Mục lục

  • Tomtat_resize2_bia

    • DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN

    • Tomtat_resize2

      • Chương 1 BÀI TOÁN BOOTSTRAP CÂY TIẾN HÓA

        • 1.1 Một số khái niệm cơ bản trong tiến hóa phân tử

          • 1.1.1 Thông tin di truyền

          • 1.1.2 Sắp hàng đa chuỗi

          • 1.1.3 Cây tiến hóa

          • 1.1.4 Xây dựng cây tiến hóa

            • 1.1.4.1 Tiêu chuẩn tiết kiệm nhất (maximum parsimony – MP)

            • 1.1.4.2 Tiêu chuẩn hợp lý nhất (maximum likelihood – ML)

            • 1.1.4.3 Một số kĩ thuật biến đổi cục bộ trên cây dùng trong xây dựng cây tiến hóa

            • 1.1.5 Mô hình tiến hóa

              • 1.1.5.1 Ma trận tốc độ biến đổi tức thì

              • 1.1.5.2 Một số mô hình biến đổi nucleotide

              • 1.1.5.3 Tính không đồng nhất của tốc độ biến đổi giữa các vị trí trên trình tự

              • 1.1.6 Giới thiệu phương pháp bootstrap trong thống kê

              • 1.2 Bài toán bootstrap cây tiến hóa

                • 1.2.1 Phát biểu bài toán

                • 1.2.2 Các tiêu chí đánh giá một phương pháp bootstrap cây tiến hóa

                  • 1.2.2.1 Đánh giá thời gian chạy

                  • 1.2.2.2 Đánh giá độ chính xác

                  • 1.2.2.3 Các tiêu chí khác

                  • 1.3 Các nghiên cứu bootstrap cây tiến hóa

                  • Chương 2 PHƯƠNG PHÁP UFBOOT2 CHO BÀI TOÁN BOOTSTRAP CÂY TIẾN HÓA THEO TIÊU CHUẨN HỢP LÝ NHẤT

                    • 2.1 Bootstrap cây tiến hóa theo tiêu chuẩn hợp lý nhất

                    • 2.2 Xấp xỉ nhanh bootstrap cây tiến hóa theo tiêu chuẩn ML: Thuật toán UFBoot

                      • 2.2.1 Tóm tắt ý tưởng

                      • 2.2.2 Công thức RELL

                      • 2.2.3 Giả mã của thuật toán UFBoot

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan