Summary of Medical thesis: Study on clinical, paraclinical features, genotype of pneumocystis jirovecii causing pneumonia in HIV/AIDS patients

Describe the clinical and paraclinical features of PJ pneumonia in HIV/AIDS patients. Determination of PJ genotype and its correlation with clinical and paraclinical features of PJ pneumonia in HIV/AIDS patients.

patients  29 with   thrombocytopenia   is   not   actually   proportional   to   the   number   of  patients presenting with infection, so it is difficult to use this indicator to  predict the infection pathology. Thus, the increase and decrease of blood  indicators reflect the status and degree of manifestation of pneumonia in  patients,   comparing   with   the   results   of   this   study   with   domestic   and  foreign studies showing the similarity certain of the hematological test  indicators Biochemical tests of patients showed that the indicators Na +, Ca+, Cl­  showed   no   increase,   some   patients   showed   signs   of   reduction   Other  indicators   such   as   urea,   creatinine,   albumin,   %PT,   fibrinogen   did   not  show any abnormalities in HIV patients with PJ pneumonia in this study.  However, we found an increase in liver enzyme activity index of most  patients, which indicates that PJ's pulmonary infection is related to the  patient's liver cell damage. In this study we recorded more than 80% of  patients presenting with liver injury, but the question is whether lesions of  liver lesions are really pneumonia caused by PJ etiology or co­infections  such as tuberculosis, bacteria, viruses, and other fungi are either caused by  medicines such as antiviral drugs, antibiotics, anti­tuberculosis drugs or  due to HIV disease Immunological indices C­reactive protein (CRP) is produced by the liver and released into  the   bloodstream   when   an   infection   occurs,   CPR   has   the   ability   to  specifically bind to polysaccharide of bacteria, fungi and parasites, thus  the   concentration   of   CRP   usually   rises   when   the   body   has   severe  infections. In this study only four patients had normal CRP levels, the  remaining cases showed an increase in CRP, even many cases had a very  high increase. This is entirely consistent with the patient's infection status,  however in the study all 31 patients were infected CD4 cells are produced from lymphocyte­derived stem cells (B and  T   lymphocytes),   CD4   cells   are   the   most   important   subgroup   of   T  lymphocytes with the main function of identifying foreign antigens and  regulating reconstitutes the body's immune system. HIV after entering the  body   will   directly   attack   CD4   cells,   thereby   destroying   this   cell   and  reducing the amount of CD4 in the blood significantly. In this study, we  found that most patients had very low CD4 T­cell losses, especially in  those without or interrupting antiretroviral therapy, so these patients had  opportunistic infections is completely understandable 30 Lung injury  PJ usually resides in the alveoli and spreads to the alveoli, causing an  increase in alveolar capillary permeability, causing the alveoli to flood  with secretions, in severe cases, there may be interstitial edema, fibrosis.  Therefore, PJ cases of pneumonia were recorded with lung injury and X­ ray is one of the solutions to help assess the extent of lung injury of the  patient. In this study the majority of patients had images of lung lesions  and  predominantly localized dissemination,  a small number of patients  with scattered lesions or on one side of the lung. On X­ray film, it is  shown that most patients have blurred vision, opaque glass and lattice in  the lungs, Lung injury signs of opaque glass are quite typical and high  percentage   in   PJ   pneumonia   patients   Several   patients   have   pleural  effusion and pneumothorax, no cases of pneumothorax and lung abscess,  few have solid lung lobes Of the 31 cases we diagnosed with PJ positive, only less than 40% of  cases were diagnosed with bronchial lesions, suggesting that PJ infection  can cause varying degrees of injury. Depending on many factors such as  PJ's genotype, the number of  PJ multiplies and especially the  patient's  location. There are patients with atopic lesions and the number of PJ is not  high, the possibility of bronchial injury is not high, and conversely, there  are patients with atopic or injured plus the number of cells, the more PJ  the risk of injury is very high 4.2  Molecular   features   of   PJ   and   the   correlation   with   clinical,  paraclinical PJ pneumonia in HIV/AIDS patients  4.2.1. Molecular features of PJ With   the   development   of   molecular   biology   techniques,   including  gene sequencing techniques, many variants ­ the genotype of PJ has been  found   in   PJ   outbreaks   Therefore,   understanding   the   molecular  epidemiological features as well as the genetic connection of pathogenic  PJ   strains   in   humans   through   the   application   of   molecular   biology  techniques   is   currently   a   new   and   promising   direction   in   research.  Research PJ as well as their pathogenic features. So far, many methods of  identifying PJ variants have been developed, in which methods using a  single   locus   often     not   elucidate   the   genetic   information   of   PJ.  