1. Trang chủ
  2. Luận Văn - Báo Cáo

Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

102 12 0
Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

Ngày đăng: 11/07/2021, 17:53

Xem thêm:

Hình ảnh liên quan

Bảng 1.2: Một số visinh vật được nghiên cứu bằng phương pháp PCR. [23] - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Bảng 1.2.

Một số visinh vật được nghiên cứu bằng phương pháp PCR. [23] Xem tại trang 18 của tài liệu.
Hình 2.1: Bản đồ thể hiện vị trí lấy mẫu ở xã Phong Hòa, Lai Vung, Đồng - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 2.1.

Bản đồ thể hiện vị trí lấy mẫu ở xã Phong Hòa, Lai Vung, Đồng Xem tại trang 23 của tài liệu.
Bảng 2.1: Thành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Bảng 2.1.

Thành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl Xem tại trang 30 của tài liệu.
 Thành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl ở bảng 2.1 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

h.

ành phần phản ứng PCR với tổng thể tích 50µl ở bảng 2.1 Xem tại trang 30 của tài liệu.
Bảng 2.3: Nồng độ pha gel polyacrylamine - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Bảng 2.3.

Nồng độ pha gel polyacrylamine Xem tại trang 35 của tài liệu.
Sau khi pha gel polyacrylamide theo bảng 2.3, tiến hành phối trộn các nồng độ này vào hai xilanh - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

au.

khi pha gel polyacrylamide theo bảng 2.3, tiến hành phối trộn các nồng độ này vào hai xilanh Xem tại trang 36 của tài liệu.
Bảng 2.6: Thành phần Big – dye PCR - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Bảng 2.6.

Thành phần Big – dye PCR Xem tại trang 40 của tài liệu.
 Một số hình ảnh ly trích và thu nhận trực tiếp DNA vi khuẩn từ các mẫu rơm: - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

t.

số hình ảnh ly trích và thu nhận trực tiếp DNA vi khuẩn từ các mẫu rơm: Xem tại trang 42 của tài liệu.
Hình 3.3: Mẫu sau khi ly tâm - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.3.

Mẫu sau khi ly tâm Xem tại trang 43 của tài liệu.
Hình 3.5: Sau khi cho isopropanol, ủ 20 phút ở nhiệt độ phòng và ly tâm - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.5.

Sau khi cho isopropanol, ủ 20 phút ở nhiệt độ phòng và ly tâm Xem tại trang 43 của tài liệu.
Hình 3.6: Kết quả điện di lần 1 Hình 3.7: Kết quả điện di lần 2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.6.

Kết quả điện di lần 1 Hình 3.7: Kết quả điện di lần 2 Xem tại trang 44 của tài liệu.
Sau khi ly trích mẫu thu nhận DNA tồng số visinh vật với kết quả rất tốt ở hình 3.7, tiến hành tinh sạch DNA, kết quả điện di thu nhận sau khi tinh sạch ở hình 3.8 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

au.

khi ly trích mẫu thu nhận DNA tồng số visinh vật với kết quả rất tốt ở hình 3.7, tiến hành tinh sạch DNA, kết quả điện di thu nhận sau khi tinh sạch ở hình 3.8 Xem tại trang 45 của tài liệu.
Hình 3.9: Sản phẩm điện di sau khuếch đại đoạn gene 16S rDNA. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.9.

Sản phẩm điện di sau khuếch đại đoạn gene 16S rDNA Xem tại trang 46 của tài liệu.
Sau khi tinh sạch mẫu với kết quả rất tốt như hình 3.10, trên đoạn gene 16S rDNA có kích thước 1600 bp, tiếp tục phân tích DGGE vùng V3 có kích thước < 200 bp, sử dụng cặp mồi 517R/357F – GC - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

au.

khi tinh sạch mẫu với kết quả rất tốt như hình 3.10, trên đoạn gene 16S rDNA có kích thước 1600 bp, tiếp tục phân tích DGGE vùng V3 có kích thước < 200 bp, sử dụng cặp mồi 517R/357F – GC Xem tại trang 47 của tài liệu.
Hình 3.10: Các mẫu chạy điện di sau khi tinh sạch đoạn 16S rDNA - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.10.

Các mẫu chạy điện di sau khi tinh sạch đoạn 16S rDNA Xem tại trang 47 của tài liệu.
Hình 3.12: Kết quả tinh sạch vùng V3 của đoạn gene 16S rDNA. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.12.

