Đăng nhập

Hãy chọn một cách để đăng nhập

Facebook Google Zalo

Hoặc tiếp tục với email

Nhớ mật khẩu

Chưa có tài khoản? Đăng ký

Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

102 12 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

1 / 102 trang

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang	102
Dung lượng	9,93 MB

Nội dung

Ngày đăng: 11/07/2021, 17:53

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Bảng 1.2: Một số visinh vật được nghiên cứu bằng phương pháp PCR. [23] - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Bảng 1.2 Một số visinh vật được nghiên cứu bằng phương pháp PCR. [23] (Trang 18)

Hình 2.1: Bản đồ thể hiện vị trí lấy mẫu ở xã Phong Hòa, Lai Vung, Đồng - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 2.1 Bản đồ thể hiện vị trí lấy mẫu ở xã Phong Hòa, Lai Vung, Đồng (Trang 23)

Bảng 2.1: Thành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Bảng 2.1 Thành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl (Trang 30)

 Thành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl ở bảng 2.1 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — h ành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl ở bảng 2.1 (Trang 30)

Bảng 2.3: Nồng độ pha gel polyacrylamine - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Bảng 2.3 Nồng độ pha gel polyacrylamine (Trang 35)

Sau khi pha gel polyacrylamide theo bảng 2.3, tiến hành phối trộn các nồng độ này vào hai xilanh - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — au khi pha gel polyacrylamide theo bảng 2.3, tiến hành phối trộn các nồng độ này vào hai xilanh (Trang 36)

Bảng 2.6: Thành phần Big – dye PCR - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Bảng 2.6 Thành phần Big – dye PCR (Trang 40)

 Một số hình ảnh ly trích và thu nhận trực tiếp DNA vi khuẩn từ các mẫu rơm: - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — t số hình ảnh ly trích và thu nhận trực tiếp DNA vi khuẩn từ các mẫu rơm: (Trang 42)

Hình 3.3: Mẫu sau khi ly tâm - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.3 Mẫu sau khi ly tâm (Trang 43)

Hình 3.5: Sau khi cho isopropanol, ủ 20 phút ở nhiệt độ phòng và ly tâm - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.5 Sau khi cho isopropanol, ủ 20 phút ở nhiệt độ phòng và ly tâm (Trang 43)

Hình 3.6: Kết quả điện di lần 1 Hình 3.7: Kết quả điện di lần 2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.6 Kết quả điện di lần 1 Hình 3.7: Kết quả điện di lần 2 (Trang 44)

Sau khi ly trích mẫu thu nhận DNA tồng số visinh vật với kết quả rất tốt ở hình 3.7, tiến hành tinh sạch DNA, kết quả điện di thu nhận sau khi tinh sạch ở hình 3.8 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — au khi ly trích mẫu thu nhận DNA tồng số visinh vật với kết quả rất tốt ở hình 3.7, tiến hành tinh sạch DNA, kết quả điện di thu nhận sau khi tinh sạch ở hình 3.8 (Trang 45)

Hình 3.9: Sản phẩm điện di sau khuếch đại đoạn gene 16S rDNA. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.9 Sản phẩm điện di sau khuếch đại đoạn gene 16S rDNA (Trang 46)

Sau khi tinh sạch mẫu với kết quả rất tốt như hình 3.10, trên đoạn gene 16S rDNA có kích thước 1600 bp, tiếp tục phân tích DGGE vùng V3 có kích thước < 200 bp, sử dụng cặp mồi 517R/357F – GC - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — au khi tinh sạch mẫu với kết quả rất tốt như hình 3.10, trên đoạn gene 16S rDNA có kích thước 1600 bp, tiếp tục phân tích DGGE vùng V3 có kích thước < 200 bp, sử dụng cặp mồi 517R/357F – GC (Trang 47)

Hình 3.10: Các mẫu chạy điện di sau khi tinh sạch đoạn 16S rDNA - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.10 Các mẫu chạy điện di sau khi tinh sạch đoạn 16S rDNA (Trang 47)

Hình 3.12: Kết quả tinh sạch vùng V3 của đoạn gene 16S rDNA. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.12 Kết quả tinh sạch vùng V3 của đoạn gene 16S rDNA (Trang 48)

Kết quả thu nhận được ở hình 3.12 rất tốt, cả 4 mẫu đều có DNA sau khi tinh sạch vùng V3 của đoạn 16S rDNA - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — t quả thu nhận được ở hình 3.12 rất tốt, cả 4 mẫu đều có DNA sau khi tinh sạch vùng V3 của đoạn 16S rDNA (Trang 48)

Với kết quả DGGE như hình 3.13 cho thấy các mẫu đều xuất hiện nhiều band, vì vậy tiến hành cắt band và PCR lại nhằm thu các band rõ ràng hơn - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — i kết quả DGGE như hình 3.13 cho thấy các mẫu đều xuất hiện nhiều band, vì vậy tiến hành cắt band và PCR lại nhằm thu các band rõ ràng hơn (Trang 49)

Hình 3.14: Kết quả PCR vùng V3 mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi DGGE lần 1. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.14 Kết quả PCR vùng V3 mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi DGGE lần 1 (Trang 49)

Từ kết quả ở hình 3.14 và 3.15 cho thấy hàm lượng DNA thu được sau khi PCR và tinh sạch vùng V3 rất tốt, các mẫu sau khi kiểm tra bằng điện di thể hiện các band rõ và đồng đều, từ đây tiến hành DGGE lần 2 với hai mẫu RT và R2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — k ết quả ở hình 3.14 và 3.15 cho thấy hàm lượng DNA thu được sau khi PCR và tinh sạch vùng V3 rất tốt, các mẫu sau khi kiểm tra bằng điện di thể hiện các band rõ và đồng đều, từ đây tiến hành DGGE lần 2 với hai mẫu RT và R2 (Trang 50)

Hình 3.18: Kết quả điện di các mẫu sau khi tinh sạch bằng QIAEX II. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.18 Kết quả điện di các mẫu sau khi tinh sạch bằng QIAEX II (Trang 51)

Hình 3.17: Kết quả các mẫu sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F và 517R. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.17 Kết quả các mẫu sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F và 517R. (Trang 51)

 Với mẫu RT2 và R2.6 sau khi DGGE lần 2 (hình 3.16) không cho thấy kết quả nên sẽ được tiến hành PCR lại lần 2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — i mẫu RT2 và R2.6 sau khi DGGE lần 2 (hình 3.16) không cho thấy kết quả nên sẽ được tiến hành PCR lại lần 2 (Trang 52)

Hình 3.20: Kết quả điện di mẫu RT (hình 3.20a) và R2 (3.20b) sau tinh sạch sản phẩm PCR vùng V 3 sau khi thực hiện phương pháp DGGE lần 2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.20 Kết quả điện di mẫu RT (hình 3.20a) và R2 (3.20b) sau tinh sạch sản phẩm PCR vùng V 3 sau khi thực hiện phương pháp DGGE lần 2 (Trang 53)

Hình 3.21: Kết quả điện di DGGE lần 3. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.21 Kết quả điện di DGGE lần 3 (Trang 54)

Hình 3.23: Kết quả điện di mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi tinh sạch vùng V3 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.23 Kết quả điện di mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi tinh sạch vùng V3 (Trang 55)

Hình 3.22: Kết quả các mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F/517R - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.22 Kết quả các mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F/517R (Trang 55)

Hình 3.24: Cây phân loài mẫu rơm tươi (RT) - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.24 Cây phân loài mẫu rơm tươi (RT) (Trang 59)

Hình 3.25: Cây phân loài của mẫu rơm ủ2 ngày (R2) - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm — Hình 3.25 Cây phân loài của mẫu rơm ủ2 ngày (R2) (Trang 60)

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN