Nghiên cứu một số đặc điểm sinh học và biện pháp kỹ thuật tạo giống cây mun (diospyros mun a chev ex lecomte) ở miền bắc việt nam

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT TRƯỜNG ĐẠI HỌC LÂM NGHIỆP NGÔ VĂN NHƯƠNG NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC VÀ BIỆN PHÁP KỸ THUẬT TẠO GIỐNG CÂY MUN (Diospyros mun A Chev ex Lecomte) Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM LUẬN ÁN TIẾN SĨ LÂM NGHIỆP HÀ NỘI - 2016 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT TRƯỜNG ĐẠI HỌC LÂM NGHIỆP NGÔ VĂN NHƯƠNG NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC VÀ BIỆN PHÁP KỸ THUẬT TẠO GIỐNG CÂY MUN (Diospyros mun A Chev ex Lecomte) Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM CHUYÊN NGÀNH: LÂM SINH MÃ SỐ: 62620205 LUẬN ÁN TIẾN SĨ LÂM NGHIỆP NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS Lê Xuân Trường PGS TS Phạm Đức Tuấn HÀ NỘI- 2016 i LỜI CAM ĐOAN Tôi cam đoan công trình nghiên cứu khoa học tơi Các số liệu, kết nêu Luận án trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Nghiên cứu sinh ThS Ngô Văn Nhương ii LỜI CẢM ƠN Cơng trình hồn thành theo chương trình nghiên cứu sinh nước, hệ quy Trường Đại học Lâm nghiệp Việt Nam Trước hết, tác giả xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc kính trọng đến thầy giáo TS Lê Xuân Trường PGS TS Phạm Đức Tuấn, với tư cách người hướng dẫn dành nhiều thời gian quí báu giúp đỡ tác giả hồn thành luận án Trong q trình thực hồn thành luận án, tác giả cịn nhận quan tâm, tạo điều kiện giúp đỡ tập thể: Trường Đại học Lâm nghiệp Việt Nam; Phòng Đào tạo Sau đại học; Khoa Lâm học; Bộ môn Lâm sinh Trường Đại học Lâm nghiệp; Bộ môn khoa học gỗ- Viện nghiên cứu Công nghiệp rừng; Phòng Phân loại thực nghiệm Đa dạng nguồn Gen Sinh học- Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam; Phòng thí nghiệm Viện Cơng nghệ sinh học Lâm nghiệp; Phịng thí nghiệm đất mơi trường Viện nghiên cứu Sinh thái Môi trường rừng; Bộ môn Kỹ thuật lâm sinh Viện Nghiên cứu Lâm sinh; VQG Cúc Phương- Ninh Bình; KBTTN Ngọc Sơn- Ngổ Lng- Hịa Bình; KBTTN Na Hang- Tuyên Quang, VQG Phong Nha- Kẻ Bàng- Quảng Bình, VQG Núi Chúa- Ninh Thuận, xã Cam Thịnh Đông Cam Thịnh Tây- Thành phố Cam Ranh- Khánh Hịa, Trường Đại học Hoa Lư- Ninh Bình, Sở Khoa học Cơng nghệ Ninh Bình Nhân dịp tác giả bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc trước quan tâm giúp đỡ q báu Xin chân thành cảm ơn PGS.TS Phạm Xn Hồn- Ngun Phó hiệu trưởng Trường Đại học Lâm nghiệp; TS Hà Văn Huân TS Vũ Quang Nam- Viện Công nghệ sinh học Lâm nghiệp; NCS Vũ Đình Duy- Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam; TS Nguyễn Tử Kim, Ths Bùi Hữu Thưởng ThS Vũ Thị Ngoan- Viện nghiên cứu Công nghiệp rừng; TS Phí Hồng Hải- Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam; ThS Ngô Thị Thanh Huệ- Viện nghiên cứu Sinh thái Môi trường rừng; ThS Phan Minh Quang- Viện Nghiên cứu Lâm sinh; Các cá nhân công tác VQG Cúc Phương: ThS Trương Quang Bích; ThS Lê Phương Triều, KS Nguyễn Minh Tường, KS Nguyễn Thị Thủy; Các cán công tác KBTTN Ngọc Sơn- Ngổ Lng: KS Bùi Bình n; KS Nguyễn Bình Định; KS Khổng Văn Quang- KBTTN Na Hang; Các cán công tác VQG Núi Chúa: KS Nguyễn Trọng Huynh, KS Nguyễn Ngọc Hân…đã dành nhiều thời gian công sức giúp đỡ tác giả hoàn thành luận án Cuối tác giả xin gửi lời cảm ơn tới tất bạn bè, đồng nghiệp người thân gia đình động viên giúp đỡ tác giả hoàn thành cơng trình Một lần tác giả xin chân thành cảm ơn Ngô Văn Nhương iii 141 MỤC LỤC MỞ ĐẦU 1 Tính cấp thiết đề tài .1 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài Những đóng góp đề tài Đối tượng nghiên cứu .3 Giới hạn đề tài .3 Chương TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 1.1 Giới thiệu chung Mun 1.2 Giới thiệu hệ gen sử dụng nghiên cứu phân loại phân tử thực vật, số thành tựu nghiên cứu đa dạng di truyền tiến hóa phân tử 1.2.1 Giới thiệu số hệ gen sử dụng nghiên cứu phân loại phân tử thực vật 1.2.2 Một số thành tựu nghiên cứu đa dạng di truyền tiến hóa phân tử 1.3 Trên giới 13 1.3.1 Nghiên cứu kỹ thuật tạo từ hạt 13 1.3.2 Nghiên cứu kỹ thuật gây trồng thân gỗ 14 1.4 Ở Việt Nam 15 1.4.1 Nghiên cứu kỹ thuật tạo từ hạt 15 1.4.2 Nghiên cứu kỹ thuật gây trồng thân gỗ 20 1.4.3 Các nghiên cứu Mun 22 Chương MỤC TIÊU, NỘI DUNG, PHƯƠNG PHÁP VÀ VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 29 2.1 Mục tiêu đề tài 29 2.2 Nội dung nghiên cứu 29 2.2.1 Nghiên cứu số đặc điểm sinh học Mun 29 2.2.2 Nghiên cứu kỹ thuật hạt giống 30 2.2.3 Nghiên cứu kỹ thuật tạo 30 2.2.4 Đề xuất số biện pháp kỹ thuật tạo Mun miền Bắc- Việt Nam 30 2.3 Phương pháp nghiên cứu 30 2.3.1 Phương pháp nghiên cứu chung 30 2.3.2 Các phương pháp nghiên cứu cụ thể 32 iv 142 2.3.3 Khối lượng công việc thực đề tài 49 2.4 Vật liệu nghiên cứu 50 Chương KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN .51 3.1 Một số đặc điểm sinh học Mun 51 3.1.1 Đặc điểm hình thái Mun 51 3.1.2 Tình hình phân bố đặc điểm sinh thái Mun 54 3.1.3 Đặc điểm cấu trúc lâm phần có Mun phân bố 65 3.1.4 Đặc điểm tái sinh tự nhiên Mun 72 3.1.5 Sinh trưởng Mun rừng trồng 74 3.1.6 Đặc điểm vật hậu Mun 76 3.1.7 Cấu tạo gỗ Mun 78 3.1.8 Mối quan hệ di truyền số quần thể Mun Việt Nam 81 3.2 Kết nghiên cứu kỹ thuật hạt giống Mun 95 3.2.1 Một số tiêu gieo ươm hạt Mun 95 3.2.2 Nghiên cứu điều kiện xử lý nảy mầm hạt 96 3.2.3 Nghiên cứu phương pháp bảo quản hạt Mun 97 3.3 Kết nghiên cứu kỹ thuật tạo Mun 98 3.3.1 Ảnh hưởng tỷ lệ che sáng đến sinh trưởng Mun giai đoạn vườn ươm 98 3.3.2 Ảnh hưởng hỗn hợp ruột bầu đến sinh trưởng Mun giai đoạn vườn ươm 109 3.3.3 Ảnh hưởng chế độ tưới nước đến sinh trưởng Mun giai đoạn vườn ươm 114 3.3.4 Ảnh hưởng tuổi xuất vườn đến sinh trưởng Mun rừng trồng 118 3.4 Bước đầu đề xuất biện pháp kỹ thuật tạo Mun miền Bắc- Việt Nam 123 KẾT LUẬN, TỒN TẠI VÀ KIẾN NGHỊ 125 Kết luận 125 Tồn 126 Kiến nghị 127 DANH MỤC CƠNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN……………… 128 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC v1 TT DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Nguyên nghĩa ARN Axít ribonucleic cpDNA Genome lục lạp Cs Cộng CT Công thức CTTT Công thức tổ thành DNA deoxyribonucleic acid D0 Đường kính gốc (cm) D1.3 Đường kính thân vị trí cách mặt đất 1,3m (cm) Dt Đường kính tán (m) 10 Đ- T Hướng Đơng- Tây 11 Hvn Chiều cao vút (m) 12 ITS - rDNA Vùng gen nhân 13 IUCN 14 IV Giá trị quan trọng (%) 15 KBTTN Khu bảo tồn thiên nhiên 16 K20 Hàm lượng ka li tổng số (%) 17 N Hàm lượng đạm tổng số (%) 18 N- B Hướng Nam Bắc 19 OTC Ơ tiêu chuẩn điển hình 20 P205 Hàm lượng lân tổng số (%) 21 TB Tế bào 22 rbcL Vùng gen lục lạp 23 RTN Rừng tự nhiên Liên minh Quốc tế Bảo tồn Thiên nhiên Tài nguyên Thiên nhiên vi 24 V Hệ số biến động (%) 25 VQG Vườn quốc gia 26 VTV Vườn thực vật 27 X Giá trị trung bình vii DANH MỤC CÁC BẢNG Nội dung TT Bảng 3.1 Vị trí địa lý, địa hình kiểu rừng Mun phân bố 3.2 Đặc điểm khí hậu số địa điểm có Mun phân bố 3.3 Thành phần giới phẫu diện đại diện 3.4 Đặc tính hóa học đất có Mun phân bố 3.5 3.6 3.7 3.8 10 11 3.9 3.10 3.11 Quan hệ Mun với loài ưu địa điểm nghiên cứu Một số tiêu sinh trưởng lâm phần có Mun phân bố Khả tái sinh tự nhiên Mun khu vực nghiên cứu Sinh trưởng Mun rừng trồng VQG Cúc Phương sau năm theo dõi Diễn biến pha vật hậu Mun Mật độ, kích thước mạch tia gỗ Mun Khoảng cách di truyền (dưới) mức độ tương đồng di Trang 56 57 60 62 67 71 72 74 77 79 84 12 3.12 13 3.13 truyền (trên) cặp quần thể Mun nghiên cứu Khoảng cách di truyền (dưới) mức độ tương đồng di truyền (trên) cặp quần thể Mun nghiên cứu Khối lượng độ ẩm ban đầu hạt Mun 14 15 16 3.14 3.15 3.16 Thế nảy mầm hạt Mun Khả nảy mầm hạt Mun công thức xử lý Ảnh hưởng phương pháp thời gian bảo quản đến tỷ lệ 96 96 97 17 18 19 3.17 3.18 3.19 nảy mầm hạt Mun Một số tiêu sinh trưởng Mun tỷ lệ che sáng Cấu tạo giải phẫu Mun tỷ lệ che sáng Hàm lượng sắc tố Mun tỷ lệ che sáng 99 105 107 20 3.20 21 3.21 Một số tiêu sinh trưởng Mun công thức hỗn hợp ruột bầu Một số tiêu sinh trưởng Mun công thức 3.22 tưới nước Sinh trưởng Mun sau năm trồng 22 91 95 110 115 120 viii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ TT Biểu Nội dung Trang đồ 3.1 Các pha vật hậu Mun 77 3.2 Tỷ lệ sống Mun công thức che sáng 100 3.3 Chiều cao Mun tỷ lệ che sáng 101 3.4 Đường kính Mun tỷ lệ che sáng 102 3.5 Sinh khối khô Mun tỷ lệ che sáng 103 3.6 Tỷ lệ sống Mun công thức hỗn hợp ruột bầu 111 3.7 Chiều cao Mun công thức hỗn hợp ruột bầu 112 3.8 Đường kính Mun cơng thức hỗn hợp ruột bầu 112 3.9 Sinh khối khô Mun công thức hỗn hợp ruột bầu 113 10 3.10 Tỷ lệ sống Mun công thức tưới nước 116 11 3.11 Chiều cao Mun cơng thức tưới nước 117 12 3.12 Đường kính Mun công thức tưới nước 117 13 3.13 Sinh khối khô Mun công thức tưới nước 118 14 3.14 Tỷ lệ sống Mun sau năm trồng 121 15 3.15 Sinh trưởng chiều cao Mun sau năm trồng 122 16 3.16 Sinh trưởng đường kính Mun sau năm trồng 122 KJ650089 Diospyros mun isolate CTT1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ650089.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ650089 527 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate CTT1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ650089 VERSION KJ650089.1 GI:646118928 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 527) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Le,X.T., Pham,D.T., Ngo,T.M and Hoang,T.T TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 527) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Le,X.T., Pham,D.T., Ngo,T.M and Hoang,T.T TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (01-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 527 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="CTT1" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Cam Thinh Tay social, Cam Ranh city, Khanh Hoa province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 527 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN ccgcgacaaa acaaccgaac accggcgcgg gacgcgccaa ggaaacaaaa cgaaacgaac 61 gagcgcgccc ccgacccccg caagggcggc gacggggcgt cgcgtctttc aaatcgatca 121 aaacgactct cggcaacgga tatctcggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc 181 gatacttggt gtgaattgca gaatcccgtg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc 241 ccgaagccat ccggccgagg gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccctcg 301 ccccgcgccg tcccccaagg ggacgggtgc gcgggcggca gggcggagcc tggccccccg 361 tgcccgcgag ggcgcggtcg gcccaaaaag agggatcccg gtgggagcgg tcacggccgg 421 tggtggttgt caaaccttcg cgtcccggcg agtgcccttt caccgacagg agcgccctcc 481 ctgcgacccc cgagcggcgc ccgcacgcgc cgcccacgac gcgaccc Page KJ650090 Diospyros mun isolate CTT3 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ650090.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ650090 527 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate CTT3 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ650090 VERSION KJ650090.1 GI:646118929 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 527) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Le,X.T., Pham,D.T., Ngo,T.M and Hoang,T.T TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 527) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Le,X.T., Pham,D.T., Ngo,T.M and Hoang,T.T TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (01-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 527 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="CTT3" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Cam Thinh Tay social, Cam Ranh city, Khanh Hoa province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 527 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN ccgcgacaaa acaaccgaac accggcgcgg gacgcgccaa ggaaacaaaa cgaaacgaac 61 gagcgcgccc ccgacccccg caagggcggc gacggggcgt cgcgtctttc aaatcgatca 121 aaacgactct cggcaacgga tatctcggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc 181 gatacttggt gtgaattgca gaatcccgtg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc 241 ccgaagccat ccggccgagg gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccctcg 301 ccccgcgccg tcccccaagg ggacgggtgc gcgggcggca gggcggagcc tggccccccg 361 tgcccgcgag ggcgcggtcg gcccaaaaag agggatcccg gtgggagcgg tcacggccgg 421 tggtggttgt caaaccttcg cgtcccggcg agtgcccttt caccgacagg agcgccctcc 481 ctgcgacccc cgagcggcgc ccgcacgcgc cgcccacgac gcgaccc Page KJ650091 Diospyros mun isolate CTT5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ650091.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ650091 527 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate CTT5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ650091 VERSION KJ650091.1 GI:646118930 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 527) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Le,X.T., Pham,D.T., Ngo,T.M and Hoang,T.T TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 527) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Le,X.T., Pham,D.T., Ngo,T.M and Hoang,T.T TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (01-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 527 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="CTT5" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Cam Thinh Tay social, Cam Ranh city, Khanh Hoa province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 527 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN ccgcgacaaa acaaccgaac accggcgcgg gacgcgccaa ggaaacaaaa cgaaacgaac 61 gagcgcgccc ccgacccccg caagggcggc gacggggcgt cgcgtctttc aaatcgatca 121 aaacgactct cggcaacgga tatctcggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc 181 gatacttggt gtgaattgca gaatcccgtg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc 241 ccgaagccat ccggccgagg gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccctcg 301 ccccgcgccg tcccccaagg ggacgggtgc gcgggcggca gggcggagcc tggccccccg 361 tgcccgcgag ggcgcggtcg gcccaaaaag agggatcccg gtgggagcgg tcacggccgg 421 tggtggttgt caaaccttcg cgtcccggcg agtgcccttt caccgacagg agcgccctcc 481 ctgcgacccc cgagcggcgc ccgcacgcgc cgcccacgac gcgaccc Page KJ653246 Diospyros mun isolate CP1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653246.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653246 650 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate CP1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653246 VERSION KJ653246.1 GI:646117945 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 650 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="CP1" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Cuc Phuong National Park, Ninh Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 650 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgacccc tcccgccggc cgcggagggc 61 gctcggacgc ggcctctcag gcagcgggcg acgcgcgctc tcgcgacgaa caacgaacac 121 cggcgcggga cgcgccaagg aaacgaaacg aaacgaacga gcgcgccccc ggcccgcgta 181 accgcggcga cggggcgtcg cgcctttcga ttcacggaca aaacgactct cggcaacgga 241 tatcttggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca 301 gaatcccgcg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg 361 gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccgcgc cccgcgccgt ccctcggggg 421 acgggcgcgc gggcggcggg gcggaacctg gccccccgtg cccgcgaggg tgcggtcggc 481 ccaaaaagag ggatccccgt ggcagcggtc acggccggtg gtggttgtca aacggcagtt 541 ttcccggcga gcgacccttc acggacggga gtgccccacg cgcgaccctc ggcgagcgac 601 cccgcggggc gccgcccacg acgcgacccc aggtcaggcg ggactacccg Page KJ653247 Diospyros mun isolate CP2 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653247.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653247 650 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate CP2 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653247 VERSION KJ653247.1 GI:646117946 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 650 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="CP2" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Cuc Phuong National Park, Ninh Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 650 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgacccc tcccgccggc cgcggagggc 61 gctcggacgc ggcctctcag gcagcgggcg acgcgcgctc tcgcgacgaa caacgaacac 121 cggcgcggga cgcgccaagg aaacgaaacg aaacgaacga gcgcgccccc ggcccgcgta 181 accgcggcga cggggcgtcg cgcctttcga ttcacggaca aaacgactct cggcaacgga 241 tatcttggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca 301 gaatcccgcg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg 361 gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccgcgc cccgcgccgt ccctcggggg 421 acgggcgcgc gggcggcggg gcggaacctg gccccccgtg cccgcgaggg tgcggtcggc 481 ccaaaaagag ggatccccgt ggcagcggtc acggccggtg gtggttgtca aacggcagtt 541 ttcccggcga gcgacccttc acggacggga gtgccccacg cgcgaccctc ggcgagcgac 601 cccgcggggc gccgcccacg acgcgacccc aggtcaggcg ggactacccg Page KJ653248 Diospyros mun isolate CP5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653248.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653248 650 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate CP5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653248 VERSION KJ653248.1 GI:646117947 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 650 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="CP5" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Cuc Phuong National Park, Ninh Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 650 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgacccc tcccgccggc cgcggagggc 61 gctcggacgc ggcctctcag gcagcgggcg acgcgcgctc tcgcgacgaa caacgaacac 121 cggcgcggga cgcgccaagg aaacgaaacg aaacgaacga gcgcgccccc ggcccgcgta 181 accgcggcga cggggcgtcg cgcctttcga ttcacggaca aaacgactct cggcaacgga 241 tatcttggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca 301 gaatcccgcg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg 361 gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccgcgc cccgcgccgt ccctcggggg 421 acgggcgcgc gggcggcggg gcggaacctg gccccccgtg cccgcgaggg tgcggtcggc 481 ccaaaaagag ggatccccgt ggcagcggtc acggccggtg gtggttgtca aacggcagtt 541 ttcccggcga gcgacccttc acggacggga gtgccccacg cgcgaccctc ggcgagcgac 601 cccgcggggc gccgcccacg acgcgacccc aggtcaggcg ggactacccg Page KJ653249 Diospyros mun isolate NH1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653249.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653249 644 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate NH1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653249 VERSION KJ653249.1 GI:646117948 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 644) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 644) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 644 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="NH1" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Na Hang Nature Reserve, Tuyen Quang province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 644 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg ggcgacccct cccgccggcc gcggagggcg 61 ctcggacgcg gcctttcagg cggcgggcga cgcgccctct cgcgacgaac aacgaacacc 121 ggcgcgggac gcgccaagga aacgaaacga aacgaacgag cgcgcccccg gcccgcgtaa 181 ccgcggcgac ggggcgtcgc gcctttcgat tcacggacaa aacgactctc ggcaacggat 241 atcttggctc tcgcatcgat gaagaacgta gcgaaatgcg atacttggtg tgaattgcag 301 aatcccgcga accatcgagt ctttgaacgc aagttgcgcc cgaagccatc cggccgaggg 361 cacgtctgcc tgggcgtcac gcacgccgtc gccccccgcc ccgcgccttc cctcggggga 421 cggccgcgcg ggcggcgggg cggaacctgg ccccccgtgc ccgcgagggt gcggtcggcc 481 caaaaagagg gatccccgtg ggagcggtca cggccggtgg tggttgtcaa agttttcccg 541 gcgagcgacc cttcacggac gggagtgccc cacgcgcgac gctcggcgag cgacgccgcg 601 gcgcgccgcc cacgacgcga ccccaggtca ggcgggacta cccg Page KJ653250 Diospyros mun isolate NH4 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653250.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653250 644 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate NH4 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653250 VERSION KJ653250.1 GI:646117949 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 644) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 644) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 644 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="NH4" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Na Hang Nature Reserve, Tuyen Quang province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 644 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg ggcgacccct cccgccggcc gcggagggcg 61 ctcggacgcg gcctttcagg cggcgggcga cgcgccctct cgcgacgaac aacgaacacc 121 ggcgcgggac gcgccaagga aacgaaacga aacgaacgag cgcgcccccg gcccgcgtaa 181 ccgcggcgac ggggcgtcgc gcctttcgat tcacggacaa aacgactctc ggcaacggat 241 atcttggctc tcgcatcgat gaagaacgta gcgaaatgcg atacttggtg tgaattgcag 301 aatcccgcga accatcgagt ctttgaacgc aagttgcgcc cgaagccatc cggccgaggg 361 cacgtctgcc tgggcgtcac gcacgccgtc gccccccgcc ccgcgccttc cctcggggga 421 cggccgcgcg ggcggcgggg cggaacctgg ccccccgtgc ccgcgagggt gcggtcggcc 481 caaaaagagg gatccccgtg ggagcggtca cggccggtgg tggttgtcaa agttttcccg 541 gcgagcgacc cttcacggac gggagtgccc cacgcgcgac gctcggcgag cgacgccgcg 601 gcgcgccgcc cacgacgcga ccccaggtca ggcgggacta cccg Page KJ653251 Diospyros mun isolate NH5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653251.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653251 644 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate NH5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653251 VERSION KJ653251.1 GI:646117950 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 644) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 644) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 644 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="NH5" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Na Hang Nature Reserve, Tuyen Quang province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 644 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg ggcgacccct cccgccggcc gcggagggcg 61 ctcggacgcg gcctttcagg cggcgggcga cgcgccctct cgcgacgaac aacgaacacc 121 ggcgcgggac gcgccaagga aacgaaacga aacgaacgag cgcgcccccg gcccgcgtaa 181 ccgcggcgac ggggcgtcgc gcctttcgat tcacggacaa aacgactctc ggcaacggat 241 atcttggctc tcgcatcgat gaagaacgta gcgaaatgcg atacttggtg tgaattgcag 301 aatcccgcga accatcgagt ctttgaacgc aagttgcgcc cgaagccatc cggccgaggg 361 cacgtctgcc tgggcgtcac gcacgccgtc gccccccgcc ccgcgccttc cctcggggga 421 cggccgcgcg ggcggcgggg cggaacctgg ccccccgtgc ccgcgagggt gcggtcggcc 481 caaaaagagg gatccccgtg ggagcggtca cggccggtgg tggttgtcaa agttttcccg 541 gcgagcgacc cttcacggac gggagtgccc cacgcgcgac gctcggcgag cgacgccgcg 601 gcgcgccgcc cacgacgcga ccccaggtca ggcgggacta cccg Page KJ653252 Diospyros mun isolate NS1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653252.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653252 650 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate NS1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653252 VERSION KJ653252.1 GI:646117951 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 650 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="NS1" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Ngoc Son Nature Reverse, Hoa Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 650 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgacccc tcccgccggc cgcggagggc 61 gctcggacgc ggcctctcag gcagcgggcg acgcgcgctc tcgcgacgaa caacgaacac 121 cggcgcggga cgcgccaagg aaacgaaacg aaacgaacga gcgcgccccc ggcccgcgta 181 accgcggcga cggggcgtcg cgcctttcga ttcacggaca aaacgactct cggcaacgga 241 tatcttggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca 301 gaatcccgcg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg 361 gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccccgc cccgcgccgt ccctcggggg 421 acgggcgcgc gggcggcggg gcggaacctg gccccccgtg cccgcgaggg tgcggtcggc 481 ccaaaaagag ggatccccgt ggcagcggtc acggccggtg gtggttgtca aacggcagtt 541 ttcccggcga gcgacccttc acggacggga gtgccccacg cgcgaccctc ggcgagcgac 601 cccgcggggc gccgcccacg acgcgacccc aggtcaggcg ggactacccg Page KJ653253 Diospyros mun isolate NS4 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653253.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653253 650 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate NS4 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653253 VERSION KJ653253.1 GI:646117952 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 650 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="NS4" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Ngoc Son Nature Reverse, Hoa Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 650 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgacccc tcccgccggc cgcggagggc 61 gctcggacgc ggcctctcag gcagcgggcg acgcgcgctc tcgcgacgaa caacgaacac 121 cggcgcggga cgcgccaagg aaacgaaacg aaacgaacga gcgcgccccc ggcccgcgta 181 accgcggcga cggggcgtcg cgcctttcga ttcacggaca aaacgactct cggcaacgga 241 tatcttggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca 301 gaatcccgcg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg 361 gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccccgc cccgcgccgt ccctcggggg 421 acgggcgcgc gggcggcggg gcggaacctg gccccccgtg cccgcgaggg tgcggtcggc 481 ccaaaaagag ggatccccgt ggcagcggtc acggccggtg gtggttgtca aacggcagtt 541 ttcccggcga gcgacccttc acggacggga gtgccccacg cgcgaccctc ggcgagcgac 601 cccgcggggc gccgcccacg acgcgacccc aggtcaggcg ggactacccg Page KJ653254 Diospyros mun isolate NS6 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653254.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653254 650 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate NS6 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653254 VERSION KJ653254.1 GI:646117953 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 650) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 650 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="NS6" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: Ngoc Son Nature Reverse, Hoa Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 650 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgacccc tcccgccggc cgcggagggc 61 gctcggacgc ggcctctcag gcagcgggcg acgcgcgctc tcgcgacgaa caacgaacac 121 cggcgcggga cgcgccaagg aaacgaaacg aaacgaacga gcgcgccccc ggcccgcgta 181 accgcggcga cggggcgtcg cgcctttcga ttcacggaca aaacgactct cggcaacgga 241 tatcttggct ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca 301 gaatcccgcg aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg 361 gcacgtctgc ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccccgc cccgcgccgt ccctcggggg 421 acgggcgcgc gggcggcggg gcggaacctg gccccccgtg cccgcgaggg tgcggtcggc 481 ccaaaaagag ggatccccgt ggcagcggtc acggccggtg gtggttgtca aacggcagtt 541 ttcccggcga gcgacccttc acggacggga gtgccccacg cgcgaccctc ggcgagcgac 601 cccgcggggc gccgcccacg acgcgacccc aggtcaggcg ggactacccg Page KJ653255 Diospyros mun isolate PN1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653255.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653255 641 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate PN1 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653255 VERSION KJ653255.1 GI:646117954 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 641) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 641) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 641 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="PN1" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: National Park Phong Nha-Ke Bang, Quang Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 641 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgaccct tcccgccgcc cgcggggggt 61 cgcacgcggc gtccgacctt cggcgggccc cgcgcccccc cgcgacgaac aacgaacacc 121 ggcgcaggac gcgccaagga aacgaaacga acgagcgcgc ccccgcccgc gtaacggggg 181 cgacggggcg acgcctcttt cgcttacgca aaacgactct cggcaacgga tatcttggct 241 ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca gaatcccgtg 301 aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg gcacgtctgc 361 ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccccgc cccgcccgcg tcgccccccc cgggggacgg 421 gcgcgcgggc ggggcggggc ggaacttggc cccccgtgcc cgcgagggcg cggtcggccc 481 aaaaagaggg atcccggtgg gagcggtcac ggccggtggt ggttgtcaac cttcgcgtcc 541 cggcgagtgc cccctcaccg cgggagtgcc ccccgccccc cggcgagcga cgccccgggg 601 cgccgcccac gacgcgaccc caggtcaggc gggactaccc g Page KJ653256 Diospyros mun isolate PN3 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653256.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653256 641 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate PN3 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653256 VERSION KJ653256.1 GI:646117955 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 641) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 641) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 641 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="PN3" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: National Park Phong Nha-Ke Bang, Quang Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 641 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgaccct tcccgccgcc cgcggggggt 61 cgcacgcggc gtccgacctt cggcgggccc cgcgcccccc cgcgacgaac aacgaacacc 121 ggcgcaggac gcgccaagga aacgaaacga acgagcgcgc ccccgcccgc gtaacggggg 181 cgacggggcg acgcctcttt cgcttacgca aaacgactct cggcaacgga tatcttggct 241 ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca gaatcccgtg 301 aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg gcacgtctgc 361 ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccccgc cccgcccgcg tcgccccccc cgggggacgg 421 gcgcgcgggc ggggcggggc ggaacttggc cccccgtgcc cgcgagggcg cggtcggccc 481 aaaaagaggg atcccggtgg gagcggtcac ggccggtggt ggttgtcaac cttcgcgtcc 541 cggcgagtgc cccctcaccg cgggagtgcc ccccgccccc cggcgagcga cgccccgggg 601 cgccgcccac gacgcgaccc caggtcaggc gggactaccc g Page KJ653257 Diospyros mun isolate PN5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence GenBank: KJ653257.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS KJ653257 641 bp DNA linear PLN 09-JUN-2014 DEFINITION Diospyros mun isolate PN5 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and internal transcribed spacer 2, partial sequence ACCESSION KJ653257 VERSION KJ653257.1 GI:646117956 KEYWORDS SOURCE Diospyros mun ORGANISM Diospyros mun Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; Ericales; Ebenaceae; Diospyros REFERENCE (bases to 641) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Molecular characterization of the species Diospyros mun a.chev ex lecomte collected in Viet Nam based on rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase) and ITS-rDNA sequences JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 641) AUTHORS Vu,D.D., Ngo,V.N., Phan,M.Q., Hoang,T.T., Le,X.T., Pham,D.T and Ngo,T.M TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (03-APR-2014) Experimental Taxonomy and Genetics Diversity, Vietnam National Museum of Nature, Vietnam Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Hanoi, Vietnam COMMENT ##Assembly-Data-START## Assembly Method :: BioEdid v version 7.1; Mega v version 6.0; ClustalX v version 1.7; Chromas pro v version 1.7.4 Assembly Name :: BioEdid Coverage :: version 7.1 Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 641 /organism="Diospyros mun" /mol_type="genomic DNA" /isolate="PN5" /db_xref="taxon:1501507" /country="Viet Nam: National Park Phong Nha-Ke Bang, Quang Binh province" /note="PCR_primers=fwd_name: ITS1, rev_name: ITS4" misc_RNA 641 /product="internal transcribed spacer 2" ORIGIN cgcgaacccg taactcccca cgccgggagg gggcgaccct tcccgccgcc cgcggggggt 61 cgcacgcggc gtccgacctt cggcgggccc cgcgcccccc cgcgacgaac aacgaacacc 121 ggcgcaggac gcgccaagga aacgaaacga acgagcgcgc ccccgcccgc gtaacggggg 181 cgacggggcg acgcctcttt cgcttacgca aaacgactct cggcaacgga tatcttggct 241 ctcgcatcga tgaagaacgt agcgaaatgc gatacttggt gtgaattgca gaatcccgtg 301 aaccatcgag tctttgaacg caagttgcgc ccgaagccat ccggccgagg gcacgtctgc 361 ctgggcgtca cgcacgccgt cgccccccgc cccgcccgcg tcgccccccc cgggggacgg 421 gcgcgcgggc ggggcggggc ggaacttggc cccccgtgcc cgcgagggcg cggtcggccc 481 aaaaagaggg atcccggtgg gagcggtcac ggccggtggt ggttgtcaac cttcgcgtcc 541 cggcgagtgc cccctcaccg cgggagtgcc ccccgccccc cggcgagcga cgccccgggg 601 cgccgcccac gacgcgaccc caggtcaggc gggactaccc g Page ... giai đoạn vườn ươm - Đề xuất số biện pháp kỹ thuật tạo Mun miền Bắc- Việt Nam 2.2 Nội dung nghiên cứu Để nghiên cứu số đặc điểm sinh học biện pháp kỹ thuật tạo giống Mun (Diospyros mun A. Chev ex. .. ch? ?a có hướng dẫn kỹ thuật tạo kỹ thuật trồng Mun nên ch? ?a đủ sở khoa học để xây dựng giải pháp kỹ thuật bảo tồn có hiệu Vì vậy, ? ?Nghiên cứu số đặc điểm sinh học biện pháp kỹ thuật tạo giống Mun. .. pháp kỹ thuật tạo giống Mun (Diospyros mun A. Chev ex Lecomte) miền Bắc- Việt Nam nhằm cung cấp sở khoa học cho công tác bảo tồn va phát triển loài Mun Việt Nam Mục tiêu cụ thể - Xác định số đặc điểm