Chuẩn hóa mức xám ảnh mr

BỘ CÔNG THƢƠNG TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHIỆP THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH TRẦN HÀ XN TRANG CHUẨN HĨA MỨC XÁM ẢNH MR Chuyên ngành: KHOA HỌC MÁY TÍNH Mã chuyên ngành: 6080101 LUẬN VĂN THẠC SĨ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2019 Cơng trình đƣợc hồn thành Trƣờng Đại học Cơng nghiệp TP Hồ Chí Minh Ngƣời hƣớng dẫn khoa học: PGS TS Huỳnh Trung Hiếu Ngƣời phản iện 1: TS Lê Thành Sách Ngƣời phản iện 2: TS Lê Nhật Duy Luận v n thạc s đƣợc ảo vệ Hội đồng ch m ảo vệ Luận v n thạc s Trƣờng Đại học Công nghiệp thành phố Hồ Chí Minh ngày 21 tháng 10 n m 2019 Thành phần Hội đồng đánh giá luận v n thạc s gồm: PGS TS Phạm Thế Bảo - Chủ tịch hội đồng TS Lê Thành Sách - Phản iện TS Lê Nhật Duy - Phản iện PGS TS Nguyễn Hoà - Ủy viên TS Đặng Thị Phúc - Thƣ ký CHỦ TỊCH HỘI ĐỒNG TRƢỞNG KHOA CÔNG NGHỆ THÔNG TIN BỘ CÔNG THƢƠNG TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHIỆP THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH CỘNG HÕA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc NHIỆM VỤ LUẬN VĂN THẠC SĨ Họ tên học viên: Trần Hà Xuân Trang MSHV: 15001281 Ngày, tháng, n m sinh: 01/03/1975 Nơi sinh: Tây Ninh Chuyên ngành: Khoa học máy tính Mã chuyên ngành: 60480101 I TÊN ĐỀ TÀI: Chuẩn hóa mức xám ảnh MR NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG: Tìm hiểu ản ảnh cộng hƣởng từ Nghiên cứu số thuật toán hu n luyện chuyển đổi truyền thống Nghiên cứu Phƣơng pháp chuẩn hóa ảnh MR với điểm móc (Trung vị median; Nhị phân vị - inary position; Tứ phân vị - quartiles; Thập phân vị deciles) chạy thử nghiệm kết ảnh MR trƣớc sau chuyển đổi II NGÀY GIAO NHIỆM VỤ: ngày 26 tháng 12 n m 2017 III NGÀY HOÀN THÀNH NHIỆM VỤ: ngày 26 tháng 06 n m 2018 IV NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS Huỳnh Trung Hiếu Tp Hồ Chí Minh, ngày … tháng … năm 20 … NGƢỜI HƢỚNG DẪN CHỦ NHIỆM BỘ MÔN ĐÀO TẠO PGS TS Huỳnh Trung Hiếu TRƢỞNG KHOA CÔNG NGHỆ THƠNG TIN LỜI CẢM ƠN Để hồn thành chƣơng trình cao học viết đề tài này, em nhận đƣợc hƣớng dẫn, giúp đỡ góp ý nhiệt tình từ q Thầy Cơ trƣờng Đại học Cơng nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh Trƣớc hết, em xin chân thành cảm ơn đến quý Thầy Cô khoa Công nghệ Thơng tin tận tình dạy ảo, truyền đạt cho em nhiều kiến thức quý áu suốt thời gian học tập Trƣờng Em xin gửi lời iết ơn sâu sắc đến PGS TS Huỳnh Trung Hiếu Thầy dành r t nhiều thời gian tâm huyết hƣớng dẫn nghiên cứu giúp em hoàn thành đề tài tốt nghiệp Tôi xin chân thành cảm ơn gia đình, ạn è đồng nghiệp ln quan tâm động viên, ủng hộ giúp đỡ r t nhiều thời gian qua Mặc dù em có nhiều cố gắng để hồn thiện đề tài, nhiên khơng thể tránh khỏi thiếu sót, r t mong nhận đƣợc đóng góp q áu q Thầy Cơ ạn Xin chân thành cảm ơn i TÓM TẮT LUẬN VĂN THẠC SĨ Trong đề tài này, học viên nghiên cứu phƣơng pháp “Chuẩn hóa mức xám ảnh MR” gồm hai ƣớc Bƣớc gọi ƣớc hu n luyện với đầu vào tập hợp ảnh vùng thể, tham số iểu đồ đƣợc rút từ liệu ảnh tham số đƣợc ổ sung đầu vào Các tham số ổ sung đƣợc điều chỉnh khác để sử dụng chuyển đổi, vùng thể đƣợc sử dụng cho liệu đƣợc chuyển đổi Bƣớc gọi ƣớc chuyển đổi ảnh đƣợc thực ằng cách sử dụng điểm mốc đƣợc hu n luyện ƣớc Bƣớc chuyển đổi phụ thuộc vào ảnh nên đƣợc thực cho ảnh Trong trình nghiên cứu đề tài, học viên nghiên cứu sử dụng ộ liệu ảnh *.dcm để hu n luyện chuyển đổi ảnh ii ABSTRACT In this thesis, the method study "Standardize the gray level MR image" consists of two steps Step is called a training step with the input is a set of pictures of a body region, the parameters of the chart are drawn from the image data and the parameters are added to the input The additional parameters will be adjusted differently to use conversion, the body region is used for the converted data Step is called the image conversion step using the landmarks trained in step This conversion step depends on the image so it will be done for each image During the research of the project, research students use the * dcm image data set to train and convert images iii LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu ản thân Các kết nghiên cứu kết luận luận v n trung thực, không chép từ kỳ nguồn dƣới t t kỳ hình thức Việc tham khảo nguồn tài liệu đƣợc thực trích dẫn ghi nguồn tài liệu tham khảo quy định Học viên Trần Hà Xuân Trang iv MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i TÓM TẮT LUẬN VĂN THẠC SĨ ii ABSTRACT iii LỜI CAM ĐOAN iv MỤC LỤC .v DANH MỤC HÌNH ẢNH vii DANH MỤC BẢNG BIỂU viii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ix MỞ ĐẦU 1 Đặt v n đề .1 Mục tiêu đề tài .1 Đối tƣợng phạm vi nghiên cứu Cách tiếp cận phƣơng pháp nghiên cứu Ý ngh a thực tiễn đề tài CHƢƠNG 1.1 CƠ BẢN VỀ ẢNH CỘNG HƢỞNG TỪ Trƣờng điện từ 1.1.1 Từ tính Từ trƣờng 1.1.2 Khả n ng Từ hóa ch t 1.1.3 Cảm ứng Điện từ 1.1.4 Sóng Điện từ 1.1.5 Pha sóng Điện từ 1.1.6 Phổ sóng Điện từ 1.2 Hiện tƣợng Cộng hƣởng từ 1.2.1 Cộng hƣởng từ Hạt nhân NMR 1.2.2 Tác dụng Từ trƣờng 10 1.2.3 Độ từ hóa thực 14 1.2.4 Xung kích thích RF 15 v 1.3 Giới thiệu ảnh cộng hƣởng từ 16 1.3.1 Nguyên tắc chụp hình 16 1.3.2 Nguyên lý tƣơng phản 16 CHƢƠNG PHƢƠNG PHÁP CHUẨN HÓA MỨC XÁM 18 2.1 Giới thiệu 18 2.2 Các cột mốc iểu đồ 18 2.3 