Therefore,  the  multilocus  sequence typing method is  considered as the  golden method in determining the genetic diversity of PJ 31 Results of sequence analysis of 31 samples showed that the genes of  ITS1, mt26S, 26S  appeared many different variants, while the genes of  CYB,   DHFR,   DHPS  and  β­TUB  showed   no   change   in   nucleotide  sequence. There was only one strain with a mutation in the  SOD  gene.  Published data from previous studies show that the variation of ITS1 gene  is based on eight mutation points, including nucleotide positions 2, 8­10,  11, 17, 22, 46­47, 54­62, 71­72 and 111­113. In this study we also did not  detect co­infection with many PJ strains in one specimen. The specimens  contain   opportunistic   PJs   in   HIV/AIDS   in   Vietnam   have   genetic  differences   to   the   PJ   strains   distributed   in   many   geographical   regions  around the world. The discovery of new genotypes on ITS1, mt26S, 26S,  SOD  locus in pathogenic PJ specimens in this study is very interesting  because these genotypes have never been published in previous studies.  This is probably the difference in the genetic features of PJ distributed in  Vietnam, but it can also be seen that a proportion of genotypes in these  locus  are  similar to  the  PJ  strains  distributed in  Portugal,  Switzerland,  Spain and France. Make comparisons and find that they have little genetic  relationship with the PJ strains in other geographical areas. This raises the  question of whether the PJ strains distributed in Vietnam are ancestral PJ  species in this region or were they imported from neighboring regions  long time ago.  4.2.2. The correlation with clinical, paraclinical The correlation between PJ's genotype and patient's fever features By   analyzing   the   genotypic   features   of   the   PJ   strains   with   fever  features, we found that patients with the PJ strain of genotype  26S  1 or  ITS  A   genotype   all   had   high   fever   expression   Although   we   used  statistical methods to calculate the OR, 95% CI and P indices, due to the  small sample size (31 strains) that were distributed in many criteria, we  could not calculate the indices. However, the disparity distribution of the  proportion   of   patients   with   fever   corresponding   to   the   rate   of   strains  carrying genotype 26S 1 and ITS A genotype also showed that this could  be a marker for diagnosis and prognosis number of patients through PJ's  genotypic analysis The correlation between PJ infection, coinfection with lung injury Comparing   fever   data   with   molecular   features   of   pathogenic   PJ  strains,  analytical  data  from  the  results  showed that  of  31  cases  of  PJ  32 infection, 27 cases (accounting for 87.1%) had lung lesions. Thus, most of  the infections with PJ etiology cause pneumonia all show signs of lung  injury. The data show that PJ infection actually causes lung injury, the  location   of   lesions   is   mainly   diffuse,   most   of   the   lesions   are   blurred  nodules,   opaque   glasses,   less   pleural   effusion   and   lung   solidification.  These are significant data and are effective prognostic factors that give  clinicians more information to evaluate and timely treatment solutions to  help reduce the risk of harm to health and the lives of patients, especially  those infected with HIV/AIDS are often immunocompromised The correlation between PJ genotype and CD4 load Regarding the the correlation between the number of CD4 cells and  the genotype of PJ, the data showing that the sharp decline in CD4 cells  (less than 100 cells/ml) is also largely related to the ITS A genotypes and  the genotype 26S 1. The data in this study shows that CD4 decline occurs  very early, possibly in the first 6 months of the disease, but the time a  patient is found to be infected with HIV is counted as a new case, so the  timing   may   not   be   very   accurate   because   the   patient   may   have   been  infected with the virus for a long time but not yet detected. Therefore, it is  possible to estimate the duration of a patient's viral infection through the  degree   of   CD4   cell   decline,   but   this   calculation   is   also   affected   by   a  number of factors such as patient baseline, amount of virus infection. In  addition, the data also showed that the higher the viral load, the greater  the degree of CD4 cell decline CONCLUSION Clinical and paraclinical features of PJ pneumonia in HIV/ AIDS  patients 1.1 Clinical features: ­ Patients with HIV/AIDS accquired PJ pneumonia have clinical features  mainly shortness of breath 51.6%, fever 87.1% and cough (71%) ­   Fever   temperature:   Average:   38.9   ±   0.9oC;   the   highest   temperature:  41.0oC; lowest temperature: 37.5oC ­ Time fever end after admission: ≤ 7 days (22.2%), 8 ­ 21 days (51.8%),  > 21 days (25.9%) ­   Respiratory   condition:   cyanosis   (42%),  Respiratory   distress   grade  I  (48.4%), Respiratory distress grade II (38.7%) ­ Lung condition: Rale (45.2%); rale type: fine (9.7%), coarse (16.1%),  33 fine + coarse + rhonchus (19.3%).  Paraclinical features ­ 93.5% of patients had CD4 cell count