Kết quả tinh sạch vùng V3 của đoạn gene 16S rDNA Xem tại trang 48 của tài liệu.
Kết quả thu nhận được ở hình 3.12 rất tốt, cả 4 mẫu đều có DNA sau khi tinh sạch vùng V3 của đoạn 16S rDNA - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

t.

quả thu nhận được ở hình 3.12 rất tốt, cả 4 mẫu đều có DNA sau khi tinh sạch vùng V3 của đoạn 16S rDNA Xem tại trang 48 của tài liệu.
Với kết quả DGGE như hình 3.13 cho thấy các mẫu đều xuất hiện nhiều band, vì vậy tiến hành cắt band và PCR lại nhằm thu các band rõ ràng hơn - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

i.

kết quả DGGE như hình 3.13 cho thấy các mẫu đều xuất hiện nhiều band, vì vậy tiến hành cắt band và PCR lại nhằm thu các band rõ ràng hơn Xem tại trang 49 của tài liệu.
Hình 3.14: Kết quả PCR vùng V3 mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi DGGE lần 1. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.14.

Kết quả PCR vùng V3 mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi DGGE lần 1 Xem tại trang 49 của tài liệu.
Từ kết quả ở hình 3.14 và 3.15 cho thấy hàm lượng DNA thu được sau khi PCR và tinh sạch vùng V3 rất tốt, các mẫu sau khi kiểm tra bằng điện di thể hiện các band rõ và đồng đều, từ đây tiến hành DGGE lần 2 với hai mẫu RT và R2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

k.

ết quả ở hình 3.14 và 3.15 cho thấy hàm lượng DNA thu được sau khi PCR và tinh sạch vùng V3 rất tốt, các mẫu sau khi kiểm tra bằng điện di thể hiện các band rõ và đồng đều, từ đây tiến hành DGGE lần 2 với hai mẫu RT và R2 Xem tại trang 50 của tài liệu.
Hình 3.18: Kết quả điện di các mẫu sau khi tinh sạch bằng QIAEX II. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.18.

Kết quả điện di các mẫu sau khi tinh sạch bằng QIAEX II Xem tại trang 51 của tài liệu.
Hình 3.17: Kết quả các mẫu sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F và 517R. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.17.

Kết quả các mẫu sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F và 517R. Xem tại trang 51 của tài liệu.
 Với mẫu RT2 và R2.6 sau khi DGGE lần 2 (hình 3.16) không cho thấy kết quả nên sẽ được tiến hành PCR lại lần 2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

i.

mẫu RT2 và R2.6 sau khi DGGE lần 2 (hình 3.16) không cho thấy kết quả nên sẽ được tiến hành PCR lại lần 2 Xem tại trang 52 của tài liệu.
Hình 3.20: Kết quả điện di mẫu RT (hình 3.20a) và R2 (3.20b) sau tinh sạch sản phẩm PCR vùng V 3 sau khi thực hiện phương pháp DGGE lần 2 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.20.

Kết quả điện di mẫu RT (hình 3.20a) và R2 (3.20b) sau tinh sạch sản phẩm PCR vùng V 3 sau khi thực hiện phương pháp DGGE lần 2 Xem tại trang 53 của tài liệu.
Hình 3.21: Kết quả điện di DGGE lần 3. - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.21.

Kết quả điện di DGGE lần 3 Xem tại trang 54 của tài liệu.
Hình 3.23: Kết quả điện di mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi tinh sạch vùng V3 - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.23.

Kết quả điện di mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi tinh sạch vùng V3 Xem tại trang 55 của tài liệu.
Hình 3.22: Kết quả các mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F/517R - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.22.

Kết quả các mẫu RT (a) và R2 (b) sau khi PCR vùng V3 với cặp mồi 357F/517R Xem tại trang 55 của tài liệu.
Hình 3.24: Cây phân loài mẫu rơm tươi (RT) - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.24.

Cây phân loài mẫu rơm tươi (RT) Xem tại trang 59 của tài liệu.
Hình 3.25: Cây phân loài của mẫu rơm ủ2 ngày (R2) - Xác định cộng đồng vi sinh bằng phương pháp pcr và dgge từ rơm trước và sau khi xử lý trồng nấm rơm

Hình 3.25.

Cây phân loài của mẫu rơm ủ2 ngày (R2) Xem tại trang 60 của tài liệu.

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan