoạn gen OsNAC1 vào vector pCAM-Rd29A và pCAM-Lip9

    • Hình 3.11: Xử lý vectorpCAM-Rd29A và pCAM-Lip9 bằng enzyme cắt giới hạn BamHI

    • Hình 3.12: PCR trực tiếp khuẩn lạc mang pCAM-Rd29A/OsNAC1và pCAM- Lip9/OsNAC1

      • 3.2.2.2. Kiểm tra vector tái tổ hợp pCAM-Rd29A/OsNAC1 và pCAM-Lip9/OsNAC1

    • Hình 3.13: Kiểm tra plasmid tái tổ h p pCAM-Rd29A/OsNAC1 và pCAM- Lip9/OsNAC1 bằng PCR và cắt giới hạn

    • Hình 3.14: PCR trực tiếp khuẩn lạc mang pCAM-Rd/OsNAC1, pBI- 35S/OsNAC1, pBI-Ubi/OsNAC1và pCAM-Lip9/OsNAC1

    • Hình 3.15: PCR trực tiếp khuẩn lạc mang pBI101 và pCAMBIA1301

    • 3.3.2. Nghiên cứu chuyển gen OsNAC1 vào lúa

    • Bảng 3.2: Kết quả chuyển gen vào lúa thông qua vi khuẩn A. tumefaciens

    • Hình 3.16: Chuyển cấu trúc biểu hiện gen OsNAC1 vào lúa

    • 3.3.3. Sàng lọc các dòng lúa tái sinh đƣ c chuyển cấu trúc biểu hiện OsNAC1

      • 3.3.3.1. Xác định cây lúa tái sinh mang cấu trúc biểu hiện OsNAC1

    • Bảng 3.3: Kết quả sàng lọc cây lúa tái sinh đƣ c chuyển gen OsNAC1

      • 3.3.3.2. Xác định cây lúa chuyển gen T0 mang m t bản sao cấu trúc biểu hiện OsNAC1

    • Bảng 3.4: Kết quả xác định số lƣ ng bản sao gen kháng Hygromycin trong cây lúa chuyển gen T0

      • 3.3.3.3. Sự sinh trưởng của các cây lúa chuyển gen T0 trong nhà lưới

    • Bảng 3.5: Kết quả sinh trƣởng của cây lúa chuyển gen T0 trong nh lƣới

    • 3.3.4. Chọn lọc dòng lúa chuyển gen T1

    • Bảng 3.6: Kết quả sàng lọc các dòng lúa chuyển gen T1

    • Bảng 3.7: Kết quả sinh trƣởng của các cây lúa chuyển gen đời T1

    • 3.3.5. Chọn lọc dòng lúa chuyển gen T2

    • 3.4.1. Đánh giá sinh trƣởng, phát triển của các dòng lúa chuyển gen T2

    • Hình 3.19: Đánh giá khả năng sinh trƣởng của các dòng lúa chuyển gen

    • 3.4.2. Đánh giá khả năng chịu hạn của các dòng lúa chuyển gen

      • 3.4.2.1. Đánh giá khả năng chịu hạn thông qua chỉ tiêu hình thái

    • Hình 3.20: Các dòng lúa sau 2 tuần xử lý hạn

    • Bảng 3.8: Kết quả đánh giá khả năng chịu hạn của các dòng lúa chuyển gen dựa trên độ cuốn lá

      • 3.4.2.2. Đánh giá khả năng chịu hạn thông qua các chỉ tiêu sinh lý

    • Bảng 3.9: Kết quả xác định h m lƣ ng nƣớc tƣơng đối trong dòng lúa chuyển gen

    • Bảng 3.10: H m lƣ ng chất diệp lục a trong các dòng lúa chuyển gen

    • Bảng 3.11: H m lƣ ng chất diệp lục b trong các dòng lúa chuyển gen

    • Bảng 3.12: H m lƣ ng chất diệp lục tổng số trong các dòng lúa chuyển gen

      • 3.4.2.3. Đánh giá khả năng chịu hạn thông qua các chỉ tiêu sinh hóa

    • Bảng 3.13: H m lƣ ng proline trong các dòng lúa

    • Hình 3.21: Ảnh hƣởng của hạn đến sự tích tụ H2O2 trong lá lúa

      • 3.4.2.4. Đánh giá khả năng chịu hạn thông qua tỷ lệ sống sót của các dòng lúa chuyển gen sau khi xử lý hạn

    • Hình 3.22: Khả năng phục hồi của các dòng lúa chuyển gen v dòng đối chứng sau xử lý hạn

      • 3.4.2.3. Đánh giá chung về khả năng chịu hạn của các dòng lúa chuyển gen

    • Bảng 3.14: Kết quả so sánh tƣơng quan khả năng chịu hạn của các dòng lúa

  • KẾT LUẬN

  • KIẾN NGHỊ

  • DANH MỤC CÔNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN

  • TÀI LIỆU THAM KHẢO

    • Tiếng Việt

    • Tiếng Anh

  • PHỤ LỤC

    • Phụ lục 1: Thành phần môi trƣờng sử dụng trong chuyển gen lúa

    • Phụ lục 5: PCR kiểm tra một số dòng lúa tái sinh T1

Nội dung

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN _ Phạm Thu Hằng NGHIÊN CỨU TẠO DỊNG LÚA CHUYỂN GEN MÃ HĨA NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NHĨM NAC LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH CHỊU HẠN LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Hà Nội – 2018 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN _ Phạm Thu Hằng NGHIÊN CỨU TẠO DÒNG LÚA CHUYỂN GEN MÃ HÓA NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NHÓM NAC LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH CHỊU HẠN Chun ngành: Hóa sinh học Mã số: 62420116 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS Phạm Xuân Hội Hà Nội – 2018 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan: Luận án công trình nghiên cứu thực cá nhân, đƣợc thực dƣới hƣớng dẫn khoa học PGS.TS Phạm Xuân Hội Các số liệu, kết luận án trung thực chƣa đƣợc tác giả công bố cơng trình khác Tơi xin chịu trách nhiệm nghiên cứu Hà Nội, ngày 26 tháng năm 2018 Nghiên cứu sinh Phạm Thu Hằng LỜI CẢM ƠN Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Phạm Xuân Hội (Viện Di truyền Nơng nghiệp) người thầy tận tình hướng dẫn, giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho suốt thời gian học tập, thực hồn thành luận án Tơi xin chân thành cảm ơn Ban giám hiệu Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Phòng Sau Đại học, Ban Ch nhiệm Khoa Sinh học (Trường ĐH KHTN) Ban lãnh đạo Viện Di truyền Nông nghiệp tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ tơi hồn tất th tục cần thiết trình học tập thực luận án Tôi xin trân trọng cảm ơn thầy, cô giáo Bộ môn Sinh lý thực vật Hóa sinh (Khoa Sinh học, Trường ĐH KHTN) giảng dạy suốt khóa học tập thể cán nghiên cứu c a Bộ môn Bệnh học Phân tử (Viện DTNN) bạn bè, đồng nghiệp giúp đỡ, đóng góp ý kiến cho tơi để hồn thành luận án tốt nghiệp Tôi xin cảm ơn gia đình người thân ln bên cạnh tôi, quan tâm, cảm thông giúp đỡ suốt thời gian học tập thực luận án Hà Nội ngày 26 tháng năm 2018 Phạm Thu Hằng MỤC LỤC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC BẢNG DANH MỤC HÌNH MỞ ĐẦU Chƣơng 1: TỔNG QUAN 13 1.1 GIỚI THIỆU CHUNG VỀ CÂY LÚA 13 1.1.1 Đặc điểm sinh học lúa Oryza sativa 13 1.1.2 Ảnh hƣởng hạn hán ngành sản xuất lúa gạo 14 1.1.3 Ảnh hƣởng hạn tới lúa 16 1.2 VAI TRÒ CỦA NHÂN TỐ PHIÊN MÃ LIÊN QUAN TỚI ĐÁP ỨNG STRESS HẠN Ở THỰC VẬT 28 1.2.1 Vai trò nhân tố phiên mã liên quan tới đáp ứng stress hạn thực vật 28 1.2.2 Nhân tố phiên mã NAC vai trò đáp ứng stress hạn thực vật .34 1.3 AGROBACTERIUM TUMEFACIENS VÀ CƠ CHẾ CHUYỂN GEN VÀO THỰC VẬT 41 1.3.1 Giới thiệu chung vi khuẩn A tumerfaciens 41 1.3.2 Cơ chế phân tử việc chuyển gen thông qua A tumefaciens .42 1.3.3 Hệ thống vector/promoter dùng chuyển gen thực vật 43 1.4 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU TẠO GIỐNG LÚA CHUYỂN GEN CHỐNG CHỊU HẠN 46 1.4.1 Tình hình nghiên cứu tạo giống lúa chuyển gen chống chịu hạn Thế giới 46 1.4.2 Tình hình nghiên cứu tạo giống lúa chuyển gen Việt Nam 47 Chƣơng 2: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .50 2.1 VẬT LIỆU 50 2.1.1 Đối tƣợng nghiên cứu 50 2.1.2 Chủng vi sinh vật 50 2.1.3 Vector oligonucleotide 50 2.1.4 Hóa chất 51 2.1.5 Thiết bị 52 2.2 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 52 2.2.1 Xử lý mẫu thực vật 52 2.2.2 Tách chiết, định lƣợng DNA/RNA 53 2.2.3 Nhân dòng gen OsNAC1, OsNAC5 OsNAC10 vào vector pGEM-T 57 2.2.4.Thiết kế cấu trúc biểu gen OsNAC1 tế bào thực vật 59 2.2.5 Tạo lúa chuyển gen biểu OsNAC1 61 2.2.6 Sàng lọc dòng lúa chuyển gen 63 2.2.7 Các phƣơng pháp định lƣợng sinh lý, sinh hóa lúa 64 2.2.8 Phƣơng pháp xử lý số liệu thống kê 65 Chƣơng 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU THẢO LUẬN 66 3.1 PHÂN LẬP GEN MÃ HÓA NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NHÓM NAC LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH CHỊU HẠN Ở LÚA 66 3.1.1 Khảo sát khả chịu hạn số giống lúa Việt Nam 66 3.1.2 Phân lập gen mã hóa nhân tố phiên mã nhóm NAC liên quan tới tính chịu hạn 67 3.1.3 Phân tích biểu OsNAC1, OsNAC5 OsNAC10 điều kiện hạn 75 THIẾT KẾ VECTOR BIỂU HIỆN OsNAC1 TRONG TẾ BÀO THỰC VẬT78 3.2.1 Thiết kế vector biểu OsNAC1 điều khiển promoter hoạt động liên tục 78 3.2.2 Thiết kế vector biểu OsNAC1 điều khiển promoter hoạt động cảm ứng stress 81 3.2 NGHIÊN CỨU CHUYỂN GEN OsNAC1 VÀO CÂY LÚA 86 3.3.1 Biến nạp vector biểu vào A tumefaciens LBA4404 86 3.3.2 Nghiên cứu chuyển gen OsNAC1 vào lúa 87 3.3.3 Sàng lọc dòng lúa tái sinh đƣợc chuyển cấu trúc biểu OsNAC1 91 3.3.4 Chọn lọc dòng lúa chuyển gen T1 94 3.3.5 Chọn lọc dòng lúa chuyển gen T2 96 3.4 ĐÁNH GIÁ SINH TRƢỞNG PHÁT TRIỂN VÀ KHẢ NĂNG CHỊU HẠN CỦA CÁC DÒNG LÚA CHUYỂN GEN 100 3.4.1 Đánh giá sinh trƣởng, phát triển dòng lúa chuyển gen T2 100 3.4.2.Đánh giá khả chịu hạn dòng lúa chuyển gen .102 KẾT LUẬN 117 KIẾN NGHỊ 118 DANH MỤC CƠNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 119 TÀI LIỆU THAM KHẢO 120 PHỤ LỤC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT 2,4-D : 2,4-Dichlorophenoxyacetic acid ABA : Abscisic acid ABRE : Yếu tố đáp ứng acid abscisic chứa trình tự ACGT (ACGT-containing abscisic acid response element) AD : V ng tác động acting domain AMP : Adenosine monophosphate ATP : Adenosine triphosphate BAP : 6-Benzylaminopurine BD : V ng liên kết inding domain BĐKH : Biến đổi khí hậu bp : Cặp azơ (base pair) cDNA : DNA ổ sung (complementary deoxyribonucleic acid) Ct : Chu kỳ ngƣỡng (threshold cycle) DEPC : Diethylpyrocarbonate DMSO : Dimethyl sulfoxide dNTP : Deoxyribonucleoside Triphosphate DRE : Yếu tố đáp ứng hạn (dehydration responsive element) DREB : Protein liên kết với yếu tố đáp ứng hạn DRE (dehydration responsive element-binding protein) EDTA : Ethylenediaminetetraacetic acid EtBr : Ethidium bromide IPTG : Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside kb : Kilobase LB : Môi trƣờng nuôi cấy vi khuẩn Luria-Bertani LEA : Protein hình thành giai đoạn phát triển muộn phôi (late embryogenesis abundant) MCS : V ng nh n dòng đa điểm cắt (multiple cloning site) MOPS : Acid 3-(N-morpholino)propansulfonic mRNA : Messenger ribonucleic acid MS : Môi trƣờng nuôi cấy thực vật Murashige & Skoog NAA : 1-naphthaleneacetic acid NAC : NAM/ATAF1/2/CUC2 NACRS : Trình tự nhận biết protein NAC (NAC recognition sequence) NST : Nhiễm sắc thể OD : Mật độ quang học (optical density) ORF : Khung đọc mở (open reading frame) PCR : Phản ứng chuỗi trùng hợp (polymerase chain reaction) PEG : Polyethylene glycol RT-PCR : Phản ứng nhân DNA ch p ngƣợc reverse transcription polymerase chain reaction) ROS : Các chất oxy hoạt hóa (reactive oxygen species) RWC : Hàm lƣợng nƣớc tƣơng đối (relative water content) qRT-PCR : Phản ứng chuỗi trùng hợp định lƣợng thời gian thực (Real-time quantiative polymerase chain reaction) SDS : Sodium dodecyl sulfate TAE : Đệm Tris-acetate-EDTA TE : Đệm Tris-EDTA TF : Nhân tố phiên mã (transcription factor) Ti-plasmid : Plasmid gây khối u (tumor inducing plasmid) X-Gal : 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranoside DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1: Chức nhân tố phiên mã NAC 40 Bảng 2.1: Trình tự cácoligonucleotide sử dụng nghiên cứu 50 Bảng 2.2: Thang điểm đánh giá khả chịu hạn lúa theo IRRI 52 Bảng 3.1: Kết đánh giá khả chịu hạn số giống lúa Việt Nam 66 Bảng 3.2: Kết chuyển gen vào lúa thông qua vi khuẩn A tumefaciens 88 Bảng 3.3: Kết sàng lọc c y lúa tái sinh đƣợc chuyển gen OsNAC1 91 Bảng 3.4: Kết xác định số lƣợng gen kháng Hygromycin lúa chuyển gen T0 93 Bảng 3.5: Kết sinh trƣởng lúa chuyển gen T0 nhà lƣới 94 Bảng 3.6: Kết sàng lọc dòng lúa chuyển gen T1 95 Bảng 3.7: Kết sinh trƣởng lúa chuyển gen đời T1 96 Bảng 3.8: Kết đánh giá khả chịu hạn dòng lúa chuyển gen dựa độ 104 Bảng 3.9: Kết xác định hàm lƣợng nƣớc tƣơng đối dòng lúa chuyển gen 105 Bảng 3.10: Hàm lƣợng chất diệp lục a dòng lúa chuyển gen 107 Bảng 3.11: Hàm lƣợng chất diệp lục b dòng lúa chuyển gen 108 Bảng 3.12: Hàm lƣợng chất diệp lục tổng số dòng lúa chuyển gen 109 Bảng 3.13: Hàm lƣợng proline dòng lúa 111 Bảng 3.14: Kết so sánh tƣơng quan khả chịu hạn dòng lúa 115 Thiamine HCl 10 1 10 10 10 - - - - - - - 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0,1 0,3 0,3 0,3 0,3 0,3 0,3 0,3 0,3 L-Proline (g/l) 0,5 - - - 0,5 0,5 0,5 - L-Glutamine (g/l) 0,5 - - - 0,5 0,5 0,5 - 2,4-D (mg/l) 2,5 2,5 2,5 2,5 2,5 - - - BAP (mg/l) - - - - - - NAA (mg/l) - - - - - 0,5 - ABA (mg/l) - - - - - - - - 100 100 - - - - - Sucrose (g/l) 30 - - 30 30 30 30 50 Glucose (g/l) - 10 10 10 - - - - - - - 50 50 50 - - - - - 100 100 100 - - - - - 400 400 200 - - 2,6 - 7 2,6 4,5 2,5 5,8 5,2 5,2 5,2 5,8 5,8 5,8 5,8 (mg/l) Glycine (mg/l) Myo-Inositol (g/l) Cazein Hydrolysate (g/l) Acetosyringone (µmol/l) Hygromycin (mg/l) Vancomycin (mg/l) Cefotaxime (mg/l) Phytagel Agarose type I (g/l) pH Phụ lục 2: Thành phần môi trƣờng AB nuôi khuẩn A.tumefacien chuyển gen Dung dịch A 5X Dung dịch B 1X g (NH4)2SO4 ml CaCl2 0,1 M khử tr ng g Na2HPO4 ml MgCl2 M khử tr ng g KH2PO4 ml FeCl3 0,003 M khử tr ng g NaCl 797 ml H2O khử tr ng 200 ml H2O 16 g aga Khử tr ng Khử tr ng Cho 200 mldung dịch A 5X vào 800 ml dung dịch B 1X Phụ lục 3: Cấu trúc vector pGEM-T Phụ lục 4: Kết kiểm tra số dòng lúa tái sinh T0 Ghi chú: A DNA tách chiết từ dòng lúa chuyển cấu trúc Lip9:OsNAC1:Nos B, C, D PCR kiểm tra lúa chuyển cấu trúc Lip9:OsNAC1:Nos với cặp mồi actinFw/actin-Rv, Hyg-Fw/Hyg-Rv & OsNAC1-t-Fw/Nos-Rv điện di gel agarose 1% giếng – 17: khn mẫu DNA tách chiết từ dịng lúa chuyển cấu trúc Lip9:OsNAC1:Nos Giếng M: thang chuẩn DNA kb Phụ lục 5: PCR kiểm tra số dòng lúa tái sinh T1 Phụ lục 6: Kết so sánh trình tự gen OsNAC1 lúa Tẻ đỏ với trình tự gen cơng bố Ngân hàng Gen giới (mã số: AY596808.1) Phụ lục 7: Kết so sánh trình tự gen OsNAC5 lúa Tẻ đỏ với trình tự gen cơng bố Ngân hàng Gen giới (mã số: AB028184.1) Phụ lục 8: Kết so sánh trình tự gen OsNAC10 lúa Tẻ đỏ với trình tự gen cơng bố Ngân hàng Gen giới (mã số: AK069257.1) Phụ lục 9: Kết số tiêu sinh trƣởng, phát triển dịng lúa chuyển gen v dịng đối chứng khơng chuyển gen Các dòng lúa chuyển Chiều cao Số Số hạt Thời gian sinh gen T2 (cm) nhánh/khóm chắc/bơng trƣởng (ng y) L1 103,2 ± 0,29 5,5 ± 0,57 105,7 ± 7,50 107 ±0,54 L2 102,9 ± 0,29 5,0 ± 0,00 101,7 ± 4,16 105 ±1,53 Lip9: L3 102,9 ± 0,58 5,3 ± 0,50 103,3 ± 6,11 106 ±0,57 OsNAC1 L4 103,2 ± 0,76 5,3 ± 0,50 104,3 ± 6,66 105 ±1,53 L5 103,1 ± 0,58 5,5 ± 0,57 100,3 ± 4,16 108 ± 0,58 L6 103,0 ± 0,29 5,5 ± 0,57 102,3 ± 6,03 107 ±0,58 U1 102,9 ± 0,36 5,3 ± 0,50 103,7 ± 2,08 108 ± 1,00 U2 102,6 ± 0,29 5,0 ± 0,81 102,7 ± 4,50 110 ±0,58 Ubi: OsNAC1 U3 102,7 ± 0,50 5,0 ± 0,81 96,0 ± 6,25 109 ±1,54 U4 101,9 ± 0,76 4,5 ± 0,57 96,7 ± 4,04 110 ±1,52 U5 102,6 ± 0,50 4,8 ± 0,50 100,3 ± 2,08 110 ±1,53 103,5 ± 0,5 5,3 ± 0,5 106,7 ±3,05 105 ± 1,00 Cây không chuyển gen ĐC Phụ lục 10: Danh sách 11 giống lúa đƣ c cung cấp Trung tâm Tài nguyên thực vật – Viện Khoa học nông nghiệp Việt Nam STT Tên giống STT Tên giống Lúa Tẻ đỏ Lúa lốc đỏ Pê đớ Nếp khau Pí Pột Khấu le Lúa tẻ nƣơng Blue xá 10 Chành trụi Lốc nghệ 11 IR64 Lúa ngoi Phụ lục 11: Đánh giá hiệu suất RT-PCR cho hai cặp mồi Hyg-Fw/Rv REF#3 Phụ lục 12: Kết qRT-PCR xác định số lƣ ng copy chuyển gen Phụ lục 13: Kết kiểm tra số lƣ ng copy dòng lúa chuyển gen OsNAC1 0,93±0,002 0,45±0,057 0,52±0,028 0,63±0,026 1,01±0,017 0,59±0,040 0,47±0,020 1,25±0,017 Số 1 1 10 11 12 13 14 15 16 0,52±0,029 0,51±0,008 1,37±0,015 0,53±0,044 0,41±0,027 0,57±0,014 1,29±0,035 0,63±0,012 17 18 19 0,105±0,057 0,55±0,029 0,39±0,016 STT (Lip9) Av ΔCt ±SD 0,52±0,028 1,33±0,016 0,48±0,021 0,97±0,025 0,49±0,018 0,54±0,027 0,99±0,043 1,01±0,212 2 2 2 1,21±0,024 0,97±0,022 0,41±0,012 1,20±0,057 1,07±0,050 0,42±0,023 0,60±0,01 1,21±0,038 Số 2 2 1 1 2 10 11 12 13 14 15 16 0,53±0,002 0,95±0,057 0,49±0,052 0,5±0,026 0,57±0,126 1,17±0,110 1,20±0,059 0,54±0,027 1 2 10 11 12 13 14 15 16 0,105±0,051 0,65±0,021 1,24±0,028 0,61±0,013 0,98±0,028 0,49±0,028 0,94±0,037 0,98±0,046 2 2 2 1 17 18 