Phƣơng pháp chuẩn hóa mức xám .20 2.4 Thuật toán 21 2.4.1 Thuật toán 21 2.4.2 Thuật toán 22 2.5 Các iến thể 23 2.5.1 Chọn tham số chuẩn .23 2.5.2 Chọn c u hình điểm mốc 24 2.5.3 Chọn hàm ánh xạ 24 CHƢƠNG THỰC NGHIỆM 26 3.1 Mô tả liệu 26 3.2 Đánh giá trực quan .26 3.3 Đánh giá thực nghiệm: .28 3.3.1 So sánh ảnh trƣớc sau chuyển đổi 28 3.3.2 So sánh tập liệu khác 30 3.3.3 So sánh định lƣợng: 33 KẾT LUẬN VÀ HƢỚNG PHÁT TRIỂN 35 Kết đạt đƣợc 35 Hạn chế .35 Hƣớng phát triển 35 TÀI LIỆU THAM KHẢO .36 LÝ LỊCH TRÍCH NGANG 38 vi DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Hình ảnh sóng hình sine điển hình Hình 1.2 Phổ tần số sóng điện từ Hình 1.3 Chuyển ật trạng thái n ng lƣợng 10 Hình 1.4 Trục quay ngẫu nhiên proton 11 Hình 1.5 Khi có tác dụng từ trƣờng B0 12 Hình 1.6 Chuyển động quay proton 13 Hình 1.7 Từ trƣờng ngồi B0 tạo độ từ hóa thực hay độ từ hóa dọc .14 Hình 1.8 Độ từ hóa dọc ị “lật ngang” hồn tồn thành độ từ hóa ngang 15 Hình 1.9 Hình trọng T1, T2 TPD cắt ngang não 17 Hình 2.1 Biểu đồ imodal unimodal 19 Hình 2.2 Minh họa cách tìm iểu đồ chuẩn 20 Hình 2.3 Biểu đồ đƣợc l y điểm móc 21 Hình 3.1 Hình trƣớc sau Map 27 Hình 3.2 Hình ảnh trƣớc sau chuyển đổi .29 Hình 3.3 Biểu đồ mức xám trƣớc chuyển đổi .29 Hình 3.4 Biểu đồ mức xám sau chuyển đổi 30 Hình 3.5 Hình ảnh sau chuyển đổi tập liệu .32 vii 2.5.1.4 Định lý  Định lý 3: P P , D D , ảnh Vi  PD ộ chuẩn T V Vi đáp ứng i điều kiện Định lý cho    x TV x TV x i i t kỳ cƣờng độ x1, x2 Vi, < x2 2.5.2 Chọn cấu hình điểm mốc Việc lựa chọn điểm mốc yếu tố r t quan trọng thực tế Phƣơng pháp chọn điểm mốc L1 báo [3] hoạt động tốt số giao thức vùng thể nhiên số trƣờng hợp điểm mốc L1 hoạt động chƣa phù hợp Để ao quát cho trƣờng hợp, việc chọn thêm c u hình điểm mốc nhƣ: Trung vị (median), Nhị phân vị ( inary position), Tứ phân vị (quartiles), Thập phân vị (deciles), cần thiết Đây phƣơng pháp l y phần tr m, phần tr m ị cắt ỏ p1i , p2i chọn điểm phần tr m khác đƣợc kí hiệu μ1i , μ 2i , , μ li Ví dụ: Trong trƣờng hợp tứ phân vị Ta có: l = 3, μ1i , μ 2i , μ3i , tƣơng ứng 25, 50, 75 phần tr m Trong trƣờng hợp thập phân vị Ta có: l = 9, μ1i , μ 2i , , μ 9i , tƣơng ứng 10, 20, …, 90 phần tr m 2.5.3 Chọn hàm ánh xạ Có thể sử dụng nhiều phƣơng pháp khác để chuẩn hóa mức xám phù hợp với loại liệu đầu vào ứng dụng: Có thể dụng cách định ngh a điểm mốc iểu đồ khác (không nh t thiết phải dùng phần tr m); Sử dụng hàm đa thức để kéo dài phân đoạn iểu đồ; Sử dụng kỹ thuật spline,….Trong đề tài sử dụng kỹ 24 thuật spline thay cho việc kéo dài tuyến tính phân đoạn đƣợc thay ƣớc thuật tốn 25 CHƢƠNG 3.1 THỰC NGHIỆM Mơ tả liệu Trong đề tài tiến hành so sánh cho giao thức MRI sau: FSE Pd, FSE T2 T1E, với giao thức tham số thu nhận hình ảnh giống nhau, hình ảnh nghiên cứu từ tập liệu ảnh MR Gan từ đại học Chicago ệnh viện Hoà Hảo số 254 Quận 10 thành phố Hồ Chí Minh gồm 1,124 ảnh, kích thƣớc ảnh 256x256, với độ phân giải 0,86 x 0,86 (in-plane), giá trị mức xám đƣợc iểu diễn ằng số ngun 12 it, khơng có tiền xử lý t kỳ hình ảnh đƣợc chia thành 14 tập liệu nhƣ Bảng 3.1 Bảng 3.1 Mô tả tập liệu thử nghiệm STT 10 11 12 13 14 3.2 Tên tập liệu MRI001 MRI002 MRI003 MRI004 MRI007 MRI008 MRI012 MRI014 MRI002 MRI003 MRI004 MRI006 MRI009 MRI012 Số lƣợng ảnh 112 88 96 100 88 112 100 96 56 56 56 56 52 56 Đánh giá trực quan Nghiên cứu Gan l y từ Đại học Chicago gồm tập liệu ảnh, tập ảnh có phase phase chứa từ 88 đến 112 ảnh Các tập ảnh phase tối phase 2, phase phase sáng dần Sử dụng phần mềm A ras để xem ảnh 26 Map chúng mức chuẩn Nếu ảnh tối kéo xuống cịn ảnh sáng kéo lên mức width – center l y tập liệu MRI002 chứa 88 ảnh đƣợc mô tả nhƣ Hình 3.1 Phase Img0001 Phase Img0089 Phase Img0117 Phase Img0265 Trƣớc Sau Hình 3.1 Hình trƣớc sau Map 27 Trong đề tài đánh giá iến đổi iến thể trƣớc sau chuyển đổi ằng phƣơng pháp chuẩn hóa nghiên cứu Đề tài thực so sánh trực quan yếu tố 1), 2) 3) để xem xét iến đổi iến thể Các iến thể đƣợc đánh giá ởi số giao thức ảnh giới hạn vùng thề Bảng 3.2 Tham số sử dụng cho phƣơng thức Phƣơng thức pc1 _ 0 0 pc2 _ 99.8 99.8 99.8 99.8 s1 _ 1 1 s2 _ 4095 4095 4095 4095 Điểm móc None Mode Trung vị Tứ phân vị Thập phân vị Trong Bảng 3.2, thể tham số sử dụng cho phƣơng thức việc thực so sánh Các phƣơng thức chuẩn hóa mức xám đƣợc đánh số từ đến Phƣơng thức đƣợc đánh số không sử dụng tham số (khơng có sử dụng phƣơng pháp chuẩn hố mức xám), Phƣơng thức đƣợc đánh số 1, 2, 3, tham số tƣơng ứng cho L1, L2, L3, L4 (Ví dụ L3 = {0, 99.8, 25, 50, 75}) Các đánh giá đƣợc tiến hành nhƣ sau: Đầu tiền hình ảnh trƣớc sau chuyển đổi, sau so sánh định lƣợng đƣợc mô tả ằng ảng Các thử nghiệm đƣợc sử dụng ánh xạ tuyến tính Việc hu n luyện đƣợc thực ệnh nhân khác giao thức vùng thể 3.3 Đánh giá thực nghiệm: 3.3.1 So sánh ảnh trước sau chuyển đổi Trong thí nghiệm sử dụng tập liệu MRI002, hu n luyện 88 ảnh tập liệu chuyển đổi ảnh img0089 ƣớc hai, kết thu đƣợc nhƣ (Hình 3.2): 28 Trƣớc Sau Hình 3.2 Hình ảnh trƣớc sau chuyển đổi Biểu đồ mức xám sau cho th y rõ iến đổi ảnh Hình 3.3 Biểu đồ mức xám trƣớc chuyển đổi 29 Hình 3.4 Biểu đồ mức xám sau chuyển đổi 3.3.2 So sánh tập liệu khác Trong thử nghiệm, phƣơng thức sử dụng tập liệu đƣợc mô tả Bảng 3.1, tập liệu sử dụng 80 ảnh liên tiếp để hu n luyện, sau tập liệu l y ảnh để chuyển đổi (Bảng 3.3) Bảng 3.3 Mô tả chi tiết việc sử dụng liệu thử nghiệm Thử nghiệm Tên tập liệu MRI001 MRI002 MRI012 MRI001 MRI002 MRI012 MRI001 MRI002 MRI012 MRI001 MRI002 MRI012 Ảnh huấn luyện Ảnh chuyển đổi img0113 đến img0224 img0089 đến img0176 img0101 đến img0200 img0113 đến img0224 img0089 đến img0176 img0101 đến img0200 img0113 đến img0224 img0089 đến img0176 img0101 đến img0200 img0113 đến img0224 img0089 đến img0176 img0101 đến img0200 img0113 img0089 img0101 img0113 img0089 img0101 img0113 img0089 img0101 img0113 img0089 img0101 30 Kết sau thực thử nghiệm (Hình 3.5), dịng phƣơng thức hình ảnh chƣa qua q trình chuyển đổi ảnh Dịng đến kết chuyển đổi tƣơng ứng phƣơng thức đến 31 Hình 3.5 Hình ảnh sau chuyển đổi tập liệu 32 3.3.3 So sánh định lượng: Dữ liệu đƣợc mô tả nhƣ phần 3.1 tham số sử dụng nhƣ Bảng 3.2, việc kiểm tra cho giao thức: FSE Pd, FSE T2 T1E tƣơng tự nhƣ Hai lần quét thời điểm khác đƣợc chọn từ 14 ệnh nhân t kỳ từ sở liệu ệnh nhân nghiên cứu Hai lần quét ệnh nhân nằm khoảng thời gian từ – n m Đối với ệnh nhân lần quét lần quét thứ cƣờng độ tiêu chuẩn dựa chênh lệch cƣờng độ lần quét thứ nh t lần quét thứ Các ảnh gốc có độ phân giải, số lƣợng Sự thay đổi giá trị mức xám vùng ị ệnh khác xa với mức xám ảnh đƣợc thu nhận, để loại ỏ iến thể có cƣờng độ mức xám loại so sánh mức xám chứa mơ (hỗn hợp) Trong hai hình ảnh ệnh nhân mức xám có giá trị lớn nhỏ, đƣợc phân đoạn[10] loại ỏ mức xám loại dùng để so sánh Tuy nhiên trình hu n luyện khơng thực phân đoạn này, tồn ộ giá trị mức xám iểu đồ đƣợc sử dụng, mức xám việc nghiên cứu MS chiếm phần nhỏ, giá trị mức xám có giá trị cƣờng độ cao 99,8% chiếm đa số Khối lƣợng nhỏ giá trị mức xám có cƣờng độ cao khơng làm thay đổi đáng kể cho phƣơng thức trung vị mốc khác Sự giống hình ảnh đƣợc chọn loại ỏ giá trị mức xám không phù hợp, đƣợc đo ằng chênh lệch cƣờng độ ình phƣơng trung ình đƣợc chuẩn hóa với phạm vi an đầu hình ảnh (ký hiệu NMSD) Cách làm tƣơng tự cho cặp hình ảnh khác cho phƣơng pháp Bảng 3.4 cho th y giá trị trung ình (Mean) độ lệch chuẩn (Sd) NMSD sau lần chuyển đổi nhỏ so với trƣớc chuyển đổi 33 Bảng 3.4 Giá trị trung ình độ lệch chuẩn NMSD So sánh trƣớc sau chuẩn hóa tƣơng ứng cho 14 cặp liệu FSE Pd FSE T2 TIE Method Mean Sd Mean Sd Mean Sd 0.0099 0.0094 0.0093 0.0085 0.0025 0.0018 0.0039 0.0055 0.0036 0.0050 0.0020 0.0018 0.0039 0.0057 0.0035 0.0050 0.0020 0.0018 0.0040 0.0057 0.0033 0.0045 0.0020 0.0018 0.0039 0.0054 0.0028 0.0036 0.0019 0.0016 Trong Bảng 3.4 ta có 14 ệnh nhân, ệnh nhân đƣợc quét ảnh MR hai lần mức xám chuẩn dựa chênh lệch mức xám lần quét thứ nh t thứ hai (một cặp), 14 ệnh nhân ta có 14 cặp (ví dụ: cặp đặt vào vị trí phƣơng thức 0, giao thức FSE Pd) Khi loại ỏ giá trị mức xám không phù hợp, đƣợc đo ằng chênh lệch mức xám so với mức xám chuẩn (Sd) mức xám trung ình (Mean) đƣợc chuẩn hóa so với phạm vi an đầu hình ảnh (ký hiệu NMSD) Khi hai giá trị Mean, Sd lớn việc loại ỏ mức xám (tổn thƣơng) không mịn, ngƣợc lại Mean, Sd nhỏ việc loại ỏ mức xám (tổn thƣơng) mịn (mức xám tổn thƣơng đƣợc loại ỏ nhiều) Ta th y phƣơng thức giá trị Mean, Sd giao thức lớn so với phƣơng thức (1-4) 34 KẾT LUẬN VÀ HƢỚNG PHÁT TRIỂN Kết đạt đƣợc Về mặt lý thuyết, đề tài mô tả phƣơng pháp chuẩn hóa mức xám [3], đồng thời giới thiệu phƣơng pháp chuẩn hóa đƣợc cải tiến ằng cách phân chia điểm mốc:  Chia iểu đồ thành hai phân đoạn ằng giá trị trung ình (Trung vị - median)  Chia đôi iểu đồ thành hai phân đoạn (Nhị phân vị - binary position)  Chia iểu đồ thành ốn phân đoạn (Tứ phân vị - quartiles)  Chia biểu đồ thành mƣời phân đoạn (Thập phân vị - deciles) Việc sử dụng điểm mốc làm cho ch t lƣợng chuẩn hóa ảnh tốt hơn, phạm vi giá trị mức xám phù hợp Về mặt thực hành, đề tài xây dựng đƣợc chƣơng trình chuyển đổi ảnh MR Một số kết chạy thử nghiệm với chức n ng chuyển đổi với tập liệu đƣợc trình ày phần Hạn chế Việc thực thi chƣơng trình cịn phải thực thủ cơng tùy vào máy chụp, vùng thể, … Mà ngƣời dùng chọn điểm mốc cho phù hợp Hƣớng phát triển Trong tƣơng lai, đề tài dự kiến tiếp tục nghiên cứu số hƣớng phát triển nhƣ sau:  Thực chƣơng trình nhƣ mơ tả nhƣng hoạt động tự động  Hệ thống lƣu trữ, truyền thông ằng ảnh DICOM 35 TÀI LIỆU THAM KHẢO [1] László G Nyúl et al “New Variants of a Method of MRI Scale Standardization,” IEEE Trans Med Imag Vol 19, no 2, pp 143–150, Feb 2000 [2] L G Nyúl and J K Udupa “On standardizing the MR image intensity scale,” Radiology Vol 209P, pp 581–582, 1998 [3] L G Nyúl and J K Udupa “An approach to standardize the MR image intensity scale,” in Proc SPIE Medical Imaging Vol 3658, S K Mun and Y Kim, Eds., San Diego, CA, pp 595–603, 1999 [4] L G Nyúl and J K Udupa “On standardizing the MR image intensity scale,” Magn Reson Med Vol 42, pp 1072–1081, 1999 [5] Sabine müller el at “The Standardized Histogram Shift of T2 Magnetic Resonance Image (MRI) Signal Intensities of Nephroblastoma Does Not Predict Histopathological Diagnostic Information,” CanCer InformatICs 2015 [6] Oleh Dzyubachyk el at “Inter-Station Intensity Standardization for WholeBody MR Data,” Wiley Periodicals 2016 [7] J C Bezdek et al “Review of MR image seg mentation techniques using pattern recognition,” Med Phys Vol 20, no 4, pp 1033–1048, 1993 [8] L P Clarke et al “MRI Sta ility of three supervised segmen tation techniques,” Magn Reson Imag Vol 11, no 1, pp 95–106, 1993 [9] R Kikinis et al “Routine quantitative analysis of rain and cere rospinal fluid spaces with MR imaging,” J Magn Reson Imag Vol 2, no 6, pp 619– 629, 1992 [10] J K Udupa et al “Multiple sclerosis lesion quantification using fuzzy connectedness principles,” IEEE Trans Med Imag Vol 16, no 5, pp 598– 609, 1997 [11] W A Edelstein et al “A signal-to-noise calibration procedure for NMR imaging systems,” Med Phys Vol 11, no 2, pp 180–185, 1984 36 [12] T Yamamoto et al “Accurate and practical cali ration of MR signal intensities by the new transmission amplitude method: Application of the numerical diagnosis to MRI,” Ra-diology Vol 209P, p 582, 1998 [13] Trần Đức Quang “Cộng hƣởng từ y học MRI.” Internet: https://www.facebook.com/groups/370548936810200/learning_content/, Oct.25,2019 [14] Chris Rorden “dcm2nii DICOM to NifTI convertsion.” http://people.cas.sc.edu/rorden/mricron/dcm2nii.html, Dec.10,2018 37 Internet: LÝ LỊCH TRÍCH NGANG I LÝ LỊCH SƠ LƢỢC: Họ tên: TRẦN HÀ XUÂN TRANG Giới tính: Nữ Ngày, tháng, n m sinh: 01/03/1975 Nơi sinh: Tây Ninh Email: tranhaxuantrang@gmail.com Điện thoại: 0902367805 II QUÁ TRÌNH ĐÀO TẠO: - Từ nhỏ đến n m 1993: Học chƣơng trình phổ thơng - Từ n m 1993 đến 1998: Học Đại học kinh tế Tp HCM ngành Tài kế toán doanh nghiệp - Từ 1998 đến 2000: Học Kỷ thuật viên hệ Trung c p trƣờng Đại học Khoa học tự Nhiên Tp HCM ngành Tin học - Từ n m 2008 đến 2011: Học Đại học Công nghệ thông tin Tp HCM ngành Công nghệ thông tin - Từ n m 2015 đến : Học Thạc s trƣờng Đại học Công nghiệp Tp HCM ngành khoa học máy tính III Q TRÌNH CƠNG TÁC CHUN MƠN: Thời gian 2000 – 2003 Nơi cơng tác Cơng việc đảm nhiệm Trƣờng THPT Lê Quý Đôn Nhân viên (Tây Ninh) 2003 – 2007 Trƣờng THPT Dân Lập (Tây Ninh) Nhân viên 2007 đến Trƣờng TH-THCS-THPT Nguyễn Bỉnh Khiêm (Tây Ninh) Hành quản trị Tp HCM, ngày tháng Năm 20…… Ngƣời khai Trần Hà Xuân Trang 38 ... nghiệm STT 10 11 12 13 14 3.2 Tên tập liệu MRI001 MRI002 MRI003 MRI004 MRI007 MRI008 MRI012 MRI014 MRI002 MRI003 MRI004 MRI006 MRI009 MRI012 Số lƣợng ảnh 112 88 96 100 88 112 100 96 56 56 56 56... Pd) Khi loại ỏ giá trị mức xám không phù hợp, đƣợc đo ằng chênh lệch mức xám so với mức xám chuẩn (Sd) mức xám trung ình (Mean) đƣợc chuẩn hóa so với phạm vi an đầu hình ảnh (ký hiệu NMSD) Khi... ĐỀ TÀI: Chuẩn hóa mức xám ảnh MR NHIỆM VỤ VÀ NỘI DUNG: Tìm hiểu ản ảnh cộng hƣởng từ Nghiên cứu số thuật toán hu n luyện chuyển đổi truyền thống Nghiên cứu Phƣơng pháp chuẩn hóa ảnh MR với điểm