19 0,51±0,008 0,48±0,031 0,58±0,023 17 18 19 0,5±0,04 1,21±0,023 1,3±0,037 2 STT (Ubi) Av ΔCt ±SD Số STT (35S) 10 Av ΔCt ±SD 0,51±0,028 1,07±0,027 0,50±0,053 0,54±0,027 0,51±0,008 0,48±0,031 1,01±0,212 1,10±0,159 Số 1 1 2 0,49±0,035 10 0,50±0,049 11 0,47±0,020 1 STT (Rd29A) Av ΔCt ±SD 20 21 0,91±0,018 0,94±0,030 2 20 21 22 23 24 0,55±0,037 0,49±0,035 1,01±0,212 0,47±0,024 1,51±0,011 1 2 20 21 22 23 24 0,51±0,018 0,98±0,029 0,9±0,021 0,95±0,031 0,59±0,028 2 25 26 27 28 29 30 0,67±0,013 1,13±0,034 0,96±0,012 0,59±0,018 1,25±0,025 0,62±0,034 2 25 26 27 28 29 30 31 1,01±0,1 0,49±0,035 1,1±0,044 1,07±0,021 0,99±0,019 0,50±0,016 0,97±0,015 2 2 Phụ lục 14: Kết kiểm tra số lƣ ng copy dòng lúa chuyển gen mang vector trống STT ΔCt (pBI101) Av ±SD 1,23±0,021 0,97±0,022 0,6±0,021 0,98±0,01 0,62±0,013 1,09±0,012 0,53±0,021 Số copy 2 2 STT (pCAM) ΔCt Av ±SD 0,51±0,012 1,12±0,023 1,01±0,029 1,52±0,013 0,4±0,019 0,52±0,021 0,93±0,026 Số copy 2 1 1,01±0,029 1,52±0,013 10 0,4±0,019 11 1,21±0,028 12 1,23±0,023 13 1,12±0,021 2 2 1,12±0,021 1,0±0,026 10 1,09±0,014 11 0,41±0,015 12 1,01±0,029 13 1,24±0,016 14 1,43±0,018 15 0,47±0,025 16 1,23±0,024 17 1,09±0,019 18 1,42±0,033 2 2 2 2 Phụ lục 15: Kết kiểm tra kiểu gen dòng lúa chuyển gen mang gen Lip9:OsNAC1 STT L1.1 L1.2 L1.3 L2.1 L2.2 L2.3 L2.4 L2.5 L2.6 L2.8 Av ΔCt ±SD 1,11±0,026 0,59±0,01 0,44±0,016 0,58±0,019 0,61±0,021 0,5±0,008 0,53±0,020 0,48±0,021 0,97±0,013 0,41±0,018 Kiểu gen AA Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa AA Aa STT L4.2 L4.3 L4.4 L4.5 L4.6 L4.7 L4.8 L4.9 L4.10 L4.11 Av ΔCt ±SD 0,58±0,011 0,61±0,019 0,51±0,028 0,49±0,024 0,58±0,027 1,51±0,015 0,4±0,02 0,52±0,025 0,59±0,018 0,67±0,021 Kiểu gen Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa L2.9 L3.1 L3.2 L4.1 L4.2 L4.3 0,99±0,009 0,58±0,021 0,48±0,018 0,95±0,018 0,11±0,04 0,61±0,016 AA Aa Aa AA AA Aa L5.1 L5.2 L5.3 L5.4 1,21±0,018 0,93±0,021 1,12±0,031 1,0±0,023 AA Aa Aa Aa Phụ lục 16: Kết kiểm tra kiểu gen dòng lúa chuyển gen mang gen Ubi:OsNAC1 STT U2.1 U2.2 U2.3 U2.4 U2.5 U3.1 U3.2 U3.3 U4.1 U4.2 U4.3 U4.4 U4.5 U4.6 U4.7 ΔCt Av ±SD 1,52±0,013 0,43±0,019 0,52±0,013 0,59±0,021 0,62±0,019 0,54±0,028 0,64±0,023 1,21±0,026 0,63±0,031 0,46±0,021 0,61±0,013 0,47±0,023 0,91±0,030 0,94±0,024 0,51±0,008 Kiểu gen AA Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa Aa AA AA Aa STT U4.8 U4.9 U4.10 U4.11 U5.1 U5.2 U5.3 U5.4 U6.1 U6.2 U6.3 U6.4 U6.5 U6.6 U6.7 ΔCt Av ±SD 0,48±0,021 0,41±0,016 0,59±0,030 1,08±0,027 0,41±0,015 1,15±0,019 0,52±0,021 0,97±0,015 0,41±0,019 0,53±0,030 0,48±0,021 0,91±0,018 0,55±0,009 1,02±0,028 0,61±0,009 Kiểu gen Aa Aa Aa AA Aa Aa Aa AA Aa Aa Aa AA Aa AA Aa Phụ lục 17: Xử lý số liệu thống kế kết phân tích số liệu đánh giá khả chịu hạn dòng lúa chuyển gen với dòng lúa không chuyển gen phần mềm excel L1.1 Mẫu p L4.1 Mức độ tin cậy p L4.2 Mức độ tin cậy p U4.2 Mức độ tin cậy U6.1 p Mức độ tin cậy p Mức độ tin cậy 0.049735563 * 0.008893298 ** Chỉ tiêu hình thái ĐC 0.00082628 *** 0.00923116 * Điều kiện thƣờng 0.03183048 * Điều kiện hạn Đối chứng ĐC 0.00147 ** 0.01198 * 0.00082 *** Chỉ tiêu sinh lý RWC Điều kiện thƣờng Đối chứng ĐC 0.03399 * 0.03399 * 0.17437 Điều kiện hạn 0.02356 * 0.00069 *** 0.27865 0.55398 Đối chứng ĐC 0.00147 ** 0.01198 * Đối chứng ĐC 0.43048 0.69381 0.00082 *** Chất diệp lục Chất diệp lục a Điều kiện thƣờng Điều kiện hạn 0.02356 * 0.70728 0.00069 *** 0.000002 *** Đối chứng ĐC 0.000003 *** 0.000009 *** 0.01211 * Chất diệp lục Điều kiện thƣờng Đối chứng ĐC 0.01668 * 0.000001 *** 0.000001 *** Điều kiện hạn 0.00001 *** 0.000004 *** Đối chứng ĐC 0.00400 ** 0.00003 *** 0.00001 *** Chất diệp lục tổng số Điều kiện thƣờng 0.00008 *** 0.00049 *** 0.01566 * 0.00001 *** Đối chứng ĐC 0.00000004 *** 0.31191 Đối chứng ĐC 0.00000002 *** 0.00002 *** Đối chứng ĐC 0.00003 *** Đối chứng ĐC 0.00003 *** 0.26075 Điều kiện hạn 0.36490 0.17346 0.02115 * Proline Điều kiện thƣờng 0.00008 *** 0.00049 *** 0.00272 *** 0.00337 ** Điều kiện hạn 0.00003 *** 0.00003 *** 0.00001 *** 0.00013 *** 0.00004 *** 0.00004 *** Ghi chú: hàm TTest sử dụng để kiểm định sai khác có ý nghĩa thống kê Trong đó, giá trị p ≤ 0,05, sai khác có ý nghĩa; giá trị p > 0,05, sai khác khơng có ý nghĩa Nếu p ≤ 0,0001 mức độ tin cậy lớn nhất, kí hiệu ***; 0,0001 < p < 0,001 mức độ tin cậy **, 0,001 ≤ p < 0,05 mức độ tin cậy * ... chịu tốt với điều kiện hạn Mục tiêu nghiên cứu Ph n lập, thiết kế vector chuyển gen mã hóa nh n tố phiên mã nhóm NAC liên quan tính chịu hạn từ giống lúa Việt Nam Tạo dòng lúa chuyển gen mã hóa. .. vật Nhiều nghiên cứu chứng minh c y lúa chuyển gen mã hóa nh n tố phiên mã tăng cƣờng khả chịu hạn so với c y không chuyển gen Nhóm gen mã hóa nh n tố phiên mã NAC họ nh n tố phiên mã lớn đặc... n tố phiên mã thuộc nhóm NAC có khả chống chịu hạn Đối tƣ ng v nội dung nghiên cứu Đối tượng nghiên cứu luận án: Các gen mã hóa nh n tố phiên mã nhóm NAC liên quan tới tính chịu hạn giống lúa

Ngày đăng: 23/12/2021, 18:30